Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08342
• Subject: XM_006532563.3
• Aligned Length: 1618
• Identities: 1272
• Gaps: 213

Alignment

Query    1  MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQVLFCSETIARCW  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  YILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENAKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYK  148
                   .||........|   |.|.|          ||. ..|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------MLVYPAFWICTC---KRFYG----------PSS-LQVENSKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYK  53

Query  149  GERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTR  222
            ||||||.|.|..|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   54  GERQTIIDGVDINNYLSLPADLTKMHLTDNPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTR  127

Query  223  LPEGPVDSEDDEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVM  296
            ||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  128  LPEGPVDSEDEEEEEEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDVEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVM  201

Query  297  IFEVVEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVC  370
            .|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||.||||||||||||
Sbjct  202  VFEVVEQAGAVILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGIVPTLDKQHMHGAVRTKVDDCQFVC  275

Query  371  IAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFL  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  IAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFL  349

Query  445  LTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLL  518
            ||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  350  LTYRTFLETPLDVGIKLLEWFKIDNLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTQFLEEFERNLEDTKMNGHLRLL  423

Query  519  NIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFM  592
            ||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||||.|||.||.||||||.|||||||.||||||||||||..
Sbjct  424  NIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLHFCLTGGSEKGFGVFVEEVESGSKAADAGLKRGDQVMEVNGQNFENITLA  497

Query  593  KAVEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIEQTSQEKGSKKVKA  666
            ||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||..||||.||.||
Sbjct  498  KALEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLSRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQDVPGDMEQAPQEKGNKKIKA  571

Query  667  NTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSML  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  NTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSPDLLQPTTSML  645

Query  741  DFSNPSD-----IPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQR  809
            ||||||.     ||||||||||.|||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  DFSNPSAVGFYYIPDQVIRVFKADQQSCYIIISKDTTAKEVVCQAVQEFGLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQR  719

Query  810  RLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTE  883
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  RLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTE  793

Query  884  YIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGL  957
            ||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  YIDDLFKLDSKTGNTHLKQFEDIVNQETFWVASEILSESNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGL  867

Query  958  NLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKV  1031
            |||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  NLAPVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDLFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKV  941

Query 1032  DGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLN  1105
            ||||||||||||.||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  DGLVNFEKLRMIAKEIRHIIRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKRARRSSLLN  1015

Query 1106  AKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAH  1179
            ||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|.|
Sbjct 1016  AKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDIDTDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLTEKRSAKSSEMSPVPLRSVGQTAKVH  1089

Query 1180  LHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGS  1253
            ||||||||||||||||||||||||||.||..|.||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1090  LHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQAKDHVLSTSLPQKGLGPTEEVSVKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQNS  1163

Query 1254  PHKGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTEHASGIGDH  1327
            |.|||||.||.|.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||..|||||.|||||||.|.|||.||
Sbjct 1164  PRKGYTLTPSSKCDNLSDSSHSEISSRSSIVSNGSVDSMSAAGQDERCSSHSLAVPEPTGALEKTDHPSGISDH  1237

Query 1328  SQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRH  1401
            ||...||.|.||.|||..|||||.|.||.|.||...||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 1238  SQLAHGWMLSKPCLIKGVAVSSSLSSEEMSHEHVVLEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLQNQKSWDFLNSYRH  1311

Query 1402  THLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSLSDTYEPNYGTVKQRVLESTPAESS  1471
            .|||||||||||||.||..|.|.|||||||||||||    |.||.||||||||.||||||||.|||||.|||..
Sbjct 1312  MHLDDPIAEVEPTDCEPCACPKGCSRTCGQCKGSLETNQLRQSWASSSSLSDTCEPNYGTVKRRVLESAPAEAP  1385

Query 1472  EGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQVSAV-----------------------------------------  1504
            .||.|.|.||||||||||||.||||    |..|                                         
Sbjct 1386  DGLEPRDTTDPVYKTVTSSTDKGLI----VYCVTSPKKGDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPHPHLKPPDYS  1455

Query 1505  ----------------------------------------------------------------  1504
                                                                            
Sbjct 1456  VAVQRSKMMLNSLSRLPPAPPSSHTSAWVPSKIGSQPQRHSHPKLADVADADSEADENEQVSAV  1519