Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08342
• Subject: XM_006532565.3
• Aligned Length: 1631
• Identities: 1223
• Gaps: 291

Alignment

Query    1  MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQVLFCSETIARCW  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  YILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENAKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYK  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GERQTITDDVEVNSYL-------------SLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQ  209
                        ...|             .|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------MAFLVRCYANCLQPWASKLPADLTKMHLTDNPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQ  62

Query  210  ATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFAN  283
            |||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct   63  ATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDEEEEEEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDVEQLLEFMHQLPAFAN  136

Query  284  MTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHG  357
            |||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||
Sbjct  137  MTMSVRRELCSVMVFEVVEQAGAVILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGIVPTLDKQHMHG  210

Query  358  IVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEE  431
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  211  AVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEE  284

Query  432  HSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKN  505
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct  285  HSIVDPTYIEDFLLTYRTFLETPLDVGIKLLEWFKIDNLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTQFLEEFERN  358

Query  506  LEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIM  579
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||||.|||.||.||||||.|||||||.|
Sbjct  359  LEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLHFCLTGGSEKGFGVFVEEVESGSKAADAGLKRGDQVM  432

Query  580  EVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIE  653
            |||||||||||..||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct  433  EVNGQNFENITLAKALEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLSRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQDVPGDME  506

Query  654  QTSQEKGSKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSS  727
            |..||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  QAPQEKGNKKIKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSS  580

Query  728  SSPDLLQPTTSMLDFSNPSD-----IPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGASDTYSLC  796
            |||||||||||||||||||.     ||||||||||.|||||||||||||||||||..||.||||||||||||||
Sbjct  581  SSPDLLQPTTSMLDFSNPSAVGFYYIPDQVIRVFKADQQSCYIIISKDTTAKEVVCQAVQEFGLTGASDTYSLC  654

Query  797  EVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSM  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  655  EVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLKESQLSMLQLSTIEVATQLSM  728

Query  871  RDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCREC  944
            |||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  RDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLDSKTGNTHLKQFEDIVNQETFWVASEILSESNQLKRMKIIKHFIKIALHCREC  802

Query  945  KNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKK  1018
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  KNFNSMFAIISGLNLAPVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDLFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKK  876

Query 1019  DMTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGG  1092
            |||||||||||||||||||||||||.||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  DMTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHIIRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGG  950

Query 1093  AHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSP  1166
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  951  AHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDIDTDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLTEKRSAKSSEMSP  1024

Query 1167  VPMRSAGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVAS  1240
            ||.||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||.||..|.||||||.||.|||.|.||||||||||||
Sbjct 1025  VPLRSVGQTAKVHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQAKDHVLSTSLPQKGLGPTEEVSVKKHTEDTISVAS  1098

Query 1241  SLHSSPPASPQGSPHKGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGA  1314
            |||||||||||.||.|||||.||.|.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||..|||||.|||
Sbjct 1099  SLHSSPPASPQNSPRKGYTLTPSSKCDNLSDSSHSEISSRSSIVSNGSVDSMSAAGQDERCSSHSLAVPEPTGA  1172

Query 1315  LEKTEHASGIGDHSQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLP  1388
            ||||.|.|||.||||...||.|.||.|||..|||||.|.||.|.||...||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1173  LEKTDHPSGISDHSQLAHGWMLSKPCLIKGVAVSSSLSSEEMSHEHVVLEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLQ  1246

Query 1389  NPKSWDFLNSYRHTHLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSLSDTYEPNYGTV  1458
            |.|||||||||||.|||||||||||||.||..|.|.|||||||||||||    |.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1247  NQKSWDFLNSYRHMHLDDPIAEVEPTDCEPCACPKGCSRTCGQCKGSLETNQLRQSWASSSSLSDTCEPNYGTV  1320

Query 1459  KQRVLESTPAESSEGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQVSAV----------------------------  1504
            |.|||||.|||...||.|.|.||||||||||||.||||    |..|                            
Sbjct 1321  KRRVLESAPAEAPDGLEPRDTTDPVYKTVTSSTDKGLI----VYCVTSPKKGDRYREPPPTPPGYLGISLADLK  1390

Query 1505  --------------------------------------------------------------------------  1504
                                                                                      
Sbjct 1391  EGPHPHLKPPDYSVAVQRSKMMLNSLSRLPPAPPSSHTSAWVPSKIGSQPQRHSHPKLADVADADSEADENEQV  1464

Query 1505  ---  1504
               
Sbjct 1465  SAV  1467