Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03803
• Subject: NM_001310504.1
• Aligned Length: 1254
• Identities: 891
• Gaps: 264

Alignment

Query    1  ATGGCAGGCTCCCTGCCTCCCTGCGTGGTGGACTGTGGCACCGGGTATACCAAGCTTGGCTACGCAGGCAACAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGAGCCCCAGTTCATTATTCCTTCATGTATTGCCATCAGAGAGTCAGCAAAGGTAGTTGACCAAGCTCAAAGGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GAGTGTTGAGGGGAGTTGATGACCTTGACTTTTTCATAGGAGATGAAGCCATCGATAAACCTACATATGCTACA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AAGTGGCCGATACGACATGGAATCATTGAAGACTGGGATCTTATGGAAAGGTTCATGGAGCAAGTGGTTTTTAA  296
                                                      |||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct    1  ------------------------------------------ATGGAAAGGTTCATGGAACAAGTGGTCTTTAA  32

Query  297  ATATCTTCGAGCTGAACCTGAGGACCATTATTTTTTAATGACAGAACCTCCACTCAATACACCAGAAAACAGAG  370
            .||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct   33  GTATCTTCGTGCTGAACCTGAGGACCACTACTTTTTAATGACAGAACCTCCACTGAACACACCAGAAAACAGAG  106

Query  371  AGTATCTTGCAGAAATTATGTTTGAATCATTTAACGTACCAGGACTCTACATTGCAGTTCAGGCAGTGCTGGCC  444
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  107  AGTACCTTGCAGAAATCATGTTTGAATCATTTAATGTACCAGGACTCTACATTGCAGTACAGGCAGTGCTGGCT  180

Query  445  TTGGCGGCATCTTGGACATCTCGACAAGTGGGTGAACGTACGTTAACGGGGATAGTCATTGACAGCGGAGATGG  518
            .||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||..|||||||||||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  181  CTGGCAGCCTCTTGGACATCCCGGCAAGTTGGTGAACGCACACTAACGGGGATAGTTATAGACAGTGGAGACGG  254

Query  519  AGTCACCCATGTTATCCCAGTGGCAGAAGGTTATGTAATTGGAAGCTGCATCAAACACATCCCGATTGCAGGTA  592
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  255  TGTCACCCATGTTATCCCGGTGGCAGAAGGTTATGTAATTGGAAGCTGCATCAAACACATCCCAATTGCAGGTA  328

Query  593  GAGATATTACGTATTTCATTCAACAGCTGCTAAGGGAGAGGGAGGTGGGAATCCCTCCTGAGCAGTCACTGGAG  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  329  GAGATATTACGTATTTCATTCAACAGCTGCTAAGGGAGAGGGAGGTGGGAATCCCTCCTGAGCAGTCACTGGAA  402

Query  667  ACCGCAAAAGCCATTAAGGAGAAATACTGTTACATTTGCCCCGATATAGTCAAGGAATTTGCCAAGTATGATGT  740
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||..||||||||.||||||||.||
Sbjct  403  ACCGCAAAAGCCATCAAGGAGAAGTACTGCTACATTTGCCCGGATATTGTCAGAGAATTTGCTAAGTATGACGT  476

Query  741  GGATCCCCGGAAGTGGATCAAACAGTACACGGGTATCAATGCGATCAACCAGAAGAAGTTTGTTATAGACGTTG  814
            .|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||||
Sbjct  477  AGATCCTCGGAAGTGGATCAAACAGTACACAGGGATCAATGCCATCAACCAGAAGAAGTTCATTATAGATGTTG  550

Query  815  GTTACGAAAGATTCCTGGGACCTGAAATATTCTTTCACCCGGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGAGTCCATC  888
            ||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551  GTTATGAAAGGTTCCTGGGACCAGAAATATTCTTTCACCCTGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGAGTCCATC  624

Query  889  TCAGATGTTGTTGATGAAGTAATACAGAACTGCCCCATCGATGTGCGGCGCCCGCTGTATAAGAATGTCGTACT  962
            ||.||||||||.||||||||.|||||||.|||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  625  TCGGATGTTGTCGATGAAGTCATACAGAGCTGTCCCATAGATGTGCGCCGGCCGCTGTATAAGAACGTCGTTCT  698

Query  963  CTCAGGAGGCTCCACCATGTTCAGGGATTTCGGACGCCGACTGCAGAGGGATTTGAAGAGAGTGGTGGATGCTA  1036
            .||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  699  TTCTGGAGGCTCCACAATGTTCAGAGATTTTGGACGTCGTCTGCAGAGAGATTTGAAAAGAGTGGTGGACGCCA  772

Query 1037  GGCTGAGGCTCAGCGAGGAGCTCAGCGGCGGGAGGATCAAGCCGAAGCCTGTGGAGGTCCAGGTGGTCACGCAT  1110
            ||.|.|.|||.|||.|.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  773  GGTTAAAGCTGAGCCAAGAGCTCAGTGGAGGCAGGATAAAGCCTAAACCTGTGGAGGTGCAGGTGGTCACGCAC  846

Query 1111  CACATGCAGCGCTACGCCGTGTGGTTCGGAGGCTCCATGCTGGCCTCGACTCCCGAGTTCTTTCAGGTCTGCCA  1184
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  847  CACATGCAGCGCTATGCCGTGTGGTTTGGAGGCTCGATGCTAGCCTCAACTCCGGAGTTCTTTCAGGTCTGTCA  920

Query 1185  CACCAAGAAGGACTATGAAGAGTACGGGCCCAGCATCTGCCGCCACAACCCCGTCTTTGGAGTCATGTCC  1254
            ||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  921  CACCAAGAAGGACTATGAGGAATACGGCCCAAGCATCTGCCGCCACAACCCTGTCTTCGGAGTCATGTCC  990