Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08342
• Subject: NM_001164389.2
• Aligned Length: 4555
• Identities: 4046
• Gaps: 425

Alignment

Query    1  ATGAACTCACCCGTGGACCCTGGCGCTAGGCAGGCGTTGAGGAAGAAGCCACCCGAGCGGACTCCCGAGGACTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACTCACCCGTGGACCCTGGCGCTAGGCAGGCGTTGAGGAAGAAGCCACCCGAGCGGACTCCCGAGGACTT  74

Query   75  AAATACTATTTATTCTTATCTTCATGGAATGGAAATATTATCAAATCTCAGGGAACATCAGCTTAGATTAATGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAATACTATTTATTCTTATCTTCATGGAATGGAAATATTATCAAATCTCAGGGAACATCAGCTTAGATTAATGT  148

Query  149  CTGCAAGAGCACGCTATGAGAGATACAGTGGCAATCAGGTTCTCTTTTGTTCAGAAACGATTGCCAGATGTTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGCAAGAGCACGCTATGAGAGATACAGTGGCAATCAGGTTCTCTTTTGTTCAGAAACGATTGCCAGATGTTGG  222

Query  223  TATATCCTACTTTCTGGATCTGTGCTTGTAAAAGGCTCCATGGTCTTGCCTCCTTGCAGTTTTGGTAAGCAGTT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATATCCTACTTTCTGGATCTGTGCTTGTGAAAGGCTCCATGGTCTTGCCTCCTTGCAGTTTTGGTAAGCAGTT  296

Query  297  TGGAGGAAAAAGAGGATGTGATTGTCTTGTATTAGAGCCTTCAGAAATGATTGTGGTAGAGAATGCCAAAGATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGAGGAAAAAGAGGATGTGATTGTCTTGTATTAGAGCCTTCAGAAATGATTGTGGTAGAGAATGCCAAAGATA  370

Query  371  ATGAAGATAGTATTCTACAAAGAGAAATTCCTGCCAGACAATCCCGAAGAAGATTTCGGAAAATTAACTATAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGAAGATAGTATTCTACAAAGAGAAATTCCTGCCAGACAATCCCGAAGAAGATTTCGGAAAATTAACTATAAA  444

Query  445  GGAGAGCGCCAAACCATTACTGATGATGTGGAGGTTAACAGCTATCTTTCTCTTCCAGCTGATCTTACCAAGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAGAGCGCCAAACCATTACTGATGATGTGGAGGTTAACAGCTATCTTTCTCTTCCAGCTGATCTTACCAAGAT  518

Query  519  GCATCTCACAGAAAACCCTCATCCACAGGTGACTCATGTGTCTTCTAGTCAGTCTGGTTGTAGCATTGCCAGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCATCTCACAGAAAACCCTCATCCACAGGTGACTCATGTGTCTTCTAGTCAGTCTGGTTGTAGCATTGCCAGTG  592

Query  593  ACTCTGGAAGCAGCAGTTTATCTGATATCTATCAGGCTACGGAGAGTGAGGTAGGAGATGTAGATTTGACACGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTCTGGAAGCAGCAGTTTATCTGATATCTATCAGGCTACGGAGAGTGAGGTAGGAGATGTAGATTTGACACGT  666

Query  667  CTTCCAGAAGGACCTGTTGATTCTGAGGATGACGAAGAGGAAGATGAAGAGATTGATCGAACAGATCCATTGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTCCAGAAGGACCTGTTGATTCTGAGGATGACGAAGAGGAAGATGAAGAGATTGATCGAACAGATCCATTGCA  740

Query  741  GGGGCGAGATCTTGTTCGAGAATGTCTTGAAAAAGAACCTGCAGACAAAACTGATGATGACATTGAACAATTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGGCGAGATCTTGTTCGAGAATGTCTTGAAAAAGAACCTGCAGACAAAACTGATGATGACATTGAACAATTGC  814

Query  815  TGGAGTTTATGCACCAGCTCCCTGCATTTGCAAACATGACCATGTCTGTAAGGAGAGAACTCTGCTCAGTGATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAGTTTATGCACCAGCTCCCTGCATTTGCAAACATGACCATGTCTGTAAGGAGAGAACTCTGCTCAGTGATG  888

Query  889  ATTTTTGAAGTGGTAGAGCAGGCTGGAGCTATTATTCTTGAAGATGGGCAAGAGCTTGACTCATGGTATGTTAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTTTTGAAGTGGTAGAGCAGGCTGGAGCTATTATTCTTGAAGATGGGCAAGAGCTTGACTCATGGTATGTTAT  962

Query  963  TTTAAACGGCACTGTGGAAATCAGTCATCCAGATGGAAAAGTTGAAAATTTGTTTATGGGAAATAGTTTTGGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTTAAACGGCACTGTGGAAATCAGTCATCCAGATGGAAAAGTTGAAAATTTGTTTATGGGAAATAGTTTTGGAA  1036

Query 1037  TTACTCCCACTCTGGATAAGCAGTACATGCATGGAATTGTCAGGACTAAAGTAGATGATTGTCAGTTTGTCTGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTACTCCCACTCTGGATAAGCAGTACATGCATGGAATTGTCAGGACTAAAGTAGATGATTGTCAGTTTGTCTGC  1110

Query 1111  ATAGCCCAGCAAGATTATTGGAGAATTTTAAACCATGTGGAAAAAAATACCCATAAAGTTGAGGAAGAGGGAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATAGCCCAGCAAGATTATTGGAGAATTTTAAACCATGTGGAAAAAAATACCCATAAAGTTGAGGAAGAGGGAGA  1184

Query 1185  AATTGTTATGGTACATGAGCATCGGGAACTAGACCGGAGTGGAACCAGGAAAGGACACATTGTGATCAAGGCAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AATTGTTATGGTACATGAGCATCGGGAACTAGACCGGAGTGGAACCAGGAAAGGACACATTGTGATCAAGGCAA  1258

Query 1259  CACCTGAGCGTCTCATAATGCATTTAATAGAAGAACATTCCATCGTGGATCCAACTTATATAGAAGATTTTCTA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CACCTGAGCGTCTCATAATGCATTTAATAGAAGAACATTCCATCGTGGATCCAACTTATATAGAAGATTTTCTA  1332

Query 1333  TTAACTTACAGGACATTTCTTGAAAGTCCTTTGGATGTTGGGATCAAACTATTGGAATGGTTTAAGATCGACAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTAACTTACAGGACATTTCTTGAAAGTCCTTTGGATGTTGGGATCAAACTATTGGAATGGTTTAAGATCGACAG  1406

Query 1407  CTTAAGAGATAAGGTGACACGGATTGTATTATTATGGGTAAATAATCATTTTAATGATTTTGAAGGTGACCCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTTAAGAGATAAGGTGACACGGATTGTATTATTATGGGTAAATAATCATTTTAATGATTTTGAAGGTGACCCTG  1480

Query 1481  CTATGACTCGATTTCTAGAGGAATTTGAAAAAAATCTGGAAGATACAAAGATGAATGGTCATCTCCGGTTATTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTATGACTCGATTTCTAGAGGAATTTGAAAAAAATCTGGAAGATACAAAGATGAATGGTCATCTCCGGTTATTG  1554

Query 1555  AATATTGCCTGTGCTGCAAAGGCTAAGTGGAGACAGGTTGTGCTGCAAAAGGCTTCCCGCGAGTCCCCTCTACA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AATATTGCCTGTGCTGCAAAGGCTAAGTGGAGACAGGTTGTGCTGCAAAAGGCTTCCCGCGAGTCCCCTCTACA  1628

Query 1629  ATTCAGCCTTAATGGAGGGAGTGAGAAGGGATTTGGTATTTTTGTTGAAGGAGTAGAACCTGGTAGCAAAGCTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATTCAGCCTTAATGGAGGGAGTGAGAAGGGATTTGGTATTTTTGTTGAAGGAGTAGAACCTGGTAGCAAAGCTG  1702

Query 1703  CTGATTCAGGACTGAAACGTGGTGATCAGATTATGGAAGTAAATGGACAAAACTTTGAGAATATTACATTTATG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGATTCAGGACTGAAACGTGGTGATCAGATTATGGAAGTAAATGGACAAAACTTTGAGAATATTACATTTATG  1776

Query 1777  AAAGCCGTTGAAATTTTGAGGAATAATACTCATCTTGCACTTACTGTGAAGACCAACATTTTTGTGTTCAAAGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAAGCCGTTGAAATTTTGAGGAATAATACTCATCTTGCACTTACTGTGAAGACCAACATTTTTGTGTTCAAAGA  1850

Query 1851  GTTACTTTTTAGGACTGAACAAGAGAAATCTGGTGTTCCTCATATTCCCAAAATTGCTGAAAAAAAAAGTAATC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTTACTTTTTAGGACTGAACAAGAGAAATCTGGTGTTCCTCATATTCCCAAAATTGCTGAAAAAAAAAGTAATC  1924

Query 1925  GCCATTCTATCCAGCATGTGCCAGGAGATATTGAACAGACATCACAGGAGAAAGGAAGTAAGAAAGTTAAAGCA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCCATTCTATCCAGCATGTGCCAGGAGATATTGAACAGACATCACAGGAGAAAGGAAGTAAGAAAGTTAAAGCA  1998

Query 1999  AATACTGTTTCAGGTGGAAGAAACAAAATCAGGAAGATTTTGGATAAAACACGATTTAGTATCTTGCCTCCAAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AATACTGTTTCAGGTGGAAGAAACAAAATCAGGAAGATTTTGGATAAAACACGATTTAGTATCTTGCCTCCAAA  2072

Query 2073  GCTATTTAGTGATGGAGGCCTAAGCCAATCACAAGATGACAGCATTGTGGGAACAAGGCACTGTAGGCATAGTC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCTATTTAGTGATGGAGGCCTAAGCCAATCACAAGATGACAGCATTGTGGGAACAAGGCACTGTAGGCATAGTC  2146

Query 2147  TGGCTATAATGCCCATCCCTGGAACACTCTCATCCAGCAGCCCTGATCTCCTGCAGCCTACCACCAGTATGTTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGGCTATAATGCCCATCCCTGGAACACTCTCATCCAGCAGCCCTGATCTCCTGCAGCCTACCACCAGTATGTTG  2220

Query 2221  GATTTTTCCAATCCTTCAGATATCCCTGATCAAGTTATAAGAGTTTTCAAAGTGGATCAGCAAAGTTGCTACAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GATTTTTCCAATCCTTCAGATATCCCTGATCAAGTTATAAGAGTTTTCAAAGTGGATCAGCAAAGTTGCTACAT  2294

Query 2295  TATCATCAGTAAAGACACCACAGCTAAAGAAGTAGTTTTTCATGCTGTTCATGAATTTGGTTTGACCGGTGCAT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TATCATCAGTAAAGACACCACAGCTAAAGAAGTAGTTTTTCATGCTGTTCATGAATTTGGTTTGACCGGTGCAT  2368

Query 2369  CCGACACATATTCTCTCTGTGAAGTTTCTGTTACTCCTGAGGGTGTCATAAAACAGAGAAGACTTCCAGATCAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CCGACACATATTCTCTCTGTGAAGTTTCTGTTACTCCTGAGGGTGTCATAAAACAGAGAAGACTTCCAGATCAG  2442

Query 2443  TTCTCCAAATTAGCTGATAGAATTCAACTCAATGGAAGGTATTACTTAAAAAATAACATGGAAACAGAAACCTT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TTCTCCAAATTAGCTGATAGAATTCAACTCAATGGAAGGTATTACTTAAAAAATAACATGGAAACAGAAACCTT  2516

Query 2517  ATGTTCAGATGAAGATGCTCAAGAACTAGTTAAGGAAAGCCAGCTATCCATGCTGCAGCTCAGTACCATTGAGG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ATGTTCAGATGAAGATGCTCAAGAACTAGTTAAGGAAAGCCAGCTATCCATGCTGCAGCTCAGTACCATTGAGG  2590

Query 2591  TGGCCACCCAGCTGTCAATGAGGGACTTTGATTTGTTTCGTAATATTGAACCGACTGAGTACATCGATGACCTT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TGGCCACCCAGCTGTCAATGAGGGACTTTGATTTGTTTCGTAATATTGAACCGACTGAGTACATCGATGACCTT  2664

Query 2665  TTTAAGTTAAATTCCAAAACAGGAAATACTCATTTGAAGAGGTTTGAGGACATTGTAAACCAAGAGACATTCTG  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TTTAAGTTAAATTCCAAAACAGGAAATACTCATTTGAAGAGGTTTGAGGACATTGTAAACCAAGAGACATTCTG  2738

Query 2739  GGTTGCCTCAGAAATTTTAACTGAAGCAAATCAGCTCAAACGAATGAAGATTATTAAGCATTTTATTAAAATTG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GGTTGCCTCAGAAATTTTAACTGAAGCAAATCAGCTCAAACGAATGAAGATTATTAAGCATTTTATTAAAATTG  2812

Query 2813  CACTTCATTGTCGAGAATGTAAGAACTTCAATTCCATGTTTGCAATAATAAGTGGCTTGAACCTGGCATCTGTA  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CACTTCATTGTCGAGAATGTAAGAACTTCAATTCCATGTTTGCAATAATAAGTGGCTTGAACCTGGCATCTGTA  2886

Query 2887  GCAAGACTCAGAGGAACTTGGGAAAAGTTACCAAGCAAATACGAGAAACATCTTCAAGATCTACAAGACATTTT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GCAAGACTCAGAGGAACTTGGGAAAAGTTACCAAGCAAATACGAGAAACATCTTCAAGATCTACAAGACATTTT  2960

Query 2961  TGATCCATCTAGAAACATGGCAAAGTATAGAAATATTCTTAGTAGTCAAAGTATGCAGCCTCCAATTATTCCAC  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TGATCCATCTAGAAACATGGCAAAGTATAGAAATATTCTTAGTAGTCAAAGTATGCAGCCTCCAATTATTCCAC  3034

Query 3035  TCTTCCCTGTTGTCAAGAAAGATATGACATTTCTACATGAAGGAAATGACTCCAAAGTAGATGGTTTAGTAAAC  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  TCTTCCCTGTTGTCAAGAAAGATATGACATTTCTACATGAAGGAAATGACTCCAAAGTAGATGGTTTAGTAAAC  3108

Query 3109  TTTGAGAAGTTAAGAATGATTTCCAAGGAAATCCGCCAAGTTGTTCGAATGACTTCTGCTAACATGGACCCAGC  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  TTTGAGAAGTTAAGAATGATTTCCAAGGAAATCCGCCAAGTTGTTCGAATGACTTCTGCTAACATGGACCCAGC  3182

Query 3183  TATGATGTTTCGACAGAGGAAGAAGAGGTGGCGGAGTCTGGGGTCACTGAGTCAAGGAAGCACAAATTCAAACA  3256
            |||||||||||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  TATGATGTTTCGACAGA------------------------GGTCACTGAGTCAAGGAAGCACAAATTCAAACA  3232

Query 3257  TGCTGGATGTTCAGGGAGGTGCTCACAAAAAAAGGGCACGCCGCAGCTCTCTGCTTAATGCCAAGAAGCTATAT  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3233  TGCTGGATGTTCAGGGAGGTGCTCACAAAAAAAGGGCACGCCGCAGCTCTCTGCTTAATGCCAAGAAGCTATAT  3306

Query 3331  GAGGATGCCCAAATGGCAAGGAAGGTGAAGCAGTATCTTTCCAGTCTCGATGTAGAGACAGATGAGGAGAAGTT  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3307  GAGGATGCCCAAATGGCAAGGAAGGTGAAGCAGTATCTTTCCAGTCTCGATGTAGAGACAGATGAGGAGAAGTT  3380

Query 3405  CCAGATGATGTCATTACAGTGGGAGCCTGCATATGGTACCTTGACCAAGAATTTAAGTGAGAAAAGATCAGCCA  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3381  CCAGATGATGTCATTACAGTGGGAGCCTGCATATGGTACCTTGACCAAGAATTTAAGTGAGAAAAGATCAGCCA  3454

Query 3479  AATCATCTGAAATGTCTCCAGTGCCTATGAGGTCAGCTGGCCAAACAACTAAAGCCCACTTGCATCAACCCCAC  3552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3455  AATCATCTGAAATGTCTCCAGTGCCTATGAGGTCAGCTGGCCAAACAACTAAAGCCCACTTGCATCAACCCCAC  3528

Query 3553  AGAGTAAGCCAGGTGCTTCAGGTGCCAGCTGTTAATTTGCACCCCATCAGGAAGAAGGGACAAACAAAAGACCC  3626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3529  AGAGTAAGCCAGGTGCTTCAGGTGCCAGCTGTTAATTTGCACCCCATCAGGAAGAAGGGACAAACAAAAGACCC  3602

Query 3627  TGCACTGAATACAAGTTTACCTCAGAAAGTTTTAGGAACAACTGAAGAAATAAGTGGTAAGAAGCATACAGAAG  3700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3603  TGCACTGAATACAAGTTTACCTCAGAAAGTTTTAGGAACAACTGAAGAAATAAGTGGTAAGAAGCATACAGAAG  3676

Query 3701  ACACTATTTCTGTGGCGTCATCTTTACATTCTAGTCCTCCTGCATCTCCTCAAGGCTCCCCTCACAAAGGTTAC  3774
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|
Sbjct 3677  ACACTATTTCTGTGGCGTCATCTTTACATTCTAGTCCTCCTGCATCTCCTCAAGGCTCCCCTCACAAAGTTGGC  3750

Query 3775  ACACTTATTCCATCAGCTAAATCTGACAACTTGTCTGACTCCAGCCATAGTGAGATTTCTTCACGGTCCAGCAT  3848
            |   .|||  |||       ||||||                                  |||     ||||  
Sbjct 3751  A---GTAT--CAT-------ATCTGA----------------------------------TCA-----CAGC--  3771

Query 3849  CGTGAGCAATTGTTCTGTTGACTCCATGTCTGCAGCTCTACAGGATGAACGGTGTTCCTCTCAGGCCCTGGCAG  3922
                |||||  |.||.||                                             ||||...||.|
Sbjct 3772  ----AGCAA--GATCAGT---------------------------------------------GGCCAGAGCTG  3794

Query 3923  TCCCTGAATCCA-CTGGGGC---ATTGGAAAAGACAGAGCACGCTTCAGGGAT----AGGAGATCATAGTC---  3985
            .|||.||||  | .||||||   .|||.||||||.|    |..|||||  |||    |||||  ||.||.|   
Sbjct 3795  CCCCGGAAT--AGGTGGGGCTTACTTGCAAAAGAAA----ATCCTTCA--GATTACCAGGAG--CACAGCCAAA  3858

Query 3986  --AACATGGCCCTGGGTGGACACTCTTGAAGCCATCTCTAATCAAGTGTTTAGCTGTCTCATCGTCTGTGAGCA  4057
              ||||            ||||.|..|||             .|||      ||                  ||
Sbjct 3859  AGAACA------------GACAGTACTGA-------------GAAG------GC------------------CA  3883

Query 4058  ATGAAGAGATTTCTCAAGAGCATATCATTATAGAAGCAGCTGACAGTGGTCGTGGAAGTTGGACTTCGTGTTCA  4131
            .|||.||||                    |||||..|||  |||           ||||||             
Sbjct 3884  CTGAGGAGA--------------------ATAGAGACAG--GAC-----------AAGTTG-------------  3911

Query 4132  AGCAGCTCCCATGACAACTTCCAAAGCCTTCCAAACCCAAAAAGCTGGGATTTTTTGAACTCTTACAGACATAC  4205
                       |||.|||            .|||.|..||||||                    |..|||||.|
Sbjct 3912  -----------TGAGAAC------------ACAACCAGAAAAAG--------------------AATGACATCC  3942

Query 4206  CCATTTGGATGACCCCATTGCTGAAGTTGAACCCACTGACTCT-------GAGCCCTATTCCTGTTCTAAAAGC  4272
            ||.|||.||.|||    ||...|||  .|||     || ||.|       ||| .|||.||       ||.|||
Sbjct 3943  CCGTTTAGAAGAC----TTAGGGAA--AGAA-----TG-CTTTCAAGGGAGAG-ACTAGTC-------AACAGC  3996

Query 4273  TGCTCTAGAACTTGTGGGCAGTG-------------TAAAGGAAGCCTAGAGAGAAAGAGTTGGACCTCCTCCA  4333
                |.|.||   |.||.||..|             ||.||.||||  .|.|||||||.|..|||         
Sbjct 3997  ----CAAAAA---GAGGACACAGATCACAATCAAGCTACAGAAAGC--TGTGAGAAAGTGAAGGA---------  4052

Query 4334  GTTCTCTGTCTGACACGTATGAACCAAACTATGGGACAGTTAAACAGA-GAGTATTGGAGAGCACCCCAGCTGA  4406
                  ||| ||        |||.||         ||| |.||  ||| |||.|..||||.|    |||.||  
Sbjct 4053  ------TGT-TG--------GAAGCA---------ACA-TCAA--AGATGAGAAAGGGAGTG----CCATCT--  4093

Query 4407  GTCATCTGA---AGGCTTGGACCCCAAGGATGCCACTGACCCAGTTTATAAAACTGTCACTTCAAGTACAGAAA  4477
             |||..|.|   ||         |||||   ||.||.|...||.|||   ||||||   ||||.| |||     
Sbjct 4094  -TCAATTCAAATAG---------CCAAG---GCAACAGTAACACTTT---AAACTG---CTTCTA-TAC-----  4142

Query 4478  AGGGCTTGATT------GAAAATGAACAAGTTTCAGCAGTC  4512
               ||  ||||      .||||.||..|||     .||.||
Sbjct 4143  ---GC--GATTCAAGTCTAAAAGGAGGAAG-----ACACTC  4173