Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14905
• Subject: XM_006711014.1
• Aligned Length: 1402
• Identities: 983
• Gaps: 415

Alignment

Query    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAAAAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGAG  222
                                                                           |||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGGCAAAGAG  11

Query  223  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   12  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  85

Query  297  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  370
            ||||||||||||||||||                                                        
Sbjct   86  TCAGTGTCAGGGAAACAA--------------------------------------------------------  103

Query  371  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  444
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  104  ------------------GTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  159

Query  445  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGACAAAGTCTCTCTCTGTCACCTAGG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||                      
Sbjct  160  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGGCA----------------------  211

Query  519  CTGGAGTGCTATGGCGCCATCAGGGCTCACTGCAGCCCCAACCTCCCTGGGCTCCAGTGATCCTCCCACCTCAG  592
                                                                                      
Sbjct  212  --------------------------------------------------------------------------  211

Query  593  CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACANGCATTTGCTCATNGTGATNTGAAACCAAGNAAAATATATTGTGTGAATCT  666
                                        ||||||||.|||||.||||||||  .||||||||||||||||||||
Sbjct  212  ----------------------------TTGCTCATCGTGATCTGAAACCA--GAAAATATATTGTGTGAATCT  255

Query  667  CCAGGAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGATGAAACTGAACAACTCCTTG  740
            ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  256  CCA-GAAAAGGTGTCTCCAGTG-AAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGATGAAACTGAACAACTCC-TG  326

Query  741  TACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATGGCCCCTGGAGGTAGTGGAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  327  TACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATGGCCCCT-GAGGTAGTGGAG  399

Query  815  GTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGGCGTGGTCCTCTACATCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  400  GTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGGCGTGGTCCTCTACATCAT  473

Query  889  GCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACCGGGGCGAGGTCTGCAGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  474  GCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACCGGGGCGAGGTCTGCAGGG  547

Query  963  TGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGACAAGGACTGGGCACACATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  548  TGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGACAAGGACTGGGCACACATC  621

Query 1037  TCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAGACTTAGCGCCGCCCAAGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  622  TCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAGACTTAGCGCCGCCCAAGT  695

Query 1111  TCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGGGCAAGCTCCAGAAAAGGGACTCCCCACGCCGCAAGTCCTCCAGAGGAACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  696  TCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGGGCAAGCTCCAGAAAAGGGACTCCCCACGCCGCAAGTCCTCCAGAGGAACA  769

Query 1185  GCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAGCTATCTCAGCACGAAGAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  770  GCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAGCTATCTCAGCACGAAGAG  843

Query 1259  AACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCTTTCCCCTCCCTGCAAGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  844  AACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCTTTCCCCTCCCTGCAAGTC  917

Query 1333  ACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGGTGAAGACAGGAGCCCGCCCACAGCACTC  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  918  ACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGGTGAAGACAGGAGCCCGCCCACAGCACTC  987