Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07469
• Subject: XM_006539311.3
• Aligned Length: 1188
• Identities: 932
• Gaps: 244

Alignment

Query    1  MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGR  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGR  74

Query   75  SQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLP  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct   75  SQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNTSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGE----  144

Query  149  GKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMV  222
                                                                                      
Sbjct  145  --------------------------------------------------------------------------  144

Query  223  EYVLSSSPGDSCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFS  296
                                                                                      
Sbjct  145  --------------------------------------------------------------------------  144

Query  297  RTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVD  370
                                                                                      
Sbjct  145  --------------------------------------------------------------------------  144

Query  371  SAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAG  444
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  ----------------LFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAG  202

Query  445  LAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQN  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  LAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSATQQSAPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQN  276

Query  519  QQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSS  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  QQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSS  350

Query  593  AAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSSLFSQGSA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  351  AAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPSNNLASSSFYGNNSLSSNSQSSSLFSQGSA  424

Query  667  QPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLTPIGHSFYNGLSFSSS  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.|||
Sbjct  425  QPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLAPIGHSFYSSLSYSSS  498

Query  741  PGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSSTLFSS  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  PGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSSTLFSS  572

Query  815  SRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  573  SRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATAAERQLVFNEILQA  646

Query  889  AYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQ--NEMVRELDGH  960
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
Sbjct  647  AYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSHEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQVINEMVRELDGH  720

Query  961  VLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTE  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  VLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTE  794

Query 1035  QLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGP  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  QLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGP  868

Query 1109  HSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPP  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  869  HSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPP  942

Query 1183  NGII  1186
            ||||
Sbjct  943  NGII  946