Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14905
• Subject: XM_006502823.3
• Aligned Length: 1416
• Identities: 1094
• Gaps: 173

Alignment

Query    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAAAAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTGA  74
            |||  |||                      |.||||||||||||.||.||.|||||||||||||..|||..|||
Sbjct    1  ATG--ATC----------------------ACAGAGATGGGCAGCAGTGAGCCCCTTCCCATCGTGGATTCTGA  50

Query   75  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAGC  148
            ||.||||||||||||||||||.|.|..|||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct   51  CAAGAGGAGGAAGAAGAAGCGTAAGACCCGGGCCACCGACTCTCTGCCAGGAAAGTTTGAAGATGTGTACCAGC  124

Query  149  TGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGAG  222
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.||||||||.|||.||.|||
Sbjct  125  TGACCTCGGAATTGCTGGGAGAAGGAGCCTATGCCAAAGTCCAGGGTGCTGTGAACCTACAGAGTGGGAAGGAG  198

Query  223  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  199  TATGCTGTCAAAATCATCGAGAAGCAAGCCGGGCACAGTCGAAGTCGAGTGTTCCGTGAGGTGGAGACACTGTA  272

Query  297  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  370
            |||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  273  TCAGTGTCAAGGGAACAGGAACATTTTGGAGCTGATTGAATTCTTTGAAGATGACACACGGTTTTACTTGGTCT  346

Query  371  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  444
            |||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  347  TTGAGAAATTGCAAGGAGGCTCCATCCTAGCACACATCCAGAAGCGGAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGT  420

Query  445  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGACAAAGTCTCTCTCTGTCACCTAGG  518
            .||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.||.||||.||                      
Sbjct  421  AGAGTGGTGCGGGACGTCGCCACTGCCCTTGACTTCCTGCACACTAAAGGCA----------------------  472

Query  519  CTGGAGTGCTATGGCGCCATCAGGGCTCACTGCAGCCCCAACCTCCCTGGGCTCCAGTGATCCTCCCACCTCAG  592
                                                                                      
Sbjct  473  --------------------------------------------------------------------------  472

Query  593  CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACANGCATTTGCTCATNGTGATNTGAAACCAAGNAAAATATATTGTGTGAATCT  666
                                        |||||||..|||||.||||.|||  .||||.|||.|||||||||||
Sbjct  473  ----------------------------TTGCTCACCGTGATCTGAAGCCA--GAAAACATACTGTGTGAATCT  516

Query  667  CCAGGAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGATGAAACTGAACAACTCCTTG  740
            ||| ||||||||||||||.||| |||||.||||||||||||||||||||||||.|.||..||||||||||| ||
Sbjct  517  CCA-GAAAAGGTGTCTCCGGTG-AAAATTTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGGTAAAGTTGAACAACTCC-TG  587

Query  741  TACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATGGCCCCTGGAGGTAGTGGAG  814
            .||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||| |||||.||||||
Sbjct  588  CACTCCCATAACCACGCCAGAGCTGACTACTCCATGCGGCTCTGCAGAGTATATGGCACCT-GAGGTGGTGGAG  660

Query  815  GTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGGCGTGGTCCTCTACATCAT  888
            |||||.|.||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  661  GTCTTTAGGGACGAGGCTACTTTCTATGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGGTGTGGTCCTCTACATCAT  734

Query  889  GCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACCGGGGCGAGGTCTGCAGGG  962
            |||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.
Sbjct  735  GCTGAGTGGCTACCCCCCCTTTGTAGGTCACTGTGGGGCTGACTGTGGCTGGGACCGGGGAGAGGTATGCAGGA  808

Query  963  TGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGACAAGGACTGGGCACACATC  1036
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  809  TGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAGAGCATCCAGGAAGGCAAATACGAGTTTCCTGACAAAGACTGGGCTCACATC  882

Query 1037  TCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAGACTTAGCGCCGCCCAAGT  1110
            ||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||
Sbjct  883  TCCAACGAGGCCAAAGACCTCATCTCTAAGCTCCTGGTTCGAGATGCGAAGCAAAGACTCAGTGCTGCCCAGGT  956

Query 1111  TCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGGGCAAGCTCCAGAAAAGGGACTCCCCACGCCGCAAGTCCTCCAGAGGAACA  1184
            |||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  957  TCTGCAGCATCCATGGGTACAAGGGCAAGCTCCAGAAAGGGGACTCCCCACGCCGCAAGTCCTTCAGAGAAACA  1030

Query 1185  GCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAGCTATCTCAGCACGAAGAG  1258
            |||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1031  GCAGCACCATGGACTTGACTCTCTTCGCAGCTGAGGCCATTGCCCTGAACCGCCAGCTGTCTCAGCATGAGGAG  1104

Query 1259  AACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCTTTCCCCTCCCTGCAAGTC  1332
            ||.|||||.||.|||||.|..|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||.||
Sbjct 1105  AATGAACTGGCCGAGGAACAGGAGGCCCTAGCTGAGGGCCTCTGCTCCATGAAGCTGTCCCCTCCATCCAAATC  1178

Query 1333  ACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGGTGAAGAC-AGGAGCCCGCCCA-----------  1394
            .||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||     ||||.| ||..||...||||           
Sbjct 1179  TCGCCTGGCTCGAAGGCGAGCCCTGGCCCAGGCTGGCC-----GAAGCCGAGATGCAAACCCATGTTTGACACC  1247

Query 1395  --CAGCACTC  1402
              |||..|||
Sbjct 1248  GGCAGGGCTC  1257