Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03803
• Subject: XM_006535713.3
• Aligned Length: 1254
• Identities: 986
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGGCAGGCTCCCTGCCTCCCTGCGTGGTGGACTGTGGCACCGGGTATACCAAGCTTGGCTACGCAGGCAACAC  74
            |||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGGCTCGCTGCCTCCCTGCGTGGTTGACTGCGGCACCGGGTACACCAAGCTTGGCTACGCAGGCAACAC  74

Query   75  TGAGCCCCAGTTCATTATTCCTTCATGTATTGCCATCAGAGAGTCAGCAAAGGTAGTTGACCAAGCTCAAAGGA  148
            |||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  TGAACCACAGTTCATTATCCCGTCATGTATCGCCATCCGAGAATCTGCAAAGGTAGTTGATCAAGCCCAAAGGA  148

Query  149  GAGTGTTGAGGGGAGTTGATGACCTTGACTTTTTCATAGGAGATGAAGCCATCGATAAACCTACATATGCTACA  222
            |.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.
Sbjct  149  GGGTGTTGAGAGGAGTCGATGACCTTGATTTCTTCATAGGGGATGAAGCCATTGATAAACCTACCTACGCTACC  222

Query  223  AAGTGGCCGATACGACATGGAATCATTGAAGACTGGGATCTTATGGAAAGGTTCATGGAGCAAGTGGTTTTTAA  296
            ||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  223  AAGTGGCCTATACGACATGGCATCGTTGAAGACTGGGATCTTATGGAAAGGTTCATGGAACAAGTGGTCTTTAA  296

Query  297  ATATCTTCGAGCTGAACCTGAGGACCATTATTTTTTAATGACAGAACCTCCACTCAATACACCAGAAAACAGAG  370
            .||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  297  GTATCTTCGTGCTGAACCTGAGGACCACTACTTTTTAATGACAGAACCTCCACTGAACACACCAGAAAACAGAG  370

Query  371  AGTATCTTGCAGAAATTATGTTTGAATCATTTAACGTACCAGGACTCTACATTGCAGTTCAGGCAGTGCTGGCC  444
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  371  AGTACCTTGCAGAAATCATGTTTGAATCATTTAATGTACCAGGACTCTACATTGCAGTACAGGCAGTGCTGGCT  444

Query  445  TTGGCGGCATCTTGGACATCTCGACAAGTGGGTGAACGTACGTTAACGGGGATAGTCATTGACAGCGGAGATGG  518
            .||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||..|||||||||||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  445  CTGGCAGCCTCTTGGACATCCCGGCAAGTTGGTGAACGCACACTAACGGGGATAGTTATAGACAGTGGAGACGG  518

Query  519  AGTCACCCATGTTATCCCAGTGGCAGAAGGTTATGTAATTGGAAGCTGCATCAAACACATCCCGATTGCAGGTA  592
            .|||||||||||||||||.||                                                     
Sbjct  519  TGTCACCCATGTTATCCCGGT-----------------------------------------------------  539

Query  593  GAGATATTACGTATTTCATTCAACAGCTGCTAAGGGAGAGGGAGGTGGGAATCCCTCCTGAGCAGTCACTGGAG  666
                                                                                      
Sbjct  540  --------------------------------------------------------------------------  539

Query  667  ACCGCAAAAGCCATTAAGGAGAAATACTGTTACATTTGCCCCGATATAGTCAAGGAATTTGCCAAGTATGATGT  740
                             ||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||..||||||||.||||||||.||
Sbjct  540  -----------------GGAGAAGTACTGCTACATTTGCCCGGATATTGTCAGAGAATTTGCTAAGTATGACGT  596

Query  741  GGATCCCCGGAAGTGGATCAAACAGTACACGGGTATCAATGCGATCAACCAGAAGAAGTTTGTTATAGACGTTG  814
            .|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||||
Sbjct  597  AGATCCTCGGAAGTGGATCAAACAGTACACAGGGATCAATGCCATCAACCAGAAGAAGTTCATTATAGATGTTG  670

Query  815  GTTACGAAAGATTCCTGGGACCTGAAATATTCTTTCACCCGGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGAGTCCATC  888
            ||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  GTTATGAAAGGTTCCTGGGACCAGAAATATTCTTTCACCCTGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGAGTCCATC  744

Query  889  TCAGATGTTGTTGATGAAGTAATACAGAACTGCCCCATCGATGTGCGGCGCCCGCTGTATAAGAATGTCGTACT  962
            ||.||||||||.||||||||.|||||||.|||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  745  TCGGATGTTGTCGATGAAGTCATACAGAGCTGTCCCATAGATGTGCGCCGGCCGCTGTATAAGAACGTCGTTCT  818

Query  963  CTCAGGAGGCTCCACCATGTTCAGGGATTTCGGACGCCGACTGCAGAGGGATTTGAAGAGAGTGGTGGATGCTA  1036
            .||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  819  TTCTGGAGGCTCCACAATGTTCAGAGATTTTGGACGTCGTCTGCAGAGAGATTTGAAAAGAGTGGTGGACGCCA  892

Query 1037  GGCTGAGGCTCAGCGAGGAGCTCAGCGGCGGGAGGATCAAGCCGAAGCCTGTGGAGGTCCAGGTGGTCACGCAT  1110
            ||.|.|.|||.|||.|.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  893  GGTTAAAGCTGAGCCAAGAGCTCAGTGGAGGCAGGATAAAGCCTAAACCTGTGGAGGTGCAGGTGGTCACGCAC  966

Query 1111  CACATGCAGCGCTACGCCGTGTGGTTCGGAGGCTCCATGCTGGCCTCGACTCCCGAGTTCTTTCAGGTCTGCCA  1184
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  967  CACATGCAGCGCTATGCCGTGTGGTTTGGAGGCTCGATGCTAGCCTCAACTCCGGAGTTCTTTCAGGTCTGTCA  1040

Query 1185  CACCAAGAAGGACTATGAAGAGTACGGGCCCAGCATCTGCCGCCACAACCCCGTCTTTGGAGTCATGTCC  1254
            ||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1041  CACCAAGAAGGACTATGAGGAATACGGCCCAAGCATCTGCCGCCACAACCCTGTCTTCGGAGTCATGTCC  1110