Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03803
• Subject: NM_001004365.2
• Aligned Length: 1254
• Identities: 1127
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCAGGCTCCCTGCCTCCCTGCGTGGTGGACTGTGGCACCGGGTATACCAAGCTTGGCTACGCAGGCAACAC  74
            |||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGGCTCGCTGCCTCCCTGCGTGGTTGACTGCGGCACCGGGTACACCAAGCTTGGCTACGCAGGCAACAC  74

Query   75  TGAGCCCCAGTTCATTATTCCTTCATGTATTGCCATCAGAGAGTCAGCAAAGGTAGTTGACCAAGCTCAAAGGA  148
            |||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  TGAACCACAGTTCATTATCCCGTCATGTATCGCCATCCGAGAATCTGCAAAGGTAGTTGATCAAGCCCAAAGGA  148

Query  149  GAGTGTTGAGGGGAGTTGATGACCTTGACTTTTTCATAGGAGATGAAGCCATCGATAAACCTACATATGCTACA  222
            |.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.
Sbjct  149  GGGTGTTGAGAGGAGTCGATGACCTTGATTTCTTCATAGGGGATGAAGCCATTGATAAACCTACCTACGCTACC  222

Query  223  AAGTGGCCGATACGACATGGAATCATTGAAGACTGGGATCTTATGGAAAGGTTCATGGAGCAAGTGGTTTTTAA  296
            ||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  223  AAGTGGCCTATACGACATGGCATCGTTGAAGACTGGGATCTTATGGAAAGGTTCATGGAACAAGTGGTCTTTAA  296

Query  297  ATATCTTCGAGCTGAACCTGAGGACCATTATTTTTTAATGACAGAACCTCCACTCAATACACCAGAAAACAGAG  370
            .||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  297  GTATCTTCGTGCTGAACCTGAGGACCACTACTTTTTAATGACAGAACCTCCACTGAACACACCAGAAAACAGAG  370

Query  371  AGTATCTTGCAGAAATTATGTTTGAATCATTTAACGTACCAGGACTCTACATTGCAGTTCAGGCAGTGCTGGCC  444
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  371  AGTACCTTGCAGAAATCATGTTTGAATCATTTAATGTACCAGGACTCTACATTGCAGTACAGGCAGTGCTGGCT  444

Query  445  TTGGCGGCATCTTGGACATCTCGACAAGTGGGTGAACGTACGTTAACGGGGATAGTCATTGACAGCGGAGATGG  518
            .||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||..|||||||||||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  445  CTGGCAGCCTCTTGGACATCCCGGCAAGTTGGTGAACGCACACTAACGGGGATAGTTATAGACAGTGGAGACGG  518

Query  519  AGTCACCCATGTTATCCCAGTGGCAGAAGGTTATGTAATTGGAAGCTGCATCAAACACATCCCGATTGCAGGTA  592
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  TGTCACCCATGTTATCCCGGTGGCAGAAGGTTATGTAATTGGAAGCTGCATCAAACACATCCCAATTGCAGGTA  592

Query  593  GAGATATTACGTATTTCATTCAACAGCTGCTAAGGGAGAGGGAGGTGGGAATCCCTCCTGAGCAGTCACTGGAG  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  GAGATATTACGTATTTCATTCAACAGCTGCTAAGGGAGAGGGAGGTGGGAATCCCTCCTGAGCAGTCACTGGAA  666

Query  667  ACCGCAAAAGCCATTAAGGAGAAATACTGTTACATTTGCCCCGATATAGTCAAGGAATTTGCCAAGTATGATGT  740
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||..||||||||.||||||||.||
Sbjct  667  ACCGCAAAAGCCATCAAGGAGAAGTACTGCTACATTTGCCCGGATATTGTCAGAGAATTTGCTAAGTATGACGT  740

Query  741  GGATCCCCGGAAGTGGATCAAACAGTACACGGGTATCAATGCGATCAACCAGAAGAAGTTTGTTATAGACGTTG  814
            .|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||||
Sbjct  741  AGATCCTCGGAAGTGGATCAAACAGTACACAGGGATCAATGCCATCAACCAGAAGAAGTTCATTATAGATGTTG  814

Query  815  GTTACGAAAGATTCCTGGGACCTGAAATATTCTTTCACCCGGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGAGTCCATC  888
            ||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTTATGAAAGGTTCCTGGGACCAGAAATATTCTTTCACCCTGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGAGTCCATC  888

Query  889  TCAGATGTTGTTGATGAAGTAATACAGAACTGCCCCATCGATGTGCGGCGCCCGCTGTATAAGAATGTCGTACT  962
            ||.||||||||.||||||||.|||||||.|||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  889  TCGGATGTTGTCGATGAAGTCATACAGAGCTGTCCCATAGATGTGCGCCGGCCGCTGTATAAGAACGTCGTTCT  962

Query  963  CTCAGGAGGCTCCACCATGTTCAGGGATTTCGGACGCCGACTGCAGAGGGATTTGAAGAGAGTGGTGGATGCTA  1036
            .||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  963  TTCTGGAGGCTCCACAATGTTCAGAGATTTTGGACGTCGTCTGCAGAGAGATTTGAAAAGAGTGGTGGACGCCA  1036

Query 1037  GGCTGAGGCTCAGCGAGGAGCTCAGCGGCGGGAGGATCAAGCCGAAGCCTGTGGAGGTCCAGGTGGTCACGCAT  1110
            ||.|.|.|||.|||.|.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1037  GGTTAAAGCTGAGCCAAGAGCTCAGTGGAGGCAGGATAAAGCCTAAACCTGTGGAGGTGCAGGTGGTCACGCAC  1110

Query 1111  CACATGCAGCGCTACGCCGTGTGGTTCGGAGGCTCCATGCTGGCCTCGACTCCCGAGTTCTTTCAGGTCTGCCA  1184
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1111  CACATGCAGCGCTATGCCGTGTGGTTTGGAGGCTCGATGCTAGCCTCAACTCCGGAGTTCTTTCAGGTCTGTCA  1184

Query 1185  CACCAAGAAGGACTATGAAGAGTACGGGCCCAGCATCTGCCGCCACAACCCCGTCTTTGGAGTCATGTCC  1254
            ||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1185  CACCAAGAAGGACTATGAGGAATACGGCCCAAGCATCTGCCGCCACAACCCTGTCTTCGGAGTCATGTCC  1254