Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07469
• Subject: XM_011250360.2
• Aligned Length: 1193
• Identities: 958
• Gaps: 223

Alignment

Query    1  MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGR  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  SQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLP  148
                                                          .|||||||||||||||||||||||    
Sbjct    1  ----------------------------------------------MVRSMDELNHDFQALALEGRAMGE----  24

Query  149  GKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMV  222
                                                                                      
Sbjct   25  --------------------------------------------------------------------------  24

Query  223  EYVLSSSPGDSCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFS  296
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   25  ------------------GPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFS  80

Query  297  RTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVD  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   81  RTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVD  154

Query  371  SAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHI-----GLAPAAFVPNPYIISAAPPGTD  439
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||
Sbjct  155  SAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIGMFPAGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTD  228

Query  440  PYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGASQRPL  513
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||||||
Sbjct  229  PYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSATQQSAPQAQQGQQQVLRGGASQRPL  302

Query  514  TPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPV  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  303  TPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPV  376

Query  588  IISSSAAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSSLF  661
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  377  IISSSAAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPSNNLASSSFYGNNSLSSNSQSSSLF  450

Query  662  SQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLTPIGHSFYNGL  735
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|
Sbjct  451  SQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLAPIGHSFYSSL  524

Query  736  SFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSS  809
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  525  SYSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSS  598

Query  810  TLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFN  883
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  599  TLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATAAERQLVFN  672

Query  884  EILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQ--NEMVR  955
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
Sbjct  673  EILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSHEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQVINEMVR  746

Query  956  ELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEEL  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  747  ELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEEL  820

Query 1030  HQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCT  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  821  HQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCT  894

Query 1104  MNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGP  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  895  MNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGP  968

Query 1178  ICGPPNGII  1186
            |||||||||
Sbjct  969  ICGPPNGII  977