Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08342
• Subject: XM_006532566.3
• Aligned Length: 1626
• Identities: 1224
• Gaps: 286

Alignment

Query    1  MNSPVDPGARQALRKKPPERTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQVLFCSETIARCW  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  YILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGKQFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENAKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYK  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GERQTITDDVEVNSYL-------------SLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQ  209
                        ...|             .|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------MAFLVRCYANCLQPWASKLPADLTKMHLTDNPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQ  62

Query  210  ATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFAN  283
            |||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct   63  ATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDEEEEEEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDVEQLLEFMHQLPAFAN  136

Query  284  MTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHG  357
            |||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||
Sbjct  137  MTMSVRRELCSVMVFEVVEQAGAVILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKIENLFMGNSFGIVPTLDKQHMHG  210

Query  358  IVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEE  431
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  211  AVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEE  284

Query  432  HSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKN  505
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct  285  HSIVDPTYIEDFLLTYRTFLETPLDVGIKLLEWFKIDNLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTQFLEEFERN  358

Query  506  LEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIM  579
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||||.|||.||.||||||.|||||||.|
Sbjct  359  LEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLHFCLTGGSEKGFGVFVEEVESGSKAADAGLKRGDQVM  432

Query  580  EVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLFRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQHVPGDIE  653
            |||||||||||..||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct  433  EVNGQNFENITLAKALEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELLSRTEQEKSGVPHIPKIAEKKSNRHSIQDVPGDME  506

Query  654  QTSQEKGSKKVKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSS  727
            |..||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  QAPQEKGNKKIKANTVSGGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSS  580

Query  728  SSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGASDTYSLCEVSVT  801
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||
Sbjct  581  SSPDLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKADQQSCYIIISKDTTAKEVVCQAVQEFGLTGASDTYSLCEVSVT  654

Query  802  PEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDL  875
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  PEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDL  728

Query  876  FRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNS  949
            ||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  FRNIEPTEYIDDLFKLDSKTGNTHLKQFEDIVNQETFWVASEILSESNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNS  802

Query  950  MFAIISGLNLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFL  1023
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  MFAIISGLNLAPVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDLFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFL  876

Query 1024  HEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKR  1097
            ||||||||||||||||||||.||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  HEGNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHIIRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDVQGGAHKKR  950

Query 1098  ARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRS  1171
            ||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  951  ARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDIDTDEEKFQMMSLQWEPAYGTLTKNLTEKRSAKSSEMSPVPLRS  1024

Query 1172  AGQTTKAHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQTKDPALNTSLPQKVLGTTEEISGKKHTEDTISVASSLHSS  1245
            .|||.|.|||||||||||||||||||||||||||.||..|.||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||
Sbjct 1025  VGQTAKVHLHQPHRVSQVLQVPAVNLHPIRKKGQAKDHVLSTSLPQKGLGPTEEVSVKKHTEDTISVASSLHSS  1098

Query 1246  PPASPQGSPHKGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGALEKTE  1319
            ||||||.||.|||||.||.|.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||..|||||.|||||||.
Sbjct 1099  PPASPQNSPRKGYTLTPSSKCDNLSDSSHSEISSRSSIVSNGSVDSMSAAGQDERCSSHSLAVPEPTGALEKTD  1172

Query 1320  HASGIGDHSQHGPGWTLLKPSLIKCLAVSSSVSNEEISQEHIIIEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSW  1393
            |.|||.||||...||.|.||.|||..|||||.|.||.|.||...||||||||||||||||||||||||.|.|||
Sbjct 1173  HPSGISDHSQLAHGWMLSKPCLIKGVAVSSSLSSEEMSHEHVVLEAADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLQNQKSW  1246

Query 1394  DFLNSYRHTHLDDPIAEVEPTDSEPYSCSKSCSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSLSDTYEPNYGTVKQRVL  1463
            ||||||||.|||||||||||||.||..|.|.|||||||||||||    |.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1247  DFLNSYRHMHLDDPIAEVEPTDCEPCACPKGCSRTCGQCKGSLETNQLRQSWASSSSLSDTCEPNYGTVKRRVL  1320

Query 1464  ESTPAESSEGLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQVSAV---------------------------------  1504
            ||.|||...||.|.|.||||||||||||.||||    |..|                                 
Sbjct 1321  ESAPAEAPDGLEPRDTTDPVYKTVTSSTDKGLI----VYCVTSPKKGDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPHP  1390

Query 1505  ------------------------------------------------------------------------  1504
                                                                                    
Sbjct 1391  HLKPPDYSVAVQRSKMMLNSLSRLPPAPPSSHTSAWVPSKIGSQPQRHSHPKLADVADADSEADENEQVSAV  1462