Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14931
• Subject: NM_001037957.3
• Aligned Length: 1887
• Identities: 1748
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCGTCCCACCGGGCCATGGTCCCTTCTCTGGCTTCCCAGGGCCCCAGGAGCACACGCAGGTATTGCCTGA  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||.|.|||||
Sbjct    1  ATGGCCGTCCCACCAGGCCATGGTCCTTTCTCTGGCTTTCCGGGGCCCCAGGAACACACACAGGTACTACCTGA  74

Query   75  TGTGCGGCTACTGCCTCGGAGGCTGCCCCTGGCCTTCCGGGATGCAACCTCAGCCCCGCTGCGTAAGCTCTCTG  148
            |||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  TGTGCGGCTCCTGCCCCGGAGACTGCCCCTGGCCTTCCGGGATGCGGCCTCAGCCCCGCTGCGCAAGCTCTCGG  148

Query  149  TGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACTATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAGCAGGCG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  TGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACTATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAACAGGCG  222

Query  223  CCACCCCAGGATTCGAGCAACAAGAAGGAGAAGAAGGTCCTGAACCATGGTTATGATGACGACAACCATGACTA  296
            |||||||||||.|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  CCACCCCAGGACTCGAGCACCAAAAAGGAGAAGAAGGTCCTGAACCACGGTTATGATGACGACAACCACGACTA  296

Query  297  CATCGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTGGAGCGCTACGAAATTGACTCGCTCATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCC  370
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATTGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTAGAGCGCTATGAGATTGACTCTCTTATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCC  370

Query  371  AGGTGGTGAAAGCCTATGATCATCAGACCCAGGAGCTTGTGGCCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCTTTC  444
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  AGGTGGTGAAAGCCTATGATCACCAGACTCAGGAGCTGGTGGCCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCCTTC  444

Query  445  CTGAACCAGGCCCAGATTGAGCTGCGGCTGCTGGAGCTGATGAACCAGCATGACACGGAGATGAAGTACTATAT  518
            |||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  CTGAACCAGGCACAGATTGAGCTACGGCTGTTGGAGCTGATGAACCAGCATGATACAGAGATGAAGTACTACAT  518

Query  519  AGTACACCTGAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAACCACCTGTGCCTGGTATTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGT  592
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTACACCTTAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAATCACCTGTGCCTGGTGTTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGT  592

Query  593  ACGACCTCCTGCGCAACACCCACTTCCGCGGCGTCTCGCTGAACCTGACCCGGAAGCTGGCGCAGCAGCTCTGC  666
            ||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||..||||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  ACGACCTCCTCCGCAACACACACTTTCGGGGTGTCTCACTGAACCTGACGAGGAAGCTGGCACAGCAGCTCTGC  666

Query  667  ACGGCACTGCTCTTTCTGGCCACGCCTGAGCTCAGCATCATTCACTGCGACCTCAAGCCCGAAAACATCTTGCT  740
            ||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||.||||
Sbjct  667  ACAGCTCTGCTCTTTCTGGCCACCCCCGAGCTCAGCATCATCCACTGCGACCTCAAGCCTGAGAACATCCTGCT  740

Query  741  GTGCAACCCCAAGCGCAGCGCCATCAAGATTGTGGACTTCGGCAGCTCCTGCCAGCTTGGCCAGAGGATCTACC  814
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  741  CTGCAACCCCAAGCGCAGTGCCATCAAGATCGTGGACTTCGGCAGTTCCTGCCAGCTTGGCCAGCGGATCTACC  814

Query  815  AGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCTGAGGTGCTCCTGGGCACACCCTACGACCTGGCCATTGACATG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCCGAGGTGCTCCTGGGTACACCCTATGACCTGGCCATTGACATG  888

Query  889  TGGTCCCTGGGCTGCATCCTTGTGGAGATGCACACCGGAGAGCCCCTCTTCAGTGGCTCCAATGAGGTCGACCA  962
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  889  TGGTCCCTGGGCTGCATCCTCGTGGAGATGCACACCGGAGAGCCCCTCTTCAGTGGCTCTAATGAGGTGGACCA  962

Query  963  GATGAACCGCATTGTGGAGGTGCTGGGCATCCCACCGGCCGCCATGCTGGACCAGGCGCCCAAGGCTCGCAAGT  1036
            |||||.|||.||||||||||||.||||||||||.||.||..||||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct  963  GATGAGCCGTATTGTGGAGGTGTTGGGCATCCCTCCCGCACCCATGCTGGAACAGGCACCCAAGGCTCGAAAGT  1036

Query 1037  ACTTTGAACGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGACGAAAGAACTCAGGAAGGATTACCAGGGCCCC  1110
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  ACTTTGAGCGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGACAAAGGAACTCAGGAAGGATTACCAGGGCCCT  1110

Query 1111  GGGACACGGCGGCTGCAGGAGGTGCTGGGCGTGCAGACGGGCGGGCCCGGGGGCCGGCGGGCGGGGGAGCCGGG  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111  GGGACACGGCGGCTGCAGGAGGTGCTGGGCGTGCAGACGGGCGGGCCCGGGGGCCGGCGGGCGGGGGAGCCCGG  1184

Query 1185  CCACAGCCCCGCCGACTACCTCCGCTTCCAGGACCTGGTGCTGCGCATGCTGGAGTATGAGCCCGCCGCCCGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCACAGCCCCGCCGACTACCTCCGCTTCCAGGACCTGGTGCTGCGCATGCTGGAATATGAGCCCGCCGCCCGCA  1258

Query 1259  TCAGCCCCCTGGGGGCTCTGCAGCACGGCTTCTTCCGCCGCACGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCA  1332
            |||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAGCCCTCTGGGCGCTCTGCAGCATGGCTTCTTCCGCCGCACGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCA  1332

Query 1333  GGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCCGCGCCCCTCGACACCTGCCCCTCTTCCAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAG  1406
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCGGCGCCCCTTGACACCTGCCCCTCCTCTAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAG  1406

Query 1407  TTCTGGAGGCTCCAGTGGCTCCTCCAGTGACAACCGGACCTACCGCTACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCTG  1480
            .||||||||.||||||||||||||||..||||||.|..|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407  CTCTGGAGGTTCCAGTGGCTCCTCCAACGACAACAGAGCCTACCGATACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCAG  1480

Query 1481  GGCCCCCTATCACAGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCCCACCCTCCCAGCCGCTGCGGCCCTGGGCAGGG  1554
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1481  GGCCCCCCATCACTGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCCTACCCTCCCAGCCTCTGCGCCCCTGGGCAGGG  1554

Query 1555  GGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTGCCTCTGCCTCGTCACTGCCTGGGACCGGGGCCCAGTTACC  1628
            |||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||..||.||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1555  GGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTATCTCTGCCTCAACATTGCCGGGGACTGGGGCTCAGTTACC  1628

Query 1629  CCCCCAGCCCCGATACCTTGGTCGTCCCCCATCACCAACCTCACCACCACCCCCGGAGCTGATGGATGTGAGCC  1702
            |||...||||||.|.||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCATTGCCCCGTTGCCTTGGACGACCCCCATCACCAACATCACCACCACCCCCAGAGTTGATGGATGTGAGCC  1702

Query 1703  TGGTGGGCGGCCCTGCTGACTGCTCCCCACCTCACCCAGCGCCTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTC  1776
            ||||||||.|||||.|.||||||||.|||||||..|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGTGGGCAGCCCTCCAGACTGCTCTCCACCTCCTCCAGCACCTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTC  1776

Query 1777  CGGACTCGGATGACTGGAGGTCGTCCACCCCTCCCGCCTCCTGATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCACCTGGG  1850
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1777  CGGACTCGGATGACAGGAGGTCGACCACCTCTCCCACCCCCTGATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCGCCTGGG  1850

Query 1851  CCTCCGTGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCG  1887
            .||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1851  TCTCCATGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCA  1887