Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08342
Subject:
NM_175258.4
Aligned Length:
1613
Identities:
1370
Gaps:
121

Alignment

Query    1  MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQVLFCSETIARCW  74
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNIIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSTRARYERYSGNQMLFCSETIARCW  74

Query   75  YILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENAKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYK  148
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  YILLSGSVLVKDSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENSKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYK  148

Query  149  GERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTR  222
            ||||||.|.|..|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GERQTIIDGVDINNYLSLPADLTKMHLTDNPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTR  222

Query  223  LPEGPVDSEDDEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVM  296
            ||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  LPEGPVDSEDEEEEEEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDVEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVM  296

Query  297  IFEVVEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVC  370
            .|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||.||||||||||||
Sbjct  297  VFEVVEQAGAVILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGIVPTLDKQHMHGAVRTKVDDCQFVC  370

Query  371  IAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFL  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  IAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFL  444

Query  445  LTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLL  518
            ||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  LTYRTFLETPLDVGIKLLEWFKIDNLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTQFLEEFERNLEDTKMNGHLRLL  518

Query  519  NIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFM  592
            ||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||||.|||.||.||||||.|||||||.||||||||||||..
Sbjct  519  NIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLHFCLTGGSEKGFGVFVEEVESGSKAADAGLKRGDQVMEVNGQNFENITLA  592

Query  593  KAVEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKGSKKVKA  666
            ||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||..||||.||.||
Sbjct  593  KALEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLSRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQDVPGDMEQAPQEKGNKKIKA  666

Query  667  NTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSML  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  NTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSML  740

Query  741  DFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQ  814
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  DFSNPSDIPDQVIRVFKADQQSCYIIISKDTTAKEVVCQAVQEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQ  814

Query  815  FSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDL  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  FSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDL  888

Query  889  FKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASV  962
            |||.|||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  889  FKLDSKTGNTHLKQFEDIVNQETFWVASEILSESNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPV  962

Query  963  ARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKVDGLVN  1036
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDLFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKVDGLVN  1036

Query 1037  FEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLY  1110
            |||||||.||||...||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  FEKLRMIAKEIRHIIRMTSANMDPAMMFRQR--------SLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLNAKKLY  1102

Query 1111  EDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQPH  1184
            |||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|.||||||
Sbjct 1103  EDAQMARKVKQYLSSLDIDTDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLTEKRSAKSSEMSPVPLRSVGQTAKVHLHQPH  1176

Query 1185  RVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPHKGY  1258
            |||||||||||||||||||||.||..|.||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1177  RVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQAKDHVLSTSLPQKGLGPTEEVSVKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQNSPRKGY  1250

Query 1259  TLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEHASGIGDHSQHGP  1332
            ||.||.|.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||..|||||.|||||||.|.|||.||||...
Sbjct 1251  TLTPSSKCDNLSDSSHSEISSRSSIVSNGSVDSMSAAGQDERCSSHSLAVPEPTGALEKTDHPSGISDHSQLAH  1324

Query 1333  GWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLDD  1406
            ||.|.||.|||..|||||.|.||.|.||...||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||
Sbjct 1325  GWMLSKPCLIKGVAVSSSLSSEEMSHEHVVLEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLQNQKSWDFLNSYRHMHLDD  1398

Query 1407  PIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSLSDTYEPNYGTVKQRVLESTPAESSEGLDP  1476
            |||||||||.||..|.|.|||||||||||||    |.||.||||||||.||||||||.|||||.|||...||.|
Sbjct 1399  PIAEVEPTDCEPCACPKGCSRTCGQCKGSLETNQLRQSWASSSSLSDTCEPNYGTVKRRVLESAPAEAPDGLEP  1472

Query 1477  KDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQVSAV----------------------------------------------  1504
            .|.||||||||||||.||||    |..|                                              
Sbjct 1473  RDTTDPVYKTVTSSTDKGLI----VYCVTSPKKGDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPHPHLKPPDYSVAVQR  1542

Query 1505  -----------------------------------------------------------  1504
                                                                       
Sbjct 1543  SKMMLNSLSRLPPAPPSSHTSAWVPSKIGSQPQRHSHPKLADVADADSEADENEQVSAV  1601