Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04457
• Subject: NM_001098797.2
• Aligned Length: 1518
• Identities: 1392
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGACGTCCGCCTGTACCCCTCGGCGCCCGCGGTGGGCGCGCGGCCCGGGGCCGAGCCGGCCGGCCTGGCGCA  74

Query    1  ----------------------------------------------------ATGAGTGACGGAAACCCAGAGC  22
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGACTATTACCACGGCGGCAAGTTTGATGGTGACAGTGCCTACGTGGGGATGAGTGACGGAAACCCAGAGC  148

Query   23  TCCTGTCAACCAGCCAGACCTACAACGGCCAGAGCGAGAACAACGAAGACTATGAGATCCCCCCGATAACACCT  96
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCTGTCAACCAGCCAGACCTACAACGGCCAGAGCGAGAACAACGAAGACTATGAGATCCCCCCGATAACACCT  222

Query   97  CCCAACCTCCCGGAGCCATCCCTCCTGCACCTGGGGGACCACGAAGCCAGCTACCACTCGCTGTGCCACGGCCT  170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCAACCTCCCGGAGCCATCCCTCCTGCACCTGGGGGACCACGAAGCCAGCTACCACTCGCTGTGCCACGGCCT  296

Query  171  CACCCCCAACGGTCTGCTCCCTGCCTACTCCTATCAGGCCATGGACCTCCCAGCCATCATGGTGTCCAACATGC  244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACCCCCAACGGTCTGCTCCCTGCCTACTCCTATCAGGCCATGGACCTCCCAGCCATCATGGTGTCCAACATGC  370

Query  245  TAGCACAGGACAGCCACCTGCTGTCGGGCCAGCTGCCCACGATCCAGGAGATGGTCCACTCGGAAGTGGCTGCC  318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGCACAGGACAGCCACCTGCTGTCGGGCCAGCTGCCCACGATCCAGGAGATGGTCCACTCGGAAGTGGCTGCC  444

Query  319  TATGACTCGGGCCGGCCCGGGCCCCTGCTGGGTCGCCCGGCAATGCTGGCCAGCCACATGAGTGCCCTCAGCCA  392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATGACTCGGGCCGGCCCGGGCCCCTGCTGGGTCGCCCGGCAATGCTGGCCAGCCACATGAGTGCCCTCAGCCA  518

Query  393  GTCCCAGCTCATCTCGCAGATGGGCATCCGGAGCAGCATCGCCCACAGCTCCCCATCACCGCCGGGGAGCAAGT  466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTCCCAGCTCATCTCGCAGATGGGCATCCGGAGCAGCATCGCCCACAGCTCCCCATCACCGCCGGGGAGCAAGT  592

Query  467  CAGCGACCCCCTCTCCCTCCAGCTCCACTCAGGAAGAGGAGTCGGAAGTGCATTTCAAGATCTCGGGAGAAAAG  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGCGACCCCCTCTCCCTCCAGCTCCACTCAGGAAGAGGAGTCGGAAGTGCATTTCAAGATCTCGGGAGAAAAG  666

Query  541  AGACCTTCAGCCGACCCAGGAAAAAAGGCCAAGAACCCGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGACCCCAATGAGCCGCA  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGACCTTCAGCCGACCCAGGAAAAAAGGCCAAGAACCCGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGACCCCAATGAGCCGCA  740

Query  615  GAAGCCTGTGTCGGCCTACGCACTCTTCTTCAGAGACACTCAGGCCGCCATCAAGGGTCAGAACCCCAGTGCCA  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGCCTGTGTCGGCCTACGCACTCTTCTTCAGAGACACTCAGGCCGCCATCAAGGGTCAGAACCCCAGTGCCA  814

Query  689  CTTTCGGTGACGTGTCCAAAATCGTGGCCTCCATGTGGGACAGCCTGGGAGAGGAACAGAAGCAGGCCTACAAG  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTTCGGTGACGTGTCCAAAATCGTGGCCTCCATGTGGGACAGCCTGGGAGAGGAACAGAAGCAGGCCTACAAG  888

Query  763  AGGAAGACAGAAGCAGCAAAGAAGGAATATCTGAAGGCCCTGGCAGCCTACCGGGCTAGCCTCGTCTCCAAGAG  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGAAGACAGAAGCAGCAAAGAAGGAATATCTGAAGGCCCTGGCAGCCTACCGGGCTAGCCTCGTCTCCAAGAG  962

Query  837  CTCCCCAGATCAAGGTGAGACCAAGAGCACTCAGGCAAACCCACCAGCCAAAATGCTCCCACCCAAGCAGCCCA  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCCCCAGATCAAGGTGAGACCAAGAGCACTCAGGCAAACCCACCAGCCAAAATGCTCCCACCCAAGCAGCCCA  1036

Query  911  TGTATGCCATGCCAGGCCTGGCCTCCTTCCTGACGCCGTCGGACCTGCAGGCCTTCCGCAGTGGGGCCTCCCCT  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGTATGCCATGCCAGGCCTGGCCTCCTTCCTGACGCCGTCGGACCTGCAGGCCTTCCGCAGTGGGGCCTCCCCT  1110

Query  985  GCCAGCCTCGCCCGGACGCTGGGCTCCAAGTCTCTGCTGCCAGGCCTCAGTGCGTCCCCGCCGCCGCCACCCTC  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCAGCCTCGCCCGGACGCTGGGCTCCAAGTCTCTGCTGCCAGGCCTCAGTGCGTCCCCGCCGCCGCCACCCTC  1184

Query 1059  CTTCCCGCTCAGCCCCACACTGCACCAGCAGCTGTCACTGCCCCCTCACGCCCAGGGCGCCCTCCTCAGTCCAC  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTCCCGCTCAGCCCCACACTGCACCAGCAGCTGTCACTGCCCCCTCACGCCCAGGGCGCCCTCCTCAGTCCAC  1258

Query 1133  CTGTTAGCATGTCCCCAGCCCCCCAGCCCCCTGTCCTGCCCACCCCCATGGCACTCCAGGTGCAGCTGGCGATG  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGTTAGCATGTCCCCAGCCCCCCAGCCCCCTGTCCTGCCCACCCCCATGGCACTCCAGGTGCAGCTGGCGATG  1332

Query 1207  AGCCCCTCACCTCCAGGGCCACAGGACTTCCCGCACATCTCTGAGTTCCCCAGCAGCTCGGGATCCTGCTCACC  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGCCCCTCACCTCCAGGGCCACAGGACTTCCCGCACATCTCTGAGTTCCCCAGCAGCTCGGGATCCTGCTCACC  1406

Query 1281  TGGCCCATCCAACCCCACCAGCAGCGGGGACTGGGACAGCAGCTACCCCAGTGGGGAGTGTGGCATCAGCACCT  1354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGCCCATCCAACCCCACCAGCAGCGGGGACTGGGACAGCAGCTACCCCAGTGGGGAGTGTGGCATCAGCACCT  1480

Query 1355  GCAGCCTGCTCCCCAGGGACAAATCGCTCTACCTCACC  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCAGCCTGCTCCCCAGGGACAAATCGCTCTACCTCACC  1518