Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07469
• Subject: XM_011250358.2
• Aligned Length: 3587
• Identities: 2981
• Gaps: 388

Alignment

Query    1  ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAAC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGGACTCACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCTATAGGAGTTGCAGGCCGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGGAGGCGGCTATAATAATAGCAAACATCGATGGCCTACTGGGGATAACATTCATGCAGAACATCAGGTGCGTT  370
                                          |||   .||||.|       |.|||||||.| |..||||     
Sbjct    1  ------------------------------ATG---CACTGTG-------TGCATGCAGGA-AGGAGGT-----  28

Query  371  CCATGGA---TGAACTGAATCATGATTTTCAAGC--ACTTGCTCTGGAGGGAAGAGCGATGGGA---GAGCAGC  436
             ||||||   |||          |..|.||||||  .|.||  .|||.||.|.||.|.|    |   .||||||
Sbjct   29  -CATGGAAGTTGA----------GGGTGTCAAGCTATCATG--TTGGTGGTAGGAACCA----AACCCAGCAGC  85

Query  437  TCTTGCCAGGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGAT  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   86  TCTTGCCAGGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGAT  159

Query  511  CAATGGCGAGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGG  584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  160  CAATGGCGAGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGG  233

Query  585  TCAGAGTTTCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGATCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTA  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  234  TCAGAGTTTCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGGTCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTA  307

Query  659  GCATGGTGGAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGATTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGAT  732
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  308  GCATGGTGGAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGACTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGAT  381

Query  733  GCAGACAGTGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTT  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  382  GCAGACAGTGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTT  455

Query  807  GAAGGAGGAGGGTGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTACCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAG  880
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  456  GAAGGAGGAGGGAGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTGCCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAG  529

Query  881  ATTTTAGCCGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGT  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  530  ATTTTAGCCGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGT  603

Query  955  TCTGAGGGCTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCA  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  604  TCTGAGGGCTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCA  677

Query 1029  GAGTGTCCCCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTTCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTAC  1102
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  678  GAGTGTCCCCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTGCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTAC  751

Query 1103  CTGTGGACTCAGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTGTTCCAAAGACCTAAT  1176
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  752  CTGTGGACTCTGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTATTCCAAAGACCCAAT  825

Query 1177  GCGCTTGCTGTCCAGCAGTTGACAGCTGCTCAGCAGCAGCAGTATGCACTGGCAGCTGCTCATCAGCCGCACAT  1250
            ||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  826  GCACTTGCTGTTCAGCAGTTGACAGCTGCCCAGCAGCAGCAGTATGCACTTGCAGCAGCCCACCAGCCTCACAT  899

Query 1251  C---------------GGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAATCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAG  1309
            |               |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900  CGGTATGTTTCCAGCAGGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAACCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAG  973

Query 1310  GGACGGACCCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTAGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAGTATTAT  1383
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  974  GGACGGACCCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTCGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAATATTAT  1047

Query 1384  GGAGTTACTCCCTGGGGAGTCTACCCTGCCAGTCTTTTCCAGCAGCAAGCTGCCGCTGCCGCTGCAGCAACTAA  1457
            |||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 1048  GGAGTCACGCCATGGGGTGTCTACCCTGCCAGTCTCTTCCAGCAGCAGGCAGCTGCAGCTGCAGCAGCTACAAA  1121

Query 1458  TTCAGCTAATCAACAGACCACCCCACAGGCTCAGCAAGGACAGCAGCAGGTTCTCCGTGGAGGAGCCAGCCAAC  1531
            .||.||||.|||.||||.|.|.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1122  CTCTGCTACTCAGCAGAGCGCTCCGCAGGCCCAGCAGGGACAGCAGCAGGTTCTTCGTGGAGGAGCTAGCCAAC  1195

Query 1532  GTCCTTTGACCCCAAACCAGAACCAGCAGGGACAGCAAACGGATCCCCTTGTGGCAGCTGCAGCAGTGAATTCT  1605
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1196  GTCCTTTGACCCCAAATCAGAACCAGCAGGGACAACAAACAGATCCCCTTGTAGCAGCTGCAGCAGTGAATTCT  1269

Query 1606  GCCCTTGCATTTGGACAAGGTCTGGCAGCAGGCATGCCAGGTTATCCGGTGTTGGCTCCTGCTGCTTACTATGA  1679
            ||.|||||.|||||||||||..||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1270  GCTCTTGCCTTTGGACAAGGATTGGCTGCAGGTATGCCAGGTTATCCAGTCTTGGCACCTGCTGCTTACTATGA  1343

Query 1680  CCAAACTGGTGCCCTTGTAGTGAATGCAGGCGCGAGAAATGGTCTTGGAGCTCCTGTTCGACTTGTAGCTCCTG  1753
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 1344  CCAAACTGGTGCCCTTGTGGTGAATGCAGGGGCAAGAAATGGCCTCGGAGCTCCAGTCCGGCTTGTTGCTCCAG  1417

Query 1754  CCCCAGTCATCATTAGTTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCAGCCGCAGCTTCAGCAAATGGAGCAGCT  1827
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1418  CCCCAGTCATCATTAGCTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCGGCTGCAGCGTCAGCAAACGGAGCAGCT  1491

Query 1828  GGTGGTCTTGCTGGAACAACAAATGGACCATTTCGCCCTTTAGGAACACAGCAGCCTCAGCCCCAGCCCCAGCA  1901
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1492  GGTGGTCTTGCCGGAACTACAAATGGACCATTTCGACCTTTAGGCACCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCCTCAGCA  1565

Query 1902  GCAGCCCAATAACAACCTGGCATCCAGTTCTTTCTACGGCAACAACTCTCTGAACAGCAATTCACAGAGCAGCT  1975
            ||||||||.||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||.||||||||||
Sbjct 1566  GCAGCCCAGTAACAATCTGGCTTCCAGCTCTTTCTATGGCAACAACTCTCTGAGCAGTAACTCCCAGAGCAGCT  1639

Query 1976  CCCTCTTCTCCCAGGGCTCTGCCCAGCCTGCCAACACATCCTTGGGATTCGGAAGTAGCAGTTCTCTCGGCGCC  2049
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||
Sbjct 1640  CCCTCTTCTCTCAGGGCTCTGCACAGCCTGCCAACACGTCCTTGGGATTCGGAAGCAGCAGTTCCCTTGGTGCC  1713

Query 2050  ACCCTGGGATCCGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGA  2123
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1714  ACCCTGGGATCGGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGA  1787

Query 2124  CTCCCTGACTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGACCCCCATTGGACACAGTTTTTATA  2197
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788  CTCCCTGACTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGGCCCCCATTGGACACAGTTTTTATA  1861

Query 2198  ACGGCCTTAGCTTTTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAG  2271
            .|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1862  GCAGCCTTAGCTATTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAG  1935

Query 2272  ACACCACCTCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACGAACGGCAGTGG  2345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1936  ACACCACCTCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACAAACGGCAGTGG  2009

Query 2346  AAGATACATCTCTGCTGCTCCAGGCGCTGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGCGCCTCCAGCCTCTTCAGCC  2419
            |||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2010  AAGATACATCTCTGCTGCTCCCGGTGCCGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGTGCCTCCAGCCTTTTCAGCC  2083

Query 2420  CGAGCAGCACTCTTTTCTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTCATGCCTTCTGGCAGGAGCAGG  2493
            |.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 2084  CCAGCAGCACCCTTTTTTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTTATGCCCTCTGGCAGGAGCAGA  2157

Query 2494  CTTTTGGAAGATTTTCGAAACAACCGGTACCCCAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGACATATAATGGAATT  2567
            |||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2158  CTTCTGGAAGATTTTCGAAACAACCGGTACCCTAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGGCATATAATGGAATT  2231

Query 2568  TTCCCAAGACCAGCATGGGTCCAGATTCATTCAGCTGAAACTGGAGCGTGCCACACCAGCTGAGCGCCAGCTTG  2641
            |||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2232  TTCTCAAGACCAGCATGGCTCTAGATTCATTCAGCTGAAACTAGAGCGTGCCACAGCAGCTGAGCGCCAGCTTG  2305

Query 2642  TCTTCAATGAAATCCTCCAGGCTGCCTACCAACTCATGGTGGATGTGTTTGGTAATTACGTCATTCAGAAGTTC  2715
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2306  TCTTCAATGAAATCCTCCAGGCTGCGTACCAACTTATGGTGGATGTGTTTGGAAATTACGTCATTCAGAAGTTT  2379

Query 2716  TTTGAATTTGGCAGTCTTGAACAGAAGCTGGCTTTGGCAGAACGGATTCGAGGCCACGTCCTGTCATTGGCACT  2789
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2380  TTTGAATTTGGCAGTCATGAACAGAAGCTGGCTCTGGCTGAACGGATTCGAGGCCATGTCCTATCATTGGCACT  2453

Query 2790  ACAGATGTATGGCTGCCGTGTTATCCAGAAAGCTCTTGAGTTTATTCCTTCAGACCAGCAG------AATGAGA  2857
            .||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||      ||.||||
Sbjct 2454  GCAGATGTACGGCTGCCGAGTCATCCAGAAAGCTTTGGAGTTTATTCCCTCAGACCAGCAGGTAATTAACGAGA  2527

Query 2858  TGGTTCGGGAACTAGATGGCCATGTCTTGAAGTGTGTGAAAGATCAGAATGGCAATCACGTGGTTCAGAAATGC  2931
            ||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 2528  TGGTGCGGGAGCTAGATGGCCATGTCCTGAAGTGTGTGAAAGACCAGAACGGCAACCATGTGGTTCAGAAGTGC  2601

Query 2932  ATTGAATGTGTACAGCCCCAGTCTTTGCAATTTATCATCGATGCGTTTAAGGGACAGGTATTTGCCTTATCCAC  3005
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||
Sbjct 2602  ATTGAGTGTGTACAGCCCCAGTCTTTGCAGTTTATCATCGATGCATTCAAGGGGCAGGTGTTTGCTTTGTCTAC  2675

Query 3006  ACATCCTTATGGCTGCCGAGTGATTCAGAGAATCCTGGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACACTCCCTATTTTAG  3079
            .||.||.||.|||||..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|.|
Sbjct 2676  GCACCCGTACGGCTGTAGGGTGATCCAGAGGATCCTAGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACCCTCCCCATCCTGG  2749

Query 3080  AGGAGCTTCACCAGCACACAGAGCAGCTTGTACAGGATCAATATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAG  3153
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2750  AGGAGCTTCACCAGCACACAGAGCAGCTTGTGCAGGATCAGTATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAG  2823

Query 3154  CACGGTCGTCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAAATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAA  3227
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2824  CATGGTCGTCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAGATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAA  2897

Query 3228  ATTTGCAAGCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACGGAGCGCGCTGTGCTCATCGATGAGG  3301
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2898  GTTTGCAAGCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACAGAGCGTGCTGTGCTCATTGATGAGG  2971

Query 3302  TGTGCACCATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGACCAGTATGCCAACTACGTGGTC  3375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2972  TGTGCACCATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGATCAGTATGCTAACTATGTGGTC  3045

Query 3376  CAGAAGATGATTGACGTGGCGGAGCCAGGCCAGCGGAAGATCGTCATGCATAAGATCCGGCCCCACATCGCAAC  3449
            |||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 3046  CAGAAGATGATCGATGTGGCTGAGCCGGGTCAGCGGAAGATTGTCATGCACAAGATCCGGCCACACATTGCGAC  3119

Query 3450  TCTTCGTAAGTACACCTATGGCAAGCACATTCTGGCCAAGCTGGAGAAGTACTACATGAAGAACGGTGTTGACT  3523
            .|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 3120  GCTTCGAAAGTACACCTATGGCAAGCACATCCTGGCCAAGCTCGAGAAGTACTACATGAAGAATGGCGTGGACT  3193

Query 3524  TAGGGCCCATCTGTGGCCCCCCTAATGGTATCATC  3558
            |.||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 3194  TGGGGCCCATTTGTGGTCCCCCTAATGGTATCATC  3228