Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12975
• Subject: XM_011545352.2
• Aligned Length: 2566
• Identities: 1515
• Gaps: 1043

Alignment

Query    1  -------ATGCCATCAACATCCTGCAGAATGAAA----------------------------------------  27
                   |||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct    1  ATGGATGATGCCATCAACATCCTGCAGAATGAAAAGTCTCATCAAGTCCTAGCTCAACTGCTGGATACTTTGCT  74

Query   28  -------------------------------------------------------------------CATCTGA  34
                                                                               |||||||
Sbjct   75  TGCAATTGGCACTAAGCTACCAGAGAATCAAGCTATCCAAATGCGATTAGTTGATGTGGCCTGCAAGCATCTGA  148

Query   35  CAGATACGTCTCATGGTGTAAGAAATAAGTGCCTGCAGTTACTTGGCAATCTTGGCTCTTTGGAGAAAAGTGTC  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGATACGTCTCATGGTGTAAGAAATAAGTGCCTGCAGTTACTTGGCAATCTTGGCTCTTTGGAGAAAAGTGTC  222

Query  109  ACAAAAGATGCAGAAGGCCTAGCTGCCAGAGATGTCCAGAAGATTATAGGGGATTACTTCAGTGACCAAGACCC  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACAAAAGATGCAGAAGGCCTAGCTGCCAGAGATGTCCAGAAGATTATAGGGGATTACTTCAGTGACCAAGACCC  296

Query  183  ACGTGTCAGAACAGCAGCTATAAAAGCCATGTTGCAGCTCCATGAAAGAGGACTGAAATTACACCAAACAATTT  256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACGTGTCAGAACAGCAGCTATAAAAGCCATGTTGCAGCTCCATGAAAGAGGACTGAAATTACACCAAACAATTT  370

Query  257  ATAATCAGGCCTGTAAATTACTCTCTGATGACTATGAACAAGTGCGCAGTGCTGCAGTCCAGCTTATCTGGGTC  330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATAATCAGGCCTGTAAATTACTCTCTGATGACTATGAACAAGTGCGCAGTGCTGCAGTCCAGCTTATCTGGGTC  444

Query  331  GTCAGTCAGCTCTATCCTGAAAGCATTGTCCCAATTCCTTCTTCTAATGAAGAAATACGCTTAGTTGATGATGC  404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTCAGTCAGCTCTATCCTGAAAGCATTGTCCCAATTCCTTCTTCTAATGAAGAAATACGCTTAGTTGATGATGC  518

Query  405  GTTTGGCAAAATTTGTCACATGGTCAGTGATGGCTCTTGGGTGGTTCGTGTTCAGGCAGCAAAACTGTTGGGCT  478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTTGGCAAAATTTGTCACATGGTCAGTGATGGCTCTTGGGTGGTTCGTGTTCAGGCAGCAAAACTGTTGGGCT  592

Query  479  CTATGGAGCAAGTCAGTTCTCATTTCTTGGAGCAGACCCTTGACAAGAAGCTGATGTCAGATCTGAGGAGGAAA  552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTATGGAGCAAGTCAGTTCTCATTTCTTGGAGCAGACCCTTGACAAGAAGCTGATGTCAGATCTGAGGAGGAAA  666

Query  553  CGTACTGCACATGAGCGTGCCAAGGAACTTTACAGTTCGGGGGAGTTTTCCAGTGGCAGAAAGTGGGGAGATGA  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGTACTGCACATGAGCGTGCCAAGGAACTTTACAGTTCGGGGGAGTTTTCCAGTGGCAGAAAGTGGGGAGATGA  740

Query  627  TGCTCCCAAGGAAGAAGTAGATACCGGGGCTGTGAACTTGATTGAGTCAGGAGCTTGTGGAGCTTTTGTTCATG  700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTCCCAAGGAAGAAGTAGATACCGGGGCTGTGAACTTGATTGAGTCAGGAGCTTGTGGAGCTTTTGTTCATG  814

Query  701  GGTTGGAAGATGAGATGTATGAGGTTCGTATTGCTGCTGTGGAGGCCCTCTGCATGTTGGCCCAGTCTTCACCC  774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGTTGGAAGATGAGATGTATGAGGTTCGTATTGCTGCTGTGGAGGCCCTCTGCATGTTGGCCCAGTCTTCACCC  888

Query  775  TCTTTTGCTGAGAAGTGCCTTGATTTCCTAGTTGACATGTTCAACGATGAAATTGAGGAAGTACGTCTGCAGTC  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTTTTGCTGAGAAGTGCCTTGATTTCCTAGTTGACATGTTCAACGATGAAATTGAGGAAGTACGTCTGCAGTC  962

Query  849  TATACATACCATGAGAAAAATCTCTAACAACATCACCCTCCGAGAAGATCAGCTTGACACTGTCCTGGCTGTGC  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TATACATACCATGAGAAAAATCTCTAACAACATCACCCTCCGAGAAGATCAGCTTGACACTGTCCTGGCTGTGC  1036

Query  923  TAGAGGATTCATCCAGAGATATTCGAGAGGCTCTTCATGAACTCTTATGCTGTACTAATGTTTCAACCAAAGAA  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAGAGGATTCATCCAGAGATATTCGAGAGGCTCTTCATGAACTCTTATGCTGTACTAATGTTTCAACCAAAGAA  1110

Query  997  GGGATTCATCTTGCATTGGTGGAGCTGCTGAAAAATTTAACCAAGTACCCTACTGATAGGGACTCCATATGGAA  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGATTCATCTTGCATTGGTGGAGCTGCTGAAAAATTTAACCAAGTACCCTACTGATAGGGACTCCATATGGAA  1184

Query 1071  GTGCTTGAAGTTTCTGGGAAGTCGGCATCCAACCCTGGTGCTTCCCTTGGTGCCAGAGCTTCTGAGCACCCACC  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTGCTTGAAGTTTCTGGGAAGTCGGCATCCAACCCTGGTGCTTCCCTTGGTGCCAGAGCTTCTGAGCACCCACC  1258

Query 1145  CATTTTTTGACACAGCTGAACCAGACATGGATGATCCAGCTTATATTGCAGTTTTGGTACTTATTTTCAATGCT  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CATTTTTTGACACAGCTGAACCAGACATGGATGATCCAGCTTATATTGCAGTTTTGGTACTTATTTTCAATGCT  1332

Query 1219  GCTAAAACCTGTCCAACAATGCCAGCATTGTTCTCAGATCACACCTTCAGGCACTATGCCTACCTCCGAGACAG  1292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTAAAACCTGTCCAACAATGCCAGCATTGTTCTCAGATCACACCTTCAGGCACTATGCCTACCTCCGAGACAG  1406

Query 1293  TCTTTCTCATCTTGTTCCTGCCTTGAGGTTACCAGGTAGAAAACTGGTGTCATCAGCTGTTTCTCCCAGCATCA  1366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCTTTCTCATCTTGTTCCTGCCTTGAGGTTACCAGGTAGAAAACTGGTGTCATCAGCTGTTTCTCCCAGCATCA  1480

Query 1367  TACCTCAAGAGGATCCTTCCCAGCAGTTCCTGCAGCAGAGCCTTGAAAGAGTGTATAGTCTTCAGCACTTGGAC  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TACCTCAAGAGGATCCTTCCCAGCAGTTCCTGCAGCAGAGCCTTGAAAGAGTGTATAGTCTTCAGCACTTGGAC  1554

Query 1441  CCTCAGGGAGCCCAGGAGCTGCTGGAATTCACCATCAGAG-------------TCGAG-GTTTCACCAT-----  1495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|             |.||| ..||||  ||     
Sbjct 1555  CCTCAGGGAGCCCAGGAGCTGCTGGAATTCACCATCAGGGATCTGCAAAGACTTGGAGAACTTCA--ATCTGAA  1626

Query 1496  ------GGTG--------------GCCA--------GGCTGGTCTCAA--ACTCCTGAGCTCAAG---------  1530
                  ||.|              ||||        .||||   ||||  |||.||.|  |||||         
Sbjct 1627  TTGGCAGGAGTAGCTGATTTCTCTGCCACCTATCTTCGCTG---TCAACTACTTCTCA--TCAAGGCCTTGCAG  1695

Query 1531  --------------------------------------------------------------------------  1530
                                                                                      
Sbjct 1696  GAAAAGTTGTGGAATGTAGCTGCCCCTTTGTATTTGAAGCAGAGTGATTTGGCCTCAGCAGCAGCGAAACAGAT  1769

Query 1531  --------------------------------------------------------------------------  1530
                                                                                      
Sbjct 1770  TATGGAAGAGACCTACAAAATGGAATTCATGTACAGTGGTGTGGAGAATAAGCAGGTGGTGATTATACATCACA  1843

Query 1531  --------------------------------------------------------------------------  1530
                                                                                      
Sbjct 1844  TGAGGCTGCAGGCCAAAGCTTTGCAACTTATAGTAACAGCACGAACTACACGAGGACTTGACCCCTTATTTGGG  1917

Query 1531  --------------------------------------------------------------------------  1530
                                                                                      
Sbjct 1918  ATGTGTGAAAAATTTTTACAGGAAGTAGACTTTTTTCAGAGGTATTTCATCGCTGATTTGCCCCACTTGCAGGA  1991

Query 1531  --------------------------------------------------------------------------  1530
                                                                                      
Sbjct 1992  CAGCTTTGTGGACAAACTCCTTGACCTTATGCCCCGACTCATGACATCCAAACCTGCAGAAGTGGTCAAAATTC  2065

Query 1531  --------------------------------------------------------------------------  1530
                                                                                      
Sbjct 2066  TACAGACCATGCTGCGACAGAGTGCCTTTCTGCATCTCCCGCTTCCAGAGCAGATCCACAAAGCCTCAGCCACC  2139

Query 1531  --------------------------------------------------------------------------  1530
                                                                                      
Sbjct 2140  ATCATCGAGCCAGCGGGCGAGTCAGACAACCCTTTGCGGTTTACCTCTGGGTTGGTGGTTGCCCTGGATGTTGA  2213

Query 1531  --------------------------------------------------------------------------  1530
                                                                                      
Sbjct 2214  TGCAACCCTGGAGCATGTGCAGGATCCTCAGAACACTGTTAAGGTCCAGGTCTTATATCCAGATGGCCAGGCTC  2287

Query 1531  --------------------------------------------------------------------------  1530
                                                                                      
Sbjct 2288  AGATGATTCACCCCAAGCCTGCAGACTTCCGGAATCCTGGCCCAGGGCGGCACCGGCTCATCACTCAGGTTTAT  2361

Query 1531  --------------------------------------------------------------------------  1530
                                                                                      
Sbjct 2362  CTCTCCCACACCGCTTGGACAGAGGCATGCCAGGTGGAAGTGAGGCTGCTGCTGGCCTACAACTCCAGTGCTCG  2435

Query 1531  --------------------------------------------------------------------------  1530
                                                                                      
Sbjct 2436  CATTCCAAAATGCCCCTGGATGGAGGGTGGTGAGATGTCACCACAGGTGGAAACCAGCATCGAGGGCACCATTC  2509

Query 1531  --------------------------------------------------  1530
                                                              
Sbjct 2510  CCTTCAGCAAGCCTGTAAAAGTTTATATAATGCCCAAACCTGCACGGCGC  2559