Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06926
• Subject: NM_001294332.1
• Aligned Length: 1992
• Identities: 1847
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGTCGGGGGTCCGGGGCCTGTCGCGGCTGCTGAGCGCTCGGCGCCTGGCGCTGGCCAAGGCGTGGCCAACAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGGGGTCCGGGGCCTGTCGCGGCTGCTGAGCGCTCGGCGCCTGGCGCTGGCCAAGGCGTGGCCAACAGT  74

Query   75  GTTGCAAACAGGAACCCGAGGTTTTCACTTCACTGTTGATGGGAACAAGAGGGCATCTGCTAAAGTTTCAGATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTGCAAACAGGAACCCGAGGTTTTCACTTCACTGTTGATGGGAACAAGAGGGCATCTGCTAAAGTTTCAGATT  148

Query  149  CCATTTCTGCTCAGTATCCAGTAGTGGATCATGAATTTGATGCAGTGGTGGTAGGCGCTGGAGGGGCAGGCTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATTTCTGCTCAGTATCCAGTAGTGGATCATGAATTTGATGCAGTGGTGGTAGGCGCTGGAGGGGCAGGCTTG  222

Query  223  CGAGCTGCATTTGGCCTTTCTGAGGCAGGGTTTAATACAGCATGTGTTACCAAGCTGTTTCCTACCAGGTCACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGAGCTGCATTTGGCCTTTCTGAGGCAGGGTTTAATACAGCATGTGTTACCAAGCTGTTTCCTACCAGGTCACA  296

Query  297  CACTGTTGCAGCACAGGGAGGAATCAATGCTGCTCTGGGGAACATGGAGGAGGACAACTGGAGGTGGCATTTCT  370
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct  297  CACTGTTGCAGCAC------------------------------------------------------------  310

Query  371  ACGACACCGTGAAGGGCTCCGACTGGCTGGGGGACCAGGATGCCATCCACTACATGACGGAGCAGGCCCCCGCC  444
                                                                                      
Sbjct  311  --------------------------------------------------------------------------  310

Query  445  GCCGTGGTCGAGCTAGAAAATTATGGCATGCCGTTTAGCAGAACTGAAGATGGGAAGATTTATCAGCGTGCATT  518
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  311  ----------AGCTAGAAAATTATGGCATGCCGTTTAGCAGAACTGAAGATGGGAAGATTTATCAGCGTGCATT  374

Query  519  TGGTGGACAGAGCCTCAAGTTTGGAAAGGGCGGGCAGGCCCATCGGTGCTGCTGTGTGGCTGATCGGACTGGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TGGTGGACAGAGCCTCAAGTTTGGAAAGGGCGGGCAGGCCCATCGGTGCTGCTGTGTGGCTGATCGGACTGGCC  448

Query  593  ACTCGCTATTGCACACCTTATATGGAAGGTCTCTGCGATATGATACCAGCTATTTTGTGGAGTATTTTGCCTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  ACTCGCTATTGCACACCTTATATGGAAGGTCTCTGCGATATGATACCAGCTATTTTGTGGAGTATTTTGCCTTG  522

Query  667  GATCTCCTGATGGAGAATGGGGAGTGCCGTGGTGTCATCGCACTGTGCATAGAGGACGGGTCCATCCATCGCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  GATCTCCTGATGGAGAATGGGGAGTGCCGTGGTGTCATCGCACTGTGCATAGAGGACGGGTCCATCCATCGCAT  596

Query  741  AAGAGCAAAGAACACTGTTGTTGCCACAGGAGGCTACGGGCGCACCTACTTCAGCTGCACGTCTGCCCACACCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  AAGAGCAAAGAACACTGTTGTTGCCACAGGAGGCTACGGGCGCACCTACTTCAGCTGCACGTCTGCCCACACCA  670

Query  815  GCACTGGCGACGGCACGGCCATGATCACCAGGGCAGGCCTTCCTTGCCAGGACCTAGAGTTTGTTCAGTTCCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  GCACTGGCGACGGCACGGCCATGATCACCAGGGCAGGCCTTCCTTGCCAGGACCTAGAGTTTGTTCAGTTCCAC  744

Query  889  CCCACAGGCATATATGGTGCTGGTTGTCTCATTACGGAAGGATGTCGTGGAGAGGGAGGCATTCTCATTAACAG  962
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  CCTACAGGCATATATGGTGCTGGTTGTCTCATTACGGAAGGATGTCGTGGAGAGGGAGGCATTCTCATTAACAG  818

Query  963  TCAAGGCGAAAGGTTTATGGAGCGATACGCCCCTGTCGCGAAGGACCTGGCGTCTAGAGATGTGGTGTCTCGGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  TCAAGGCGAAAGGTTTATGGAGCGATACGCCCCTGTCGCGAAGGACCTGGCGTCTAGAGATGTGGTGTCTCGGT  892

Query 1037  CCATGACTCTGGAGATCCGAGAAGGAAGAGGCTGTGGCCCTGAGAAAGATCACGTCTACCTGCAGCTGCACCAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  CCATGACTCTGGAGATCCGAGAAGGAAGAGGCTGTGGCCCTGAGAAAGATCACGTCTACCTGCAGCTGCACCAC  966

Query 1111  CTACCTCCAGAGCAGCTGGCCACGCGCCTGCCTGGCATTTCAGAGACAGCCATGATCTTCGCTGGCGTGGACGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  967  CTACCTCCAGAGCAGCTGGCCACGCGCCTGCCTGGCATTTCAGAGACAGCCATGATCTTCGCTGGCGTGGACGT  1040

Query 1185  CACGAAGGAGCCGATCCCTGTCCTCCCCACCGTGCATTATAACATGGGCGGCATTCCCACCAACTACAAGGGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  CACGAAGGAGCCGATCCCTGTCCTCCCCACCGTGCATTATAACATGGGCGGCATTCCCACCAACTACAAGGGGC  1114

Query 1259  AGGTCCTGAGGCACGTGAATGGCCAGGATCAGATTGTGCCCGGCCTGTACGCCTGTGGGGAGGCCGCCTGTGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  AGGTCCTGAGGCACGTGAATGGCCAGGATCAGATTGTGCCCGGCCTGTACGCCTGTGGGGAGGCCGCCTGTGCC  1188

Query 1333  TCGGTACATGGTGCCAACCGCCTCGGGGCAAACTCGCTCTTGGACCTGGTTGTCTTTGGTCGGGCATGTGCCCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189  TCGGTACATGGTGCCAACCGCCTCGGGGCAAACTCGCTCTTGGACCTGGTTGTCTTTGGTCGGGCATGTGCCCT  1262

Query 1407  GAGCATCGAAGAGTCATGCAGGCCTGGAGATAAAGTCCCTCCAATTAAACCAAACGCTGGGGAAGAATCTGTCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  GAGCATCGAAGAGTCATGCAGGCCTGGAGATAAAGTCCCTCCAATTAAACCAAACGCTGGGGAAGAATCTGTCA  1336

Query 1481  TGAATCTTGACAAATTGAGATTTGCTGATGGAAGCATAAGAACATCGGAACTGCGACTCAGCATGCAGAAGTCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337  TGAATCTTGACAAATTGAGATTTGCTGATGGAAGCATAAGAACATCGGAACTGCGACTCAGCATGCAGAAGTCA  1410

Query 1555  ATGCAAAATCATGCTGCCGTGTTCCGTGTGGGAAGCGTGTTGCAAGAAGGTTGTGGGAAAATCAGCAAGCTCTA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411  ATGCAAAATCATGCTGCCGTGTTCCGTGTGGGAAGCGTGTTGCAAGAAGGTTGTGGGAAAATCAGCAAGCTCTA  1484

Query 1629  TGGAGACCTAAAGCACCTGAAGACGTTCGACCGGGGAATGGTCTGGAACACGGACCTGGTGGAGACCCTGGAGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485  TGGAGACCTAAAGCACCTGAAGACGTTCGACCGGGGAATGGTCTGGAACACGGACCTGGTGGAGACCCTGGAGC  1558

Query 1703  TGCAGAACCTGATGCTGTGTGCGCTGCAGACCATCTACGGAGCAGAGGCACGGAAGGAGTCACGGGGCGCGCAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559  TGCAGAACCTGATGCTGTGTGCGCTGCAGACCATCTACGGAGCAGAGGCACGGAAGGAGTCACGGGGCGCGCAT  1632

Query 1777  GCCAGGGAAGACTACAAGGTGCGGATTGATGAGTACGATTACTCCAAGCCCATCCAGGGGCAACAGAAGAAGCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633  GCCAGGGAAGACTACAAGGTGCGGATTGATGAGTACGATTACTCCAAGCCCATCCAGGGGCAACAGAAGAAGCC  1706

Query 1851  CTTTGAGGAGCACTGGAGGAAGCACACCCTGTCCTATGTGGACGTTGGCACTGGGAAGGTCACTCTGGAATATA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707  CTTTGAGGAGCACTGGAGGAAGCACACCCTGTCCTATGTGGACGTTGGCACTGGGAAGGTCACTCTGGAATATA  1780

Query 1925  GACCCGTGATCGACAAAACTTTGAACGAGGCTGACTGTGCCACCGTCCCGCCAGCCATTCGCTCCTAC  1992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781  GACCCGTGATCGACAAAACTTTGAACGAGGCTGACTGTGCCACCGTCCCGCCAGCCATTCGCTCCTAC  1848