Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03844
• Subject: XM_005252113.5
• Aligned Length: 1722
• Identities: 1673
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  -----ATGGGCTCCAG----------------GATCAA------------------------GCAGAATCCAGA  29
                 |||.|||.|||                |.|.||                        ||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGATGCGCTGCAGCAGCCTTGAGACATCTGCTGAATGAAACTAGAAAAGTTTGCTTATGGCAGAATCCAGA  74

Query   30  GACCACATTTGAAGTATATGTTGAAGTGGCCTATCCCAGGACAGGTGGCACTCTTTCAGATCCTGAGGTGCAGA  103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACCACATTTGAAGTATATGTTGAAGTGGCCTATCCCAGGACAGGTGGCACTCTTTCAGATCCTGAGGTGCAGA  148

Query  104  GGCAATTCCCGGAGGACTACAGTGACCAGGAAGTTCTACAGACTTTGACCAAGTTTTGTTTCCCCTTCTATGTG  177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCAATTCCCGGAGGACTACAGTGACCAGGAAGTTCTACAGACTTTGACCAAGTTTTGTTTCCCCTTCTATGTG  222

Query  178  GACAGCCTCACAGTTAGCCAAGTTGGCCAGAACTTCACATTCGTGCTCACTGACATTGACAGCAAACAGAGATT  251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAGCCTCACAGTTAGCCAAGTTGGCCAGAACTTCACATTCGTGCTCACTGACATTGACAGCAAACAGAGATT  296

Query  252  CGGGTTCTGCCGCTTATCTTCAGGAGCGAAGAGCTGCTTCTGTATCTTAAGCTATCTCCCCTGGTTCGAGGTAT  325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGGTTCTGCCGCTTATCTTCAGGAGCGAAGAGCTGCTTCTGTATCTTAAGCTATCTCCCCTGGTTCGAGGTAT  370

Query  326  TTTATAAGCTGCTTAACATCCTGGCAGATTACACGACAAAAAGACAGGAAAATCAGTGGAATGAGCTTCTTGAA  399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTATAAGCTGCTTAACATCCTGGCAGATTACACGACAAAAAGACAGGAAAATCAGTGGAATGAGCTTCTTGAA  444

Query  400  ACTCTGCACAAACTTCCCATCCCTGACCCAGGAGTGTCTGTCCATCTCAGCGTGCATTCTTATTTTACTGTGCC  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTCTGCACAAACTTCCCATCCCTGACCCAGGAGTGTCTGTCCATCTCAGCGTGCATTCTTATTTTACTGTGCC  518

Query  474  TGATACCAGAGAACTTCCCAGCATACCTGAGAATAGAAATCTGACAGAATATTTTGTGGCTGTGGATGTTAACA  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGATACCAGAGAACTTCCCAGCATACCTGAGAATAGAAATCTGACAGAATATTTTGTGGCTGTGGATGTTAACA  592

Query  548  ACATGTTGCATCTGTACGCCAGTATGCTGTACGAACGCCGGATACTCATCATTTGCAGCAAACTCAGCACTCTG  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATGTTGCATCTGTACGCCAGTATGCTGTACGAACGCCGGATACTCATCATTTGCAGCAAACTCAGCACTCTG  666

Query  622  ACTGCCTGCATCCACGGGTCTGCGGCGATGCTCTACCCCATGTACTGGCAGCACGTGTACATCCCCGTGCTGCC  695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTGCCTGCATCCACGGGTCTGCGGCGATGCTCTACCCCATGTACTGGCAGCACGTGTACATCCCCGTGCTGCC  740

Query  696  GCCGCATCTGCTGGACTACTGCTGTGCTCCCATGCCCTACCTCATAGGAATCCATTTAAGTTTAATGGAGAAAG  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCGCATCTGCTGGACTACTGCTGTGCTCCCATGCCCTACCTCATAGGAATCCATTTAAGTTTAATGGAGAAAG  814

Query  770  TCAGAAACATGGCCCTGGATGATGTCGTGATCCTGAATGTGGACACCAACACCCTGGAAACCCCCTTCGATGAC  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAGAAACATGGCCCTGGATGATGTCGTGATCCTGAATGTGGACACCAACACCCTGGAAACCCCCTTCGATGAC  888

Query  844  CTCCAGAGCCTCCCAAACGACGTGATCTCTTCCCTGAAGAACAGGCTGAAAAAGGTCTCCACAACCACTGGGGA  917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCCAGAGCCTCCCAAACGACGTGATCTCTTCCCTGAAGAACAGGCTGAAAAAGGTCTCCACAACCACTGGGGA  962

Query  918  TGGTGTGGCCAGAGCGTTCCTCAAGGCCCAGGCTGCTTTCTTCGGTAGCTACCGAAACGCTCTGAAAATCGAGC  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGTGTGGCCAGAGCGTTCCTCAAGGCCCAGGCTGCTTTCTTCGGTAGCTACCGAAACGCTCTGAAAATCGAGC  1036

Query  992  CGGAGGAGCCGATCACTTTCTGTGAGGAAGCCTTCGTGTCCCACTACCGCTCCGGAGCCATGAGGCAGTTCCTG  1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGGAGGAGCCGATCACTTTCTGTGAGGAAGCCTTCGTGTCCCACTACCGCTCCGGAGCCATGAGGCAGTTCCTG  1110

Query 1066  CAGAACGCCACACAGCTGCAGCTCTTCAAGCAGTTTATTGATGGTCGATTAGATCTTCTCAATTCCGGCGAAGG  1139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGAACGCCACACAGCTGCAGCTCTTCAAGCAGTTTATTGATGGTCGATTAGATCTTCTCAATTCCGGCGAAGG  1184

Query 1140  TTTCAGTGATGTTTTTGAAGAGGAAATCAACATGGGCGAGTACGCTGGCAGTGACAAACTGTACCATCAGTGGC  1213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTCAGTGATGTTTTTGAAGAGGAAATCAACATGGGCGAGTACGCTGGCAGTGACAAACTGTACCATCAGTGGC  1258

Query 1214  TCTCCACTGTCCGGAAAGGAAGTGGAGCAATTCTGAATACTGTAAAGACCAAAGCAAATCCGGCCATGAAGACT  1287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTCCACTGTCCGGAAAGGAAGTGGAGCAATTCTGAATACTGTAAAGACCAAAGCAAATCCGGCCATGAAGACT  1332

Query 1288  GTCTACAAGTTCGCAAAAGATCATGCAAAAATGGGAATAAAAGAGGTGAAAAACCGCTTGAAGCAAAAGGACAT  1361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTCTACAAGTTCGCAAAAGATCATGCAAAAATGGGAATAAAAGAGGTGAAAAACCGCTTGAAGCAAAAGGACAT  1406

Query 1362  TGCCGAGAATGGCTGCGCCCCCACCCCAGAAGAGCAGCTGCCAAAGACTGCACCGTCCCCACTGGTGGAGGCCA  1435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCCGAGAATGGCTGCGCCCCCACCCCAGAAGAGCAGCTGCCAAAGACTGCACCGTCCCCACTGGTGGAGGCCA  1480

Query 1436  AGGACCCCAAGCTCCGAGAAGACCGGCGGCCAATCACAGTCCACTTTGGACAGGTGCGCCCACCTCGTCCACAT  1509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGACCCCAAGCTCCGAGAAGACCGGCGGCCAATCACAGTCCACTTTGGACAGGTGCGCCCACCTCGTCCACAT  1554

Query 1510  GTTGTTAAGAGACCAAAGAGCAACATCGCAGTGGAAGGCCGGAGGACGTCTGTGCCGAGCCCTGAGCAAAACAC  1583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTTGTTAAGAGACCAAAGAGCAACATCGCAGTGGAAGGCCGGAGGACGTCTGTGCCGAGCCCTGAGCAAAACAC  1628

Query 1584  CATTGCAACACCAGCTACACTCCACATCCTACAGAAAAGCATTACCCATTTTGCGGCCAAGTTCCCGACGAGAG  1657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATTGCAACACCAGCTACACTCCACATCCTACAGAAAAGCATTACCCATTTTGCGGCCAAGTTCCCGACGAGAG  1702

Query 1658  GCTGGACCTCTTCATCACAT  1677
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCTGGACCTCTTCATCACAT  1722