Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07469
• Subject: XM_011250359.2
• Aligned Length: 3582
• Identities: 2765
• Gaps: 612

Alignment

Query    1  ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAAC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGGACTCACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCTATAGGAGTTGCAGGCCGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGGAGGCGGCTATAATAATAGCAAACATCGATGGCCTACTGGGGATAACATTCATGCAGAACATCAGGTGCGTT  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCATGGATGAACTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAGGGAAGAGCGATGGGA---GAGCAGCTCTTG  441
                                 ||.|              |||.||.|.||.|.|    |   .|||||||||||
Sbjct    1  ---------------------ATGT--------------TGGTGGTAGGAACCA----AACCCAGCAGCTCTTG  35

Query  442  CCAGGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATG  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   36  CCAGGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATG  109

Query  516  GCGAGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGA  589
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct  110  GCGAGACAGTGCCTGGGGAACATCAG------------------------------------------------  135

Query  590  GTTTCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGATCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATG  663
                                                                                      
Sbjct  136  --------------------------------------------------------------------------  135

Query  664  GTGGAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGATTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGATGCAGA  737
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  136  ---------------------------------------------------------GGCCCAAGGGATGCAGA  152

Query  738  CAGTGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGG  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  153  CAGTGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGG  226

Query  812  AGGAGGGTGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTACCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAGATTTT  885
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  AGGAGGGAGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTGCCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAGATTTT  300

Query  886  AGCCGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTTCTGA  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  AGCCGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTTCTGA  374

Query  960  GGGCTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  GGGCTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTG  448

Query 1034  TCCCCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTTCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTACCTGTG  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  TCCCCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTGCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTACCTGTG  522

Query 1108  GACTCAGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTGTTCCAAAGACCTAATGCGCT  1181
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct  523  GACTCTGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTATTCCAAAGACCCAATGCACT  596

Query 1182  TGCTGTCCAGCAGTTGACAGCTGCTCAGCAGCAGCAGTATGCACTGGCAGCTGCTCATCAGCCGCACATC----  1251
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||    
Sbjct  597  TGCTGTTCAGCAGTTGACAGCTGCCCAGCAGCAGCAGTATGCACTTGCAGCAGCCCACCAGCCTCACATCGGTA  670

Query 1252  -----------GGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAATCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACG  1314
                       |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  TGTTTCCAGCAGGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAACCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACG  744

Query 1315  GACCCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTAGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAGTATTATGGAGT  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  745  GACCCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTCGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAATATTATGGAGT  818

Query 1389  TACTCCCTGGGGAGTCTACCCTGCCAGTCTTTTCCAGCAGCAAGCTGCCGCTGCCGCTGCAGCAACTAATTCAG  1462
            .||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  819  CACGCCATGGGGTGTCTACCCTGCCAGTCTCTTCCAGCAGCAGGCAGCTGCAGCTGCAGCAGCTACAAACTCTG  892

Query 1463  CTAATCAACAGACCACCCCACAGGCTCAGCAAGGACAGCAGCAGGTTCTCCGTGGAGGAGCCAGCCAACGTCCT  1536
            |||.|||.||||.|.|.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  893  CTACTCAGCAGAGCGCTCCGCAGGCCCAGCAGGGACAGCAGCAGGTTCTTCGTGGAGGAGCTAGCCAACGTCCT  966

Query 1537  TTGACCCCAAACCAGAACCAGCAGGGACAGCAAACGGATCCCCTTGTGGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCCCT  1610
            |||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  967  TTGACCCCAAATCAGAACCAGCAGGGACAACAAACAGATCCCCTTGTAGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCTCT  1040

Query 1611  TGCATTTGGACAAGGTCTGGCAGCAGGCATGCCAGGTTATCCGGTGTTGGCTCCTGCTGCTTACTATGACCAAA  1684
            |||.|||||||||||..||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  TGCCTTTGGACAAGGATTGGCTGCAGGTATGCCAGGTTATCCAGTCTTGGCACCTGCTGCTTACTATGACCAAA  1114

Query 1685  CTGGTGCCCTTGTAGTGAATGCAGGCGCGAGAAATGGTCTTGGAGCTCCTGTTCGACTTGTAGCTCCTGCCCCA  1758
            |||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1115  CTGGTGCCCTTGTGGTGAATGCAGGGGCAAGAAATGGCCTCGGAGCTCCAGTCCGGCTTGTTGCTCCAGCCCCA  1188

Query 1759  GTCATCATTAGTTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCAGCCGCAGCTTCAGCAAATGGAGCAGCTGGTGG  1832
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1189  GTCATCATTAGCTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCGGCTGCAGCGTCAGCAAACGGAGCAGCTGGTGG  1262

Query 1833  TCTTGCTGGAACAACAAATGGACCATTTCGCCCTTTAGGAACACAGCAGCCTCAGCCCCAGCCCCAGCAGCAGC  1906
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1263  TCTTGCCGGAACTACAAATGGACCATTTCGACCTTTAGGCACCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCCTCAGCAGCAGC  1336

Query 1907  CCAATAACAACCTGGCATCCAGTTCTTTCTACGGCAACAACTCTCTGAACAGCAATTCACAGAGCAGCTCCCTC  1980
            |||.||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1337  CCAGTAACAATCTGGCTTCCAGCTCTTTCTATGGCAACAACTCTCTGAGCAGTAACTCCCAGAGCAGCTCCCTC  1410

Query 1981  TTCTCCCAGGGCTCTGCCCAGCCTGCCAACACATCCTTGGGATTCGGAAGTAGCAGTTCTCTCGGCGCCACCCT  2054
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1411  TTCTCTCAGGGCTCTGCACAGCCTGCCAACACGTCCTTGGGATTCGGAAGCAGCAGTTCCCTTGGTGCCACCCT  1484

Query 2055  GGGATCCGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGACTCCC  2128
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485  GGGATCGGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGACTCCC  1558

Query 2129  TGACTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGACCCCCATTGGACACAGTTTTTATAACGGC  2202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 1559  TGACTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGGCCCCCATTGGACACAGTTTTTATAGCAGC  1632

Query 2203  CTTAGCTTTTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAGACACC  2276
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633  CTTAGCTATTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAGACACC  1706

Query 2277  ACCTCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACGAACGGCAGTGGAAGAT  2350
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1707  ACCTCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACAAACGGCAGTGGAAGAT  1780

Query 2351  ACATCTCTGCTGCTCCAGGCGCTGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGCGCCTCCAGCCTCTTCAGCCCGAGC  2424
            ||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1781  ACATCTCTGCTGCTCCCGGTGCCGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGTGCCTCCAGCCTTTTCAGCCCCAGC  1854

Query 2425  AGCACTCTTTTCTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTCATGCCTTCTGGCAGGAGCAGGCTTTT  2498
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|
Sbjct 1855  AGCACCCTTTTTTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTTATGCCCTCTGGCAGGAGCAGACTTCT  1928

Query 2499  GGAAGATTTTCGAAACAACCGGTACCCCAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGACATATAATGGAATTTTCCC  2572
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1929  GGAAGATTTTCGAAACAACCGGTACCCTAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGGCATATAATGGAATTTTCTC  2002

Query 2573  AAGACCAGCATGGGTCCAGATTCATTCAGCTGAAACTGGAGCGTGCCACACCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTC  2646
            |||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003  AAGACCAGCATGGCTCTAGATTCATTCAGCTGAAACTAGAGCGTGCCACAGCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTC  2076

Query 2647  AATGAAATCCTCCAGGCTGCCTACCAACTCATGGTGGATGTGTTTGGTAATTACGTCATTCAGAAGTTCTTTGA  2720
            ||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2077  AATGAAATCCTCCAGGCTGCGTACCAACTTATGGTGGATGTGTTTGGAAATTACGTCATTCAGAAGTTTTTTGA  2150

Query 2721  ATTTGGCAGTCTTGAACAGAAGCTGGCTTTGGCAGAACGGATTCGAGGCCACGTCCTGTCATTGGCACTACAGA  2794
            |||||||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 2151  ATTTGGCAGTCATGAACAGAAGCTGGCTCTGGCTGAACGGATTCGAGGCCATGTCCTATCATTGGCACTGCAGA  2224

Query 2795  TGTATGGCTGCCGTGTTATCCAGAAAGCTCTTGAGTTTATTCCTTCAGACCAGCAG------AATGAGATGGTT  2862
            ||||.||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||      ||.||||||||.
Sbjct 2225  TGTACGGCTGCCGAGTCATCCAGAAAGCTTTGGAGTTTATTCCCTCAGACCAGCAGGTAATTAACGAGATGGTG  2298

Query 2863  CGGGAACTAGATGGCCATGTCTTGAAGTGTGTGAAAGATCAGAATGGCAATCACGTGGTTCAGAAATGCATTGA  2936
            |||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 2299  CGGGAGCTAGATGGCCATGTCCTGAAGTGTGTGAAAGACCAGAACGGCAACCATGTGGTTCAGAAGTGCATTGA  2372

Query 2937  ATGTGTACAGCCCCAGTCTTTGCAATTTATCATCGATGCGTTTAAGGGACAGGTATTTGCCTTATCCACACATC  3010
            .|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.||.|
Sbjct 2373  GTGTGTACAGCCCCAGTCTTTGCAGTTTATCATCGATGCATTCAAGGGGCAGGTGTTTGCTTTGTCTACGCACC  2446

Query 3011  CTTATGGCTGCCGAGTGATTCAGAGAATCCTGGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACACTCCCTATTTTAGAGGAG  3084
            |.||.|||||..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|.||||||
Sbjct 2447  CGTACGGCTGTAGGGTGATCCAGAGGATCCTAGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACCCTCCCCATCCTGGAGGAG  2520

Query 3085  CTTCACCAGCACACAGAGCAGCTTGTACAGGATCAATATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCACGG  3158
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2521  CTTCACCAGCACACAGAGCAGCTTGTGCAGGATCAGTATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCATGG  2594

Query 3159  TCGTCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAAATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAAATTTG  3232
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2595  TCGTCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAGATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAAGTTTG  2668

Query 3233  CAAGCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACGGAGCGCGCTGTGCTCATCGATGAGGTGTGC  3306
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2669  CAAGCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACAGAGCGTGCTGTGCTCATTGATGAGGTGTGC  2742

Query 3307  ACCATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGACCAGTATGCCAACTACGTGGTCCAGAA  3380
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2743  ACCATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGATCAGTATGCTAACTATGTGGTCCAGAA  2816

Query 3381  GATGATTGACGTGGCGGAGCCAGGCCAGCGGAAGATCGTCATGCATAAGATCCGGCCCCACATCGCAACTCTTC  3454
            ||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 2817  GATGATCGATGTGGCTGAGCCGGGTCAGCGGAAGATTGTCATGCACAAGATCCGGCCACACATTGCGACGCTTC  2890

Query 3455  GTAAGTACACCTATGGCAAGCACATTCTGGCCAAGCTGGAGAAGTACTACATGAAGAACGGTGTTGACTTAGGG  3528
            |.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 2891  GAAAGTACACCTATGGCAAGCACATCCTGGCCAAGCTCGAGAAGTACTACATGAAGAATGGCGTGGACTTGGGG  2964

Query 3529  CCCATCTGTGGCCCCCCTAATGGTATCATC  3558
            |||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2965  CCCATTTGTGGTCCCCCTAATGGTATCATC  2994