Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05873
- Subject:
- NM_007509.3
- Aligned Length:
- 1533
- Identities:
- 1368
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGCGCTGCGGGCGATGCGGGGGATTGTCAACGGGGCCGCACCCGAGCTACCCGTGCCCACCGGTGGGCCGGC 74
||||||.||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||..
Sbjct 1 ATGGCGTTGCGAGCGATGCGGGGAATCGTGAACGGGGCCGCACCCGAACTGCCCGTGCCCACCGGTGGGCCGAT 74
Query 75 GGNGGGAGCTCAGGAGCAGGCGCTGGCAGTCAGTCGGAACTACCTCTCCCAGCCTCGCCTCACATACAAGACAG 148
||..|||||||.|||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 75 GGCCGGAGCTCGGGAGCAGGCGCTGGCGGTGAGCCGGAACTACCTATCCCAGCCTCGTCTCACCTACAAGACTG 148
Query 149 TATCTGGAGTCAATGGTCCACTAGTGATCTTAGATCATGTTAAGTTTCCCAGGTATGCTGAAATTGTCCATTTG 222
|.|||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 149 TCTCTGGGGTGAATGGTCCACTAGTGATCCTAGATCATGTGAAGTTTCCCAGATACGCTGAGATTGTCCACTTG 222
Query 223 ACCTTACCGGATGGCACAAAGAGAAGTGGGCAAGTTCTGGAAGTTAGTGGTTCCAAGGCAGTAGTTCAGGTATT 296
||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 223 ACATTACCAGATGGCACAAAGAGAAGTGGGCAAGTCCTAGAAGTTAGTGGCTCCAAAGCAGTGGTTCAGGTATT 296
Query 297 TGAAGGGACTTCAGGTATAGATGCTAAGAAAACGTCCTGTGAGTTTACTGGGGATATTCTCCGAACACCGGTGT 370
|||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 TGAAGGGACATCTGGTATAGACGCCAAGAAAACATCCTGTGAGTTTACTGGAGATATTCTCCGAACACCAGTGT 370
Query 371 CTGAGGATATGCTTGGTCGGGTATTCAATGGATCGGGAAAACCCATTGACAGAGGTCCTGTTGTACTGGCCGAA 444
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 371 CTGAGGATATGCTTGGTCGAGTATTCAACGGATCAGGAAAACCCATTGACCGAGGCCCTGTGGTGCTGGCTGAA 444
Query 445 GACTTCCTTGATATCATGGGTCAGCCAATCAACCCTCAATGTCGAATCTACCCAGAGGAAATGATTCGGACTGG 518
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||.|||.||
Sbjct 445 GACTTCCTTGACATCATGGGTCAGCCAATCAACCCTCAGTGTCGGATCTATCCAGAAGAGATGATTCAGACGGG 518
Query 519 CATTTCGGCCATCGATGGGATGAACAGTATTGCTAGGGGGCAGAAAATTCCTATCTTCTCTGCTGCTGGGCTAC 592
||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||..|||
Sbjct 519 CATTTCCGCCATCGATGGCATGAACAGTATTGCTAGGGGACAGAAAATCCCCATCTTTTCTGCTGCTGGATTAC 592
Query 593 CACACAATGAGATTGCAGCTCAGATCTGTCGCCAGGCTGGTTTGGTAAAGAAATCCAAAGATGTAGTAGACTAC 666
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 593 CACACAACGAGATTGCAGCTCAGATCTGTCGCCAGGCTGGTTTGGTAAAGAAATCCAAAGATGTAGTGGACTAT 666
Query 667 AGTGAGGAAAATTTTGCAATTGTATTTGCTGCTATGGGTGTAAACATGGAAACTGCCCGGTTCTTCAAATCTGA 740
|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 667 AGTGAAGAAAATTTTGCCATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTAAACATGGAAACAGCCCGGTTCTTTAAATCTGA 740
Query 741 CTTTGAAGAAAATGGCTCAATGGACAATGTCTGCCTCTTTTTGAACTTGGCTAATGACCCAACCATTGAGCGAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 741 CTTTGAAGAAAATGGCTCAATGGACAATGTCTGCCTTTTTTTGAATCTGGCTAATGACCCAACCATTGAGCGGA 814
Query 815 TTATCACTCCTCGCCTGGCTCTAACCACAGCTGAATTTCTGGCGTACCAATGTGAGAAACATGTATTGGTTATT 888
|.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||..||||.||.
Sbjct 815 TCATCACTCCTCGCCTGGCTCTGACCACGGCCGAGTTTCTGGCATATCAGTGTGAGAAGCACGTGCTGGTGATC 888
Query 889 CTAACAGACATGAGTTCTTATGCTGAAGCACTTCGAGAGGTTTCAGCAGCCAGGGAAGAGGTACCTGGTCGACG 962
||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 889 CTGACGGACATGAGCTCCTACGCTGAAGCGCTGCGAGAGGTTTCAGCTGCCAGGGAAGAGGTCCCTGGTCGGCG 962
Query 963 AGGTTTTCCAGGTTACATGTATACAGATTTAGCCACGATATATGAACGCGCTGGGCGAGTGGGAGGGAGAAACG 1036
|||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||.|||.|||||||
Sbjct 963 AGGCTTCCCAGGCTACATGTATACCGACTTAGCCACAATCTATGAACGTGCCGGTCGAGTGGAAGGTAGAAACG 1036
Query 1037 GCTCGATTACTCAAATCCCTATTCTAACCATGCCTAATGATGATATCACTCACCCCATCCCAGACTTGACTGGC 1110
||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1037 GCTCTATTACCCAAATCCCTATTCTCACCATGCCCAATGACGATATCACTCATCCCATCCCTGACTTGACTGGG 1110
Query 1111 TACATTACAGAGGGGCAGATCTATGTGGACAGACAGCTGCACAACAGACAGATTTATCCACCTATCAATGTGCT 1184
||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1111 TACATTACTGAGGGCCAGATCTATGTGGACAGACAGCTGCACAACAGACAGATTTACCCTCCTATTAATGTGCT 1184
Query 1185 GCCCTCACTATCACGGTTAATGAAGTCTGCTATTGGAGAAGGGATGACCAGGAAGGATCATGCCGATGTATCTA 1258
|||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1185 GCCCTCACTCTCTCGGTTAATGAAGTCAGCTATCGGAGAAGGAATGACCAGAAAGGATCACGCTGATGTGTCTA 1258
Query 1259 ACCAGCTATATGCGTGCTATGCTATTGGAAAGGATGTGCAAGCCATGAAAGCTGTCGTTGGAGAAGAAGCCCTT 1332
|||||.|.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 1259 ACCAGTTGTATGCGTGCTATGCCATCGGTAAGGACGTGCAAGCCATGAAAGCCGTGGTGGGAGAGGAAGCCCTG 1332
Query 1333 ACCTCAGATGATCTTCTCTACTTGGAATTTCTGCAGAAGTTTGAGAGGAACTTCATTGCTCAGGGTCCTTACGA 1406
||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||.||.||
Sbjct 1333 ACCTCAGATGATCTCCTTTACCTGGAATTTCTGCAGAAGTTTGAGAAGAACTTCATTACTCAGGGTCCCTATGA 1406
Query 1407 AAATCGCACTGTCTTTGAGACTTTGGACATTGGCTGGCAGCTACTCCGAATCTTCCCCAAAGAAATGCTGAAGA 1480
|||.||.|||||.|.|||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AAACCGAACTGTTTATGAGACTTTGGACATTGGCTGGCAGTTGCTTCGAATCTTCCCCAAAGAAATGCTGAAGA 1480
Query 1481 GAATCCCTCAGAGCACCCTCAGCGAATTTTACCCTCGAGACTCTGCAAAGCAT 1533
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1481 GAATCCCTCAGAGCACCCTGAGCGAATTTTACCCTCGAGACTCTGCAAAACAC 1533