Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11058
• Subject: NM_001310683.1
• Aligned Length: 1285
• Identities: 851
• Gaps: 335

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCAAAAGCAAGGTGGACAACCAGTTCTACAGTGTGGAAGTGGGGGACTCAACCTTCACCGTTCTTAAGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTACCAGAACCTGAAGCCAATTGGCTCTGGGGCTCAGGGAATAGTCTGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGACA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTTCCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCTG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTATTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGGA  296

Query    1  -------------------------ATGGAACTGATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAG  49
                                     ||||||||||||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||..|.|
Sbjct  297  GGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTGATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTGG  370

Query   50  ACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATT  123
            ||||.|||||.|||||||||.||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.
Sbjct  371  ACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGATGCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCATC  444

Query  124  CACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGC  197
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  445  CACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGGC  518

Query  198  CAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCC  271
            |||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCGTATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCC  592

Query  272  TGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACATGTGGTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATG-------ATAAA  338
            ||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||       |.|||
Sbjct  593  TGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTGGACATATGGTCTGTGGGATGCATCATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAA  666

Query  339  AGGTGCAGTGCTGTTTCCTGGCACTGATCATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCAT  412
            |       |.||.|||||.||.|..||..||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.|
Sbjct  667  A-------TCCTCTTTCCCGGAAGGGACTATATTGACCAGTGGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGT  733

Query  413  GTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTC  486
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  734  GTCCAGAGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGTCAGAAACTACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTC  807

Query  487  ACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGC  560
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  808  ACCTTCCCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGATTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGC  881

Query  561  CAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATC  634
            ||||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||..|.|||||||
Sbjct  882  CAGGGATTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGACCCAGCGAAGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATC  955

Query  635  CCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGAT  708
            |.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct  956  CGTACATCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGTGGAGGCGCCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGAT  1029

Query  709  GAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAA  782
            |||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1030  GAAAGGGAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAA  1103

Query  783  AAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCT  856
            .|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  GAATGGCGTAGTCAAAGGCCAGCCCTCGCCTTCAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCT  1177

Query  857  CGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCC  930
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1178  CGTCTGTCAACGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTCGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAGGCC  1251

Query  931  TCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG  957
            |||||.|||||..||||||||||||||
Sbjct 1252  TCGGCGGGACCGTTGGGTTGTTGCAGG  1278