Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08342
• Subject: NM_001164387.2
• Aligned Length: 1509
• Identities: 1503
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQVLFCSETIARCW  74
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Sbjct    1  MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQVLFCSETIARCW  74

Query   75  YILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENAKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYK  148
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Sbjct   75  YILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENAKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYK  148

Query  149  GERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTR  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTR  222

Query  223  LPEGPVDSEDDEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVM  296
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Sbjct  223  LPEGPVDSEDDEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVM  296

Query  297  IFEVVEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVC  370
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Sbjct  297  IFEVVEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVC  370

Query  371  IAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFL  444
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Sbjct  371  IAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFL  444

Query  445  LTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLL  518
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Sbjct  445  LTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLL  518

Query  519  NIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFM  592
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Sbjct  519  NIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFM  592

Query  593  KAVEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKGSKKVKA  666
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Sbjct  593  KAVEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKGSKKVKA  666

Query  667  NTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSML  740
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Sbjct  667  NTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSML  740

Query  741  DFSNPSD-----IPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQR  809
            ||||||.     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  DFSNPSAVGFYYIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQR  814

Query  810  RLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTE  883
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Sbjct  815  RLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTE  888

Query  884  YIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGL  957
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Sbjct  889  YIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGL  962

Query  958  NLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKV  1031
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Sbjct  963  NLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKV  1036

Query 1032  DGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLN  1105
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Sbjct 1037  DGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLN  1110

Query 1106  AKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAH  1179
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Sbjct 1111  AKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAH  1184

Query 1180  LHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGS  1253
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Sbjct 1185  LHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGS  1258

Query 1254  PHKGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEHASGIGDH  1327
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Sbjct 1259  PHKGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEHASGIGDH  1332

Query 1328  SQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRH  1401
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Sbjct 1333  SQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRH  1406

Query 1402  THLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLERKSWTSSSSLSDTYEPNYGTVKQRVLESTPAESSEGLD  1475
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Sbjct 1407  THLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLERKSWTSSSSLSDTYEPNYGTVKQRVLESTPAESSEGLD  1480

Query 1476  PKDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQVSAV  1504
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Sbjct 1481  PKDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQVSAV  1509