Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09614
• Subject: NM_133940.3
• Aligned Length: 1256
• Identities: 1131
• Gaps: 58

Alignment

Query    1  ATGGAGACCCACATCTCATGCCTGTTCCCGGAGCTGCTGGCCATGATCTTCGGCTACCTGGACGTCCGGGACAA  74
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Sbjct    1  ATGGAGACCCACATCTCGTGCCTGTTCCCCGAGCTGCTGGCCATGATCTTCGGCTACTTGGACGTCCGAGACAA  74

Query   75  GGGGCGCGCGGCGCAGGTGTGCACCGCCTGGCGGGACGCCGCCTACCACAAGTCGGTGTGGCGGGGGGTGGAGG  148
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GGGTCGCGCGGCGCAGGTGTGCACGGCCTGGCGGGACGCCGCCTACCACAAGTCGGTGTGGCGGGGCGTGGAGG  148

Query  149  CCAAGCTGCACCTGCGCCGGGCCAACCCGTCGCTGTTCCCCAGCCTGCAGGCCCGGGGCATCCGCCGGGTGCAG  222
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Sbjct  149  CCAAGCTGCACCTGCGCCGGGCGAACCCGTCGCTGTTCCCCAGCCTGCAGGCCCGGGGCATCCGCCGCGTGCAG  222

Query  223  ATCCTGAGCCTCCGCCGCAGCCTCAGCTACGTGATCCAGGGCATGGCCAACATCGAGAGCCTCAACCTCAGCGG  296
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCCTCAGCCTCCGCCGCAGCCTCAGCTACGTGATCCAGGGCATGGCGAACATCGAGAGCCTCAACCTCAGCGG  296

Query  297  CTGCTACAACCTCACCGACAACGGGCTGGGCCACGCGTTTGTGCAGGAGATCGGCTCCCTGCGCGCTCTCAACC  370
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Sbjct  297  CTGCTACAACCTCACCGACAACGGCCTGGGCCACGCGTTCGTGCAGGAGATCGGCTCGCTGCGCGCTCTCAACT  370

Query  371  TGAGCCTCTGCAAGCAGATCACTGACAGCAGCCTGGGCCGCATAGCCCAGTACCTCAAGGGCCTGGAGGTGCTG  444
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Sbjct  371  TGAGCCTTTGCAAGCAGATCACCGACAGCAGCCTGGGCCGCATAGCCCAGTACCTCAAGGGCCTGGAGGTGCTG  444

Query  445  GAGCTGGGAGGTTGCAGCAACATCACCAACACTGGCCTTCTGCTCATCGCCTGGGGTCTGCAGCGCCTCAAGAG  518
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Sbjct  445  GAGCTGGGGGGCTGCAGCAACATCACCAACACCGGCCTTCTGCTCATTGCCTGGGGGCTGCAGCGCCTCAAGAG  518

Query  519  CCTTAACCTCCGCAGCTGCCGCCACCTTTCGGATGTGGGCATCGGGCACCTGGCCGGCATGACGCGCAGCGCGG  592
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Sbjct  519  CCTTAATCTCCGCAGCTGTCGCCACCTCTCGGATGTGGGCATCGGGCACCTGGCCGGCATGACGCGCAGCGCTG  592

Query  593  CGGAGGGCTGCCTGGGCCTGGAGCAGCTCACGCTACAGGACTGCCAGAAGCTCACAGATCTTTCTCTAAAGCAC  666
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Sbjct  593  CCGAGGGCTGCCTGGGCCTGGAGCAGCTCACTCTTCAGGACTGCCAGAAACTCACGGATCTTTCCCTGAAGCAC  666

Query  667  ATCTCCCGAGGGCTGACGGGCTTGAGGCTCCTCAACCTCAGCTTCTGTGGGGGAATCTCGGACGCTGGCCTCCT  740
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Sbjct  667  ATCTCGCGAGGGCTGACGGGCCTCCGGCTCCTCAACCTCAGCTTCTGCGGCGGCATCTCGGACGCGGGCCTTCT  740

Query  741  GCACCTGTCGCACATGGGCAGCCTGCGCAGCCTCAACCTGCGCTCCTGTGACAACATCAGTGACACGGGCATCA  814
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Sbjct  741  GCACCTGTCGCACATGGGCAGCCTGCGCAGCCTGAACCTGCGCTCCTGCGACAACATCAGCGACACCGGCATCA  814

Query  815  TGCATCTGGCCATGGGCAGCCTGCGCCTCTCGGGGCTGGATGTTTCGTTCTGTGACAAGGTGGGAGACCAGAGT  888
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Sbjct  815  TGCATCTGGCCATGGGCAGCCTGCGCCTTTCCGGTCTGGATGTGTCGTTCTGTGACAAGGTGGGAGATCAGAGT  888

Query  889  CTGGCTTACATAGCCCAGGGGCTGGATGGCCTCAAGTCTCTCTCCCTCTGCTCCTGCCACATCAGTGATGATGG  962
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Sbjct  889  CTGGCGTACATAGCCCAGGGACTGGACGGCCTCAAGTCCCTCTCCCTTTGCTCTTGCCATATCAGTGACGATGG  962

Query  963  CATCAACCGCATGGTGCGGCAGATGCACGGGCTGCGCACGCTCAACATTGGACAGTGTGTGCGCATCACGGACA  1036
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Sbjct  963  CATCAACCGCATGGTGCGGCAGATGCACGGGCTGCGCACGCTCAACATTGGACAGTGTGTGCGCATCACGGACA  1036

Query 1037  AGGGCCTGGAGCTGATCGCTGAGCACCTGAGCCAACTCACCGGCATAGACCTGTACGGCTGCACCCGAATCACC  1110
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Sbjct 1037  AGGGCCTGGAGCTGATCGCTGAGCACCTGAGCCAGCTCACGGGCATAGATCTGTACGGCTGCACCAGGATCACC  1110

Query 1111  AAGCGCGGCCTGGAGCGCATCACGCAGCTGCCGTGCCTCAAGGTACTCAACCTGGGACTCTGGCAGATGACGGA  1184
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Sbjct 1111  AAGCGCGGCCTGGAGCGCATCACGCAGCTGCCCTGCCTCAAGGTACTTAACCTGGGACTTTGGCAGATGACGGA  1184

Query 1185  CAGTGAGAAGG--AGGCACGAGGGGATTTTTCTCCATTATTCACTGTGAGAACTCGGGGAAGCTCCAGAAGG  1254
            |||||||||||  |||                                                        
Sbjct 1185  CAGTGAGAAGGTCAGG--------------------------------------------------------  1200