Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08342
Subject:
NM_001252494.1
Aligned Length:
1618
Identities:
1369
Gaps:
126

Alignment

Query    1  MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQVLFCSETIARCW  74
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNIIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSTRARYERYSGNQMLFCSETIARCW  74

Query   75  YILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENAKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYK  148
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  YILLSGSVLVKDSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENSKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYK  148

Query  149  GERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTR  222
            ||||||.|.|..|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GERQTIIDGVDINNYLSLPADLTKMHLTDNPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTR  222

Query  223  LPEGPVDSEDDEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVM  296
            ||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  LPEGPVDSEDEEEEEEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDVEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVM  296

Query  297  IFEVVEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVC  370
            .|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||.||||||||||||
Sbjct  297  VFEVVEQAGAVILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGIVPTLDKQHMHGAVRTKVDDCQFVC  370

Query  371  IAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFL  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  IAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFL  444

Query  445  LTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLL  518
            ||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  LTYRTFLETPLDVGIKLLEWFKIDNLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTQFLEEFERNLEDTKMNGHLRLL  518

Query  519  NIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFM  592
            ||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||||.|||.||.||||||.|||||||.||||||||||||..
Sbjct  519  NIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLHFCLTGGSEKGFGVFVEEVESGSKAADAGLKRGDQVMEVNGQNFENITLA  592

Query  593  KAVEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKGSKKVKA  666
            ||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||..||||.||.||
Sbjct  593  KALEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLSRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQDVPGDMEQAPQEKGNKKIKA  666

Query  667  NTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSML  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  NTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSML  740

Query  741  DFSNPSD-----IPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQR  809
            ||||||.     ||||||||||.|||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  DFSNPSAVGFYYIPDQVIRVFKADQQSCYIIISKDTTAKEVVCQAVQEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQR  814

Query  810  RLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTE  883
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  RLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTE  888

Query  884  YIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGL  957
            ||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  YIDDLFKLDSKTGNTHLKQFEDIVNQETFWVASEILSESNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGL  962

Query  958  NLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKV  1031
            |||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  NLAPVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDLFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKV  1036

Query 1032  DGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLN  1105
            ||||||||||||.||||...||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  DGLVNFEKLRMIAKEIRHIIRMTSANMDPAMMFRQR--------SLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLN  1102

Query 1106  AKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAH  1179
            ||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|.|
Sbjct 1103  AKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDIDTDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLTEKRSAKSSEMSPVPLRSVGQTAKVH  1176

Query 1180  LHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGS  1253
            ||||||||||||||||||||||||||.||..|.||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1177  LHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQAKDHVLSTSLPQKGLGPTEEVSVKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQNS  1250

Query 1254  PHKGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEHASGIGDH  1327
            |.|||||.||.|.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||..|||||.|||||||.|.|||.||
Sbjct 1251  PRKGYTLTPSSKCDNLSDSSHSEISSRSSIVSNGSVDSMSAAGQDERCSSHSLAVPEPTGALEKTDHPSGISDH  1324

Query 1328  SQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRH  1401
            ||...||.|.||.|||..|||||.|.||.|.||...||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 1325  SQLAHGWMLSKPCLIKGVAVSSSLSSEEMSHEHVVLEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLQNQKSWDFLNSYRH  1398

Query 1402  THLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSLSDTYEPNYGTVKQRVLESTPAESS  1471
            .|||||||||||||.||..|.|.|||||||||||||    |.||.||||||||.||||||||.|||||.|||..
Sbjct 1399  MHLDDPIAEVEPTDCEPCACPKGCSRTCGQCKGSLETNQLRQSWASSSSLSDTCEPNYGTVKRRVLESAPAEAP  1472

Query 1472  EGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQVSAV-----------------------------------------  1504
            .||.|.|.||||||||||||.||||    |..|                                         
Sbjct 1473  DGLEPRDTTDPVYKTVTSSTDKGLI----VYCVTSPKKGDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPHPHLKPPDYS  1542

Query 1505  ----------------------------------------------------------------  1504
                                                                            
Sbjct 1543  VAVQRSKMMLNSLSRLPPAPPSSHTSAWVPSKIGSQPQRHSHPKLADVADADSEADENEQVSAV  1606