Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02754
• Subject: NM_015291.4
• Aligned Length: 2346
• Identities: 2346
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAAGTGAGAAAGTTGAGCATTTCCTGGCAGTTCTTGATAGTTCTGGTTCTGATCCTGCAAATTCTGTCTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGTGAGAAAGTTGAGCATTTCCTGGCAGTTCTTGATAGTTCTGGTTCTGATCCTGCAAATTCTGTCTGC  74

Query   75  GTTGGATTTTGACCCATACAGAGTCCTAGGGGTCAGCCGAACAGCCAGTCAGGCTGATATTAAAAAGGCTTATA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTGGATTTTGACCCATACAGAGTCCTAGGGGTCAGCCGAACAGCCAGTCAGGCTGATATTAAAAAGGCTTATA  148

Query  149  AGAAGCTCGCCCGGGAATGGCATCCTGACAAAAACAAAGATCCTGGAGCAGAAGACAAGTTCATTCAAATCAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAGCTCGCCCGGGAATGGCATCCTGACAAAAACAAAGATCCTGGAGCAGAAGACAAGTTCATTCAAATCAGT  222

Query  223  AAGGCTTACGAGATTCTTTCAAATGAAGAAAAGAGATCAAATTATGATCAATATGGAGACGCTGGAGAGAACCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGGCTTACGAGATTCTTTCAAATGAAGAAAAGAGATCAAATTATGATCAATATGGAGACGCTGGAGAGAACCA  296

Query  297  GGGCTACCAGAAGCAGCAACAGCAGCGAGAGTATCGCTTCCGCCATTTCCATGAAAATTTTTATTTTGATGAAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCTACCAGAAGCAGCAACAGCAGCGAGAGTATCGCTTCCGCCATTTCCATGAAAATTTTTATTTTGATGAAT  370

Query  371  CCTTTTTTCACTTCCCTTTTAATTCTGAACGGCGGGACTCAATTGACGAAAAGTATTTATTGCACTTTTCACAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTTTTTTCACTTCCCTTTTAATTCTGAACGGCGGGACTCAATTGACGAAAAGTATTTATTGCACTTTTCACAT  444

Query  445  TATGTGAATGAAGTGGTTCCAGATAGCTTCAAGAAACCCTACCTCATCAAGATCACCTCCGATTGGTGCTTTAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATGTGAATGAAGTGGTTCCAGATAGCTTCAAGAAACCCTACCTCATCAAGATCACCTCCGATTGGTGCTTTAG  518

Query  519  CTGCATTCATATCGAGCCTGTGTGGAAAGAAGTCATTCAAGAACTGGAAGAATTGGGTGTAGGAATTGGCGTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGCATTCATATCGAGCCTGTGTGGAAAGAAGTCATTCAAGAACTGGAAGAATTGGGTGTAGGAATTGGCGTGG  592

Query  593  TCCATGCTGGGTATGAGAGACGCCTGGCCCATCACCTAGGGGCACACAGCACGCCCTCTATCCTAGGAATCATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCATGCTGGGTATGAGAGACGCCTGGCCCATCACCTAGGGGCACACAGCACGCCCTCTATCCTAGGAATCATT  666

Query  667  AACGGGAAAATCTCCTTCTTCCACAATGCAGTTGTCCGTGAAAATCTGCGACAATTTGTAGAAAGTCTTCTTCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACGGGAAAATCTCCTTCTTCCACAATGCAGTTGTCCGTGAAAATCTGCGACAATTTGTAGAAAGTCTTCTTCC  740

Query  741  AGGGAACTTGGTGGAGAAAGTTACAAATAAAAATTACGTCAGATTCCTCTCTGGCTGGCAGCAAGAGAATAAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGGAACTTGGTGGAGAAAGTTACAAATAAAAATTACGTCAGATTCCTCTCTGGCTGGCAGCAAGAGAATAAGC  814

Query  815  CTCATGTCCTTCTGTTTGACCAAACGCCCATTGTGCCACTGTTATACAAGTTGACTGCCTTTGCATACAAAGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCATGTCCTTCTGTTTGACCAAACGCCCATTGTGCCACTGTTATACAAGTTGACTGCCTTTGCATACAAAGAT  888

Query  889  TATTTATCATTTGGATATGTATATGTGGGTTTGAGAGGGACGGAAGAGATGACAAGGCGGTACAACATCAATAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATTTATCATTTGGATATGTATATGTGGGTTTGAGAGGGACGGAAGAGATGACAAGGCGGTACAACATCAATAT  962

Query  963  CTACGCCCCTACCCTCTTGGTCTTTAAAGAACATATAAACAGGCCTGCCGATGTTATCCAGGCCCGAGGTATGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTACGCCCCTACCCTCTTGGTCTTTAAAGAACATATAAACAGGCCTGCCGATGTTATCCAGGCCCGAGGTATGA  1036

Query 1037  AGAAGCAAATCATTGACGACTTCATCACCCGAAACAAATATCTATTGGCAGCCAGGCTCACCAGCCAGAAGTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAAGCAAATCATTGACGACTTCATCACCCGAAACAAATATCTATTGGCAGCCAGGCTCACCAGCCAGAAGTTG  1110

Query 1111  TTCCATGAACTCTGCCCTGTGAAACGGTCGCATCGACAGAGGAAGTACTGTGTGGTTTTATTGACTGCTGAGAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCCATGAACTCTGCCCTGTGAAACGGTCGCATCGACAGAGGAAGTACTGTGTGGTTTTATTGACTGCTGAGAC  1184

Query 1185  TACCAAGTTGAGCAAACCCTTTGAGGCTTTCCTGTCCTTTGCCCTGGCAAACACTCAAGACACAGTGAGATTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TACCAAGTTGAGCAAACCCTTTGAGGCTTTCCTGTCCTTTGCCCTGGCAAACACTCAAGACACAGTGAGATTTG  1258

Query 1259  TGCATGTCTACAGCAATCGGCAGCAGGAGTTTGCCGACACCTTACTACCAGACAGTGAGGCGTTTCAAGGGAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCATGTCTACAGCAATCGGCAGCAGGAGTTTGCCGACACCTTACTACCAGACAGTGAGGCGTTTCAAGGGAAA  1332

Query 1333  TCAGCGGTGTCTATTTTAGAAAGGCGCAACACAGCAGGAAGGGTGGTGTATAAAACCCTGGAAGACCCTTGGAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCAGCGGTGTCTATTTTAGAAAGGCGCAACACAGCAGGAAGGGTGGTGTATAAAACCCTGGAAGACCCTTGGAT  1406

Query 1407  TGGGAGTGAGAGTGACAAATTTATCCTCTTGGGCTATCTCGACCAGCTGCGTAAAGATCCAGCTCTTCTGTCCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGGAGTGAGAGTGACAAATTTATCCTCTTGGGCTATCTCGACCAGCTGCGTAAAGATCCAGCTCTTCTGTCCT  1480

Query 1481  CTGAAGCAGTGCTTCCTGACCTGACCGATGAACTTGCCCCTGTTTTTCTCCTTCGATGGTTCTACTCTGCTTCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGAAGCAGTGCTTCCTGACCTGACCGATGAACTTGCCCCTGTTTTTCTCCTTCGATGGTTCTACTCTGCTTCT  1554

Query 1555  GACTACATCTCAGACTGCTGGGATAGCATTTTTCACAACAACTGGAGGGAAATGATGCCCCTGCTGTCCCTGAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACTACATCTCAGACTGCTGGGATAGCATTTTTCACAACAACTGGAGGGAAATGATGCCCCTGCTGTCCCTGAT  1628

Query 1629  CTTCTCTGCCCTCTTCATCCTCTTCGGCACTGTCATCGTTCAGGCTTTCAGCGACTCTAATGATGAGCGAGAGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTCTCTGCCCTCTTCATCCTCTTCGGCACTGTCATCGTTCAGGCTTTCAGCGACTCTAATGATGAGCGAGAGT  1702

Query 1703  CAAGCCCTCCAGAAAAAGAGGAAGCCCAAGAGAAGACTGGGAAAACTGAGCCAAGCTTCACCAAAGAAAACAGC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAAGCCCTCCAGAAAAAGAGGAAGCCCAAGAGAAGACTGGGAAAACTGAGCCAAGCTTCACCAAAGAAAACAGC  1776

Query 1777  AGCAAGATTCCTAAAAAAGGCTTTGTGGAGGTAACTGAACTCACAGATGTAACATACACCAGTAACTTGGTACG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGCAAGATTCCTAAAAAAGGCTTTGTGGAGGTAACTGAACTCACAGATGTAACATACACCAGTAACTTGGTACG  1850

Query 1851  TCTGAGGCCAGGCCACATGAATGTGGTCCTCATCCTGTCGAATTCTACCAAGACCAGCCTACTACAGAAATTTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCTGAGGCCAGGCCACATGAATGTGGTCCTCATCCTGTCGAATTCTACCAAGACCAGCCTACTACAGAAATTTG  1924

Query 1925  CTTTGGAGGTCTACACATTTACTGGGAGCAGCTGCCTACACTTCTCCTTCCTGAGTCTAGATAAACACAGAGAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTTTGGAGGTCTACACATTTACTGGGAGCAGCTGCCTACACTTCTCCTTCCTGAGTCTAGATAAACACAGAGAA  1998

Query 1999  TGGCTAGAATACTTACTAGAATTTGCTCAAGATGCAGCTCCAATCCCAAACCAATATGATAAGCATTTCATGGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGGCTAGAATACTTACTAGAATTTGCTCAAGATGCAGCTCCAATCCCAAACCAATATGATAAGCATTTCATGGA  2072

Query 2073  GCGTGACTACACTGGTTATGTACTGGCTCTGAATGGCCACAAGAAATACTTCTGCCTCTTCAAGCCCCAAAAGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCGTGACTACACTGGTTATGTACTGGCTCTGAATGGCCACAAGAAATACTTCTGCCTCTTCAAGCCCCAAAAGA  2146

Query 2147  CAGTCGAAGAGGAGGAAGCCATAGGGTCGTGCAGTGATGTTGACTCTTCCCTCTACCTGGGTGAATCTCGAGGG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CAGTCGAAGAGGAGGAAGCCATAGGGTCGTGCAGTGATGTTGACTCTTCCCTCTACCTGGGTGAATCTCGAGGG  2220

Query 2221  AAACCTTCCTGTGGCCTTGGATCCAGGCCCATCAAAGGAAAGTTGAGCAAGCTCTCTTTATGGATGGAACGCCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AAACCTTCCTGTGGCCTTGGATCCAGGCCCATCAAAGGAAAGTTGAGCAAGCTCTCTTTATGGATGGAACGCCT  2294

Query 2295  GCTGGAGGGCTCCTTACAGAGGTTTTATATCCCATCATGGCCTGAACTAGAC  2346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCTGGAGGGCTCCTTACAGAGGTTTTATATCCCATCATGGCCTGAACTAGAC  2346