Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08342
• Subject: NM_001252496.1
• Aligned Length: 1513
• Identities: 1383
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQVLFCSETIARCW  74
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNIIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSTRARYERYSGNQMLFCSETIARCW  74

Query   75  YILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENAKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYK  148
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  YILLSGSVLVKDSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENSKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYK  148

Query  149  GERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTR  222
            ||||||.|.|..|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GERQTIIDGVDINNYLSLPADLTKMHLTDNPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTR  222

Query  223  LPEGPVDSEDDEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVM  296
            ||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  LPEGPVDSEDEEEEEEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDVEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVM  296

Query  297  IFEVVEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVC  370
            .|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||.||||||||||||
Sbjct  297  VFEVVEQAGAVILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGIVPTLDKQHMHGAVRTKVDDCQFVC  370

Query  371  IAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFL  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  IAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFL  444

Query  445  LTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLL  518
            ||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  LTYRTFLETPLDVGIKLLEWFKIDNLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTQFLEEFERNLEDTKMNGHLRLL  518

Query  519  NIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFM  592
            ||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||||.|||.||.||||||.|||||||.||||||||||||..
Sbjct  519  NIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLHFCLTGGSEKGFGVFVEEVESGSKAADAGLKRGDQVMEVNGQNFENITLA  592

Query  593  KAVEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKGSKKVKA  666
            ||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||..||||.||.||
Sbjct  593  KALEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLSRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQDVPGDMEQAPQEKGNKKIKA  666

Query  667  NTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSML  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  NTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSML  740

Query  741  DFSNPSD-----IPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQR  809
            ||||||.     ||||||||||.|||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  DFSNPSAVGFYYIPDQVIRVFKADQQSCYIIISKDTTAKEVVCQAVQEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQR  814

Query  810  RLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTE  883
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  RLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTE  888

Query  884  YIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGL  957
            ||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  YIDDLFKLDSKTGNTHLKQFEDIVNQETFWVASEILSESNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGL  962

Query  958  NLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKV  1031
            |||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  NLAPVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDLFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKV  1036

Query 1032  DGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLN  1105
            ||||||||||||.||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  DGLVNFEKLRMIAKEIRHIIRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLN  1110

Query 1106  AKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAH  1179
            ||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|.|
Sbjct 1111  AKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDIDTDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLTEKRSAKSSEMSPVPLRSVGQTAKVH  1184

Query 1180  LHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGS  1253
            ||||||||||||||||||||||||||.||..|.||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  LHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQAKDHVLSTSLPQKGLGPTEEVSVKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQNS  1258

Query 1254  PHKGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEHASGIGDH  1327
            |.|||||.||.|.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||..|||||.|||||||.|.|||.||
Sbjct 1259  PRKGYTLTPSSKCDNLSDSSHSEISSRSSIVSNGSVDSMSAAGQDERCSSHSLAVPEPTGALEKTDHPSGISDH  1332

Query 1328  SQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRH  1401
            ||...||.|.||.|||..|||||.|.||.|.||...||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 1333  SQLAHGWMLSKPCLIKGVAVSSSLSSEEMSHEHVVLEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLQNQKSWDFLNSYRH  1406

Query 1402  THLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSLSDTYEPNYGTVKQRVLESTPAESS  1471
            .|||||||||||||.||..|.|.|||||||||||||    |.||.||||||||.||||||||.|||||.|||..
Sbjct 1407  MHLDDPIAEVEPTDCEPCACPKGCSRTCGQCKGSLETNQLRQSWASSSSLSDTCEPNYGTVKRRVLESAPAEAP  1480

Query 1472  EGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQVSAV  1504
            .||.|.|.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481  DGLEPRDTTDPVYKTVTSSTDKGLIENEQVSAV  1513