Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07469
- Subject:
- XM_006539312.3
- Aligned Length:
- 3588
- Identities:
- 2503
- Gaps:
- 882
Alignment
Query 1 ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGGACTCACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCTATAGGAGTTGCAGGCCGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGGAGGCGGCTATAATAATAGCAAACATCGATGGCCTACTGGGGATAACATTCATGCAGAACATCAGGTGCGTT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CCATGGATGAACTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAGGGAAGAGCGATGGGAGAGCAGCTCTTGCCA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCG 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTT 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGATCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTG 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGATTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGATGCAGACAG 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 TGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGG 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 AGGGTGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTACCAG----TGC---AGAATGGGATTG--ATGCAGACGTCAAA 879
|||.|||.|.|| ||| .||| ||||..| ||| |.||
Sbjct 1 ------------------------ATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAA-GGGAGAGCTATG--GGCG----- 42
Query 880 GATTTTAGCCGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGG 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 43 ------AGCCGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGG 110
Query 954 TTCTGAGGGCTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCC 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 111 TTCTGAGGGCTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCC 184
Query 1028 AGAGTGTCCCCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTTCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTA 1101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185 AGAGTGTCCCCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTGCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTA 258
Query 1102 CCTGTGGACTCAGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTGTTCCAAAGACCTAA 1175
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 259 CCTGTGGACTCTGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTATTCCAAAGACCCAA 332
Query 1176 TGCGCTTGCTGTCCAGCAGTTGACAGCTGCTCAGCAGCAGCAGTATGCACTGGCAGCTGCTCATCAGCCGCACA 1249
|||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 333 TGCACTTGCTGTTCAGCAGTTGACAGCTGCCCAGCAGCAGCAGTATGCACTTGCAGCAGCCCACCAGCCTCACA 406
Query 1250 TC---------------GGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAATCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCA 1308
|| |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 407 TCGGTATGTTTCCAGCAGGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAACCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCA 480
Query 1309 GGGACGGACCCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTAGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAGTATTA 1382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 481 GGGACGGACCCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTCGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAATATTA 554
Query 1383 TGGAGTTACTCCCTGGGGAGTCTACCCTGCCAGTCTTTTCCAGCAGCAAGCTGCCGCTGCCGCTGCAGCAACTA 1456
||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 555 TGGAGTCACGCCATGGGGTGTCTACCCTGCCAGTCTCTTCCAGCAGCAGGCAGCTGCAGCTGCAGCAGCTACAA 628
Query 1457 ATTCAGCTAATCAACAGACCACCCCACAGGCTCAGCAAGGACAGCAGCAGGTTCTCCGTGGAGGAGCCAGCCAA 1530
|.||.||||.|||.||||.|.|.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 629 ACTCTGCTACTCAGCAGAGCGCTCCGCAGGCCCAGCAGGGACAGCAGCAGGTTCTTCGTGGAGGAGCTAGCCAA 702
Query 1531 CGTCCTTTGACCCCAAACCAGAACCAGCAGGGACAGCAAACGGATCCCCTTGTGGCAGCTGCAGCAGTGAATTC 1604
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 703 CGTCCTTTGACCCCAAATCAGAACCAGCAGGGACAACAAACAGATCCCCTTGTAGCAGCTGCAGCAGTGAATTC 776
Query 1605 TGCCCTTGCATTTGGACAAGGTCTGGCAGCAGGCATGCCAGGTTATCCGGTGTTGGCTCCTGCTGCTTACTATG 1678
|||.|||||.|||||||||||..||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 777 TGCTCTTGCCTTTGGACAAGGATTGGCTGCAGGTATGCCAGGTTATCCAGTCTTGGCACCTGCTGCTTACTATG 850
Query 1679 ACCAAACTGGTGCCCTTGTAGTGAATGCAGGCGCGAGAAATGGTCTTGGAGCTCCTGTTCGACTTGTAGCTCCT 1752
|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.
Sbjct 851 ACCAAACTGGTGCCCTTGTGGTGAATGCAGGGGCAAGAAATGGCCTCGGAGCTCCAGTCCGGCTTGTTGCTCCA 924
Query 1753 GCCCCAGTCATCATTAGTTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCAGCCGCAGCTTCAGCAAATGGAGCAGC 1826
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 925 GCCCCAGTCATCATTAGCTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCGGCTGCAGCGTCAGCAAACGGAGCAGC 998
Query 1827 TGGTGGTCTTGCTGGAACAACAAATGGACCATTTCGCCCTTTAGGAACACAGCAGCCTCAGCCCCAGCCCCAGC 1900
||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 999 TGGTGGTCTTGCCGGAACTACAAATGGACCATTTCGACCTTTAGGCACCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCCTCAGC 1072
Query 1901 AGCAGCCCAATAACAACCTGGCATCCAGTTCTTTCTACGGCAACAACTCTCTGAACAGCAATTCACAGAGCAGC 1974
|||||||||.||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||.|||||||||
Sbjct 1073 AGCAGCCCAGTAACAATCTGGCTTCCAGCTCTTTCTATGGCAACAACTCTCTGAGCAGTAACTCCCAGAGCAGC 1146
Query 1975 TCCCTCTTCTCCCAGGGCTCTGCCCAGCCTGCCAACACATCCTTGGGATTCGGAAGTAGCAGTTCTCTCGGCGC 2048
|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||
Sbjct 1147 TCCCTCTTCTCTCAGGGCTCTGCACAGCCTGCCAACACGTCCTTGGGATTCGGAAGCAGCAGTTCCCTTGGTGC 1220
Query 2049 CACCCTGGGATCCGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTG 2122
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1221 CACCCTGGGATCGGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTG 1294
Query 2123 ACTCCCTGACTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGACCCCCATTGGACACAGTTTTTAT 2196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295 ACTCCCTGACTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGGCCCCCATTGGACACAGTTTTTAT 1368
Query 2197 AACGGCCTTAGCTTTTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACA 2270
|.|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 AGCAGCCTTAGCTATTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACA 1442
Query 2271 GACACCACCTCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACGAACGGCAGTG 2344
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1443 GACACCACCTCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACAAACGGCAGTG 1516
Query 2345 GAAGATACATCTCTGCTGCTCCAGGCGCTGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGCGCCTCCAGCCTCTTCAGC 2418
||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1517 GAAGATACATCTCTGCTGCTCCCGGTGCCGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGTGCCTCCAGCCTTTTCAGC 1590
Query 2419 CCGAGCAGCACTCTTTTCTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTCATGCCTTCTGGCAGGAGCAG 2492
||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1591 CCCAGCAGCACCCTTTTTTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTTATGCCCTCTGGCAGGAGCAG 1664
Query 2493 GCTTTTGGAAGATTTTCGAAACAACCGGTACCCCAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGACATATAATGGAAT 2566
.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1665 ACTTCTGGAAGATTTTCGAAACAACCGGTACCCTAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGGCATATAATGGAAT 1738
Query 2567 TTTCCCAAGACCAGCATGGGTCCAGATTCATTCAGCTGAAACTGGAGCGTGCCACACCAGCTGAGCGCCAGCTT 2640
||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1739 TTTCTCAAGACCAGCATGGCTCTAGATTCATTCAGCTGAAACTAGAGCGTGCCACAGCAGCTGAGCGCCAGCTT 1812
Query 2641 GTCTTCAATGAAATCCTCCAGGCTGCCTACCAACTCATGGTGGATGTGTTTGGTAATTACGTCATTCAGAAGTT 2714
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1813 GTCTTCAATGAAATCCTCCAGGCTGCGTACCAACTTATGGTGGATGTGTTTGGAAATTACGTCATTCAGAAGTT 1886
Query 2715 CTTTGAATTTGGCAGTCTTGAACAGAAGCTGGCTTTGGCAGAACGGATTCGAGGCCACGTCCTGTCATTGGCAC 2788
.||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1887 TTTTGAATTTGGCAGTCATGAACAGAAGCTGGCTCTGGCTGAACGGATTCGAGGCCATGTCCTATCATTGGCAC 1960
Query 2789 TACAGATGTATGGCTGCCGTGTTATCCAGAAAGCTCTTGAGTTTATTCCTTCAGACCAGCAG------AATGAG 2856
|.||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||| ||.|||
Sbjct 1961 TGCAGATGTACGGCTGCCGAGTCATCCAGAAAGCTTTGGAGTTTATTCCCTCAGACCAGCAGGTAATTAACGAG 2034
Query 2857 ATGGTTCGGGAACTAGATGGCCATGTCTTGAAGTGTGTGAAAGATCAGAATGGCAATCACGTGGTTCAGAAATG 2930
|||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 2035 ATGGTGCGGGAGCTAGATGGCCATGTCCTGAAGTGTGTGAAAGACCAGAACGGCAACCATGTGGTTCAGAAGTG 2108
Query 2931 CATTGAATGTGTACAGCCCCAGTCTTTGCAATTTATCATCGATGCGTTTAAGGGACAGGTATTTGCCTTATCCA 3004
||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct 2109 CATTGAGTGTGTACAGCCCCAGTCTTTGCAGTTTATCATCGATGCATTCAAGGGGCAGGTGTTTGCTTTGTCTA 2182
Query 3005 CACATCCTTATGGCTGCCGAGTGATTCAGAGAATCCTGGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACACTCCCTATTTTA 3078
|.||.||.||.|||||..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|.
Sbjct 2183 CGCACCCGTACGGCTGTAGGGTGATCCAGAGGATCCTAGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACCCTCCCCATCCTG 2256
Query 3079 GAGGAGCTTCACCAGCACACAGAGCAGCTTGTACAGGATCAATATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGA 3152
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2257 GAGGAGCTTCACCAGCACACAGAGCAGCTTGTGCAGGATCAGTATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGA 2330
Query 3153 GCACGGTCGTCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAAATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACA 3226
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2331 GCATGGTCGTCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAGATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACA 2404
Query 3227 AATTTGCAAGCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACGGAGCGCGCTGTGCTCATCGATGAG 3300
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 2405 AGTTTGCAAGCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACAGAGCGTGCTGTGCTCATTGATGAG 2478
Query 3301 GTGTGCACCATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGACCAGTATGCCAACTACGTGGT 3374
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2479 GTGTGCACCATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGATCAGTATGCTAACTATGTGGT 2552
Query 3375 CCAGAAGATGATTGACGTGGCGGAGCCAGGCCAGCGGAAGATCGTCATGCATAAGATCCGGCCCCACATCGCAA 3448
||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 2553 CCAGAAGATGATCGATGTGGCTGAGCCGGGTCAGCGGAAGATTGTCATGCACAAGATCCGGCCACACATTGCGA 2626
Query 3449 CTCTTCGTAAGTACACCTATGGCAAGCACATTCTGGCCAAGCTGGAGAAGTACTACATGAAGAACGGTGTTGAC 3522
|.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 2627 CGCTTCGAAAGTACACCTATGGCAAGCACATCCTGGCCAAGCTCGAGAAGTACTACATGAAGAATGGCGTGGAC 2700
Query 3523 TTAGGGCCCATCTGTGGCCCCCCTAATGGTATCATC 3558
||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2701 TTGGGGCCCATTTGTGGTCCCCCTAATGGTATCATC 2736
