Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07469
- Subject:
- XM_006539314.3
- Aligned Length:
- 3589
- Identities:
- 2258
- Gaps:
- 1127
Alignment
Query 1 ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGGACTCACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCTATAGGAGTTGCAGGCCGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGGAGGCGGCTATAATAATAGCAAACATCGATGGCCTACTGGGGATAACATTCATGCAGAACATCAGGTGCGTT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CCATGGATGAACTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAGGGAAGAGCGATGGGAGAGCAGCTCTTGCCA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCG 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTT 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGATCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTG 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGATTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGATGCAGACAG 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 TGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGG 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 AGGGTGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTACCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAGATTTTAGC 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 CGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTTCTGAGGG 962
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 963 CTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTGTCC 1036
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1037 CCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGC---ATGGAGCCTCTTCAGTT------TGATTATTCAGGCACGCAGGTA 1101
||||.|| || ||||| |.|.|| ||||| ||||.|||| |.
Sbjct 1 -----------ATGGTAC------GCTCTATGGA------TGAATTGAATCATGATT-TTCAAGCAC-----TT 45
Query 1102 CCTGTGGACTCAGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAAC-AGCTGTTCCAAAGACCTA 1174
.||.|||| || |.|| |.||.|||| | ||||.|||||||||||.|
Sbjct 46 GCTCTGGA---AG--GGAG-AGCTATGGG-------------------------CGAGCTATTCCAAAGACCCA 88
Query 1175 ATGCGCTTGCTGTCCAGCAGTTGACAGCTGCTCAGCAGCAGCAGTATGCACTGGCAGCTGCTCATCAGCCGCAC 1248
||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 89 ATGCACTTGCTGTTCAGCAGTTGACAGCTGCCCAGCAGCAGCAGTATGCACTTGCAGCAGCCCACCAGCCTCAC 162
Query 1249 ATC---------------GGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAATCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCC 1307
||| |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163 ATCGGTATGTTTCCAGCAGGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAACCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCC 236
Query 1308 AGGGACGGACCCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTAGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAGTATT 1381
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 237 AGGGACGGACCCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTCGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAATATT 310
Query 1382 ATGGAGTTACTCCCTGGGGAGTCTACCCTGCCAGTCTTTTCCAGCAGCAAGCTGCCGCTGCCGCTGCAGCAACT 1455
|||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.
Sbjct 311 ATGGAGTCACGCCATGGGGTGTCTACCCTGCCAGTCTCTTCCAGCAGCAGGCAGCTGCAGCTGCAGCAGCTACA 384
Query 1456 AATTCAGCTAATCAACAGACCACCCCACAGGCTCAGCAAGGACAGCAGCAGGTTCTCCGTGGAGGAGCCAGCCA 1529
||.||.||||.|||.||||.|.|.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 385 AACTCTGCTACTCAGCAGAGCGCTCCGCAGGCCCAGCAGGGACAGCAGCAGGTTCTTCGTGGAGGAGCTAGCCA 458
Query 1530 ACGTCCTTTGACCCCAAACCAGAACCAGCAGGGACAGCAAACGGATCCCCTTGTGGCAGCTGCAGCAGTGAATT 1603
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 459 ACGTCCTTTGACCCCAAATCAGAACCAGCAGGGACAACAAACAGATCCCCTTGTAGCAGCTGCAGCAGTGAATT 532
Query 1604 CTGCCCTTGCATTTGGACAAGGTCTGGCAGCAGGCATGCCAGGTTATCCGGTGTTGGCTCCTGCTGCTTACTAT 1677
||||.|||||.|||||||||||..||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 533 CTGCTCTTGCCTTTGGACAAGGATTGGCTGCAGGTATGCCAGGTTATCCAGTCTTGGCACCTGCTGCTTACTAT 606
Query 1678 GACCAAACTGGTGCCCTTGTAGTGAATGCAGGCGCGAGAAATGGTCTTGGAGCTCCTGTTCGACTTGTAGCTCC 1751
||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 607 GACCAAACTGGTGCCCTTGTGGTGAATGCAGGGGCAAGAAATGGCCTCGGAGCTCCAGTCCGGCTTGTTGCTCC 680
Query 1752 TGCCCCAGTCATCATTAGTTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCAGCCGCAGCTTCAGCAAATGGAGCAG 1825
.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 681 AGCCCCAGTCATCATTAGCTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCGGCTGCAGCGTCAGCAAACGGAGCAG 754
Query 1826 CTGGTGGTCTTGCTGGAACAACAAATGGACCATTTCGCCCTTTAGGAACACAGCAGCCTCAGCCCCAGCCCCAG 1899
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 755 CTGGTGGTCTTGCCGGAACTACAAATGGACCATTTCGACCTTTAGGCACCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCCTCAG 828
Query 1900 CAGCAGCCCAATAACAACCTGGCATCCAGTTCTTTCTACGGCAACAACTCTCTGAACAGCAATTCACAGAGCAG 1973
||||||||||.||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||.||||||||
Sbjct 829 CAGCAGCCCAGTAACAATCTGGCTTCCAGCTCTTTCTATGGCAACAACTCTCTGAGCAGTAACTCCCAGAGCAG 902
Query 1974 CTCCCTCTTCTCCCAGGGCTCTGCCCAGCCTGCCAACACATCCTTGGGATTCGGAAGTAGCAGTTCTCTCGGCG 2047
||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct 903 CTCCCTCTTCTCTCAGGGCTCTGCACAGCCTGCCAACACGTCCTTGGGATTCGGAAGCAGCAGTTCCCTTGGTG 976
Query 2048 CCACCCTGGGATCCGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGT 2121
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 CCACCCTGGGATCGGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGT 1050
Query 2122 GACTCCCTGACTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGACCCCCATTGGACACAGTTTTTA 2195
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051 GACTCCCTGACTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGGCCCCCATTGGACACAGTTTTTA 1124
Query 2196 TAACGGCCTTAGCTTTTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCAC 2269
||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125 TAGCAGCCTTAGCTATTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCAC 1198
Query 2270 AGACACCACCTCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACGAACGGCAGT 2343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1199 AGACACCACCTCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACAAACGGCAGT 1272
Query 2344 GGAAGATACATCTCTGCTGCTCCAGGCGCTGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGCGCCTCCAGCCTCTTCAG 2417
|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1273 GGAAGATACATCTCTGCTGCTCCCGGTGCCGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGTGCCTCCAGCCTTTTCAG 1346
Query 2418 CCCGAGCAGCACTCTTTTCTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTCATGCCTTCTGGCAGGAGCA 2491
|||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1347 CCCCAGCAGCACCCTTTTTTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTTATGCCCTCTGGCAGGAGCA 1420
Query 2492 GGCTTTTGGAAGATTTTCGAAACAACCGGTACCCCAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGACATATAATGGAA 2565
|.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1421 GACTTCTGGAAGATTTTCGAAACAACCGGTACCCTAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGGCATATAATGGAA 1494
Query 2566 TTTTCCCAAGACCAGCATGGGTCCAGATTCATTCAGCTGAAACTGGAGCGTGCCACACCAGCTGAGCGCCAGCT 2639
|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1495 TTTTCTCAAGACCAGCATGGCTCTAGATTCATTCAGCTGAAACTAGAGCGTGCCACAGCAGCTGAGCGCCAGCT 1568
Query 2640 TGTCTTCAATGAAATCCTCCAGGCTGCCTACCAACTCATGGTGGATGTGTTTGGTAATTACGTCATTCAGAAGT 2713
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1569 TGTCTTCAATGAAATCCTCCAGGCTGCGTACCAACTTATGGTGGATGTGTTTGGAAATTACGTCATTCAGAAGT 1642
Query 2714 TCTTTGAATTTGGCAGTCTTGAACAGAAGCTGGCTTTGGCAGAACGGATTCGAGGCCACGTCCTGTCATTGGCA 2787
|.||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1643 TTTTTGAATTTGGCAGTCATGAACAGAAGCTGGCTCTGGCTGAACGGATTCGAGGCCATGTCCTATCATTGGCA 1716
Query 2788 CTACAGATGTATGGCTGCCGTGTTATCCAGAAAGCTCTTGAGTTTATTCCTTCAGACCAGCAG------AATGA 2855
||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||| ||.||
Sbjct 1717 CTGCAGATGTACGGCTGCCGAGTCATCCAGAAAGCTTTGGAGTTTATTCCCTCAGACCAGCAGGTAATTAACGA 1790
Query 2856 GATGGTTCGGGAACTAGATGGCCATGTCTTGAAGTGTGTGAAAGATCAGAATGGCAATCACGTGGTTCAGAAAT 2929
||||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1791 GATGGTGCGGGAGCTAGATGGCCATGTCCTGAAGTGTGTGAAAGACCAGAACGGCAACCATGTGGTTCAGAAGT 1864
Query 2930 GCATTGAATGTGTACAGCCCCAGTCTTTGCAATTTATCATCGATGCGTTTAAGGGACAGGTATTTGCCTTATCC 3003
|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.
Sbjct 1865 GCATTGAGTGTGTACAGCCCCAGTCTTTGCAGTTTATCATCGATGCATTCAAGGGGCAGGTGTTTGCTTTGTCT 1938
Query 3004 ACACATCCTTATGGCTGCCGAGTGATTCAGAGAATCCTGGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACACTCCCTATTTT 3077
||.||.||.||.|||||..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|
Sbjct 1939 ACGCACCCGTACGGCTGTAGGGTGATCCAGAGGATCCTAGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACCCTCCCCATCCT 2012
Query 3078 AGAGGAGCTTCACCAGCACACAGAGCAGCTTGTACAGGATCAATATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGG 3151
.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2013 GGAGGAGCTTCACCAGCACACAGAGCAGCTTGTGCAGGATCAGTATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGG 2086
Query 3152 AGCACGGTCGTCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAAATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCAC 3225
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087 AGCATGGTCGTCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAGATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCAC 2160
Query 3226 AAATTTGCAAGCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACGGAGCGCGCTGTGCTCATCGATGA 3299
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 2161 AAGTTTGCAAGCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACAGAGCGTGCTGTGCTCATTGATGA 2234
Query 3300 GGTGTGCACCATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGACCAGTATGCCAACTACGTGG 3373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 2235 GGTGTGCACCATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGATCAGTATGCTAACTATGTGG 2308
Query 3374 TCCAGAAGATGATTGACGTGGCGGAGCCAGGCCAGCGGAAGATCGTCATGCATAAGATCCGGCCCCACATCGCA 3447
|||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct 2309 TCCAGAAGATGATCGATGTGGCTGAGCCGGGTCAGCGGAAGATTGTCATGCACAAGATCCGGCCACACATTGCG 2382
Query 3448 ACTCTTCGTAAGTACACCTATGGCAAGCACATTCTGGCCAAGCTGGAGAAGTACTACATGAAGAACGGTGTTGA 3521
||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 2383 ACGCTTCGAAAGTACACCTATGGCAAGCACATCCTGGCCAAGCTCGAGAAGTACTACATGAAGAATGGCGTGGA 2456
Query 3522 CTTAGGGCCCATCTGTGGCCCCCCTAATGGTATCATC 3558
|||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2457 CTTGGGGCCCATTTGTGGTCCCCCTAATGGTATCATC 2493
