Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07245
• Subject: NM_008905.2
• Aligned Length: 2668
• Identities: 2288
• Gaps: 62

Alignment

Query    1  ATGGCTTCTGATGCTAGTCATGCGCTGGAAGCTGCCCTGGAGCAAATGGACGGGATCATTGCAGGCACTAAAAC  74
            |||.|||||||.|||||||||..|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTTCTGACGCTAGTCATATGCTGGAAGCTGCCCTGGAGCAGATGGACGGGATCATTGCAGGCACTAAAAC  74

Query   75  AGGTGCAGATCTTAGTGATGGTACTTGTGAGCCTGGACTGGCTTCCCCGGCCTCCTACATGAACCCCTTCCCGG  148
            ||.|||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||.||.||||..||.|||.|.|||||.||.|.||.|
Sbjct   75  AGCTGCAGATTTTAGTGATGGTACCTGTGAGCCTGGGCTGTCTCCCCCATCCACCTGCTTGAACTCCATGCCTG  148

Query  149  TGCTCCATCTCATCGAGGACTTGAGGCTGGCCTTGGAGATGCTGGAGCTTCCTCAGGAGAGAGCAGCCCTCCTG  222
            |||||||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||.|||..|||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct  149  TGCTCCATCTCATTGAGGACCTGAGACTAGCCTTGGAGATGTTGGCACTTCCTCAGGAAAGAGAAGCCCTCCTG  222

Query  223  AGCCAGATCCCTGGCCCAACAGCTGCCTACATAAAGGAATGGTTTGAAGAGAGCTTGTCCCAGGTAAACCACCA  296
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  AGCCAGGTCCCTGGCCCAACAGCTACCTACATAAAGGAGTGGTTTGAGGACAGCTTGTCCCAGGTAAATCACCA  296

Query  297  CAGTGCTGCTAGTAATGAAACCTACCAGGAACGCTTGGCACGTCTAGAAGGGGATAAGGAGTCCCTCATATTGC  370
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|.|
Sbjct  297  CGGTGCTGCTAGTAATGAAACCTACCAGGAACGCCTGGCACGGCTAGAAGGAGATAAAGAGTCCCTCATACTAC  370

Query  371  AGGTGAGTGTCATCACAGACCAAGTAGAAGCCCAGGGAGAAAAGATTCGAGACCTGGAAGTGTGTCTGGAAGGA  444
            |||||||.|||.|||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  371  AGGTGAGCGTCCTCACAGATCAAGTGGAAGCCCAAGGAGAGAAGATTCGGGACCTTGAAGTGTGTCTGGAAGGC  444

Query  445  CACCAGGTGAAACTCAATGCTGCTGAAGAGATGCTTCAACAGGAGCTGCTAAGCCGCACATCTCTTGAGACCCA  518
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CACCAGGTGAAGCTCAATGCTGCAGAAGAGATGCTTCAGCAGGAGCTGCTAAGTCGCACATCTCTGGAGACCCA  518

Query  519  GAAGCTCGATCTGATGACTGAAGTGTCTGAGCTGAAGCTCAAGCTGGTTGGCATGGAGAAGGAGCAGAGAGAGC  592
            ||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||.|||.|
Sbjct  519  GAAGTTGGATCTGATGACTGAGGTGTCTGAGCTGAAGCTCAAGCTGGTTGGTATGGAAAAAGAACAGAAAGAAC  592

Query  593  AGGAGGAGAAGCAGAGAAAAGCAGAGGAGTTACTGCAAGAGCTCAGGCACCTCAAAATCAAAGTGGAAGAGTTG  666
            |.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.|||||.|||.||
Sbjct  593  AAGAAGAAAAACAGAGAAAAGCAGAGGAGTTACTGCAAGAGCTTAAGCACCTCAAAATCAAGGTGGAGGAGCTG  666

Query  667  GAAAATGAAAGGAATCAGTATGAATGGAAGCTAAAGGCCACTAAGGCTGAAGTCGCCCAGCTGCAAGAACAGGT  740
            ||.||.||..||||.||||||||.|||.||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGAACGAGCGGAACCAGTATGAGTGGGAGCTGAAGGCCACCAAGGCTGAGGTAGCCCAGCTGCAAGAACAGGT  740

Query  741  GGCCCTGAAAGATGCAGAAATTGAGCGTCTGCACAGCCAGCTCTCCCGGACAGCAGCTCTCCACAGTGAGAGTC  814
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||.||   .|
Sbjct  741  GGCCCTAAAAGATGCAGAAATTGAGCGTCTCCACAGCCAGCTCTCCCGGAGTGCAGCTCTCCACAGCGA---CC  811

Query  815  ACACAGAGAGAGACCAAGAAATTCAACGTCTGAAAATGGGGATGGAAACTTTGCTGCTTGCCAATGAAGATAAG  888
            |..|||||.||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||||.||||||
Sbjct  812  ATGCAGAGCGAGATCAAGAAATCCACCGTCTGAAAATGGGGATGGAAACACTGCTGGTTGCCAATGAGGATAAG  885

Query  889  GACCGTCGGATAGAGGAGCTTACGGGGCTGTTAAACCAGTACCGGAAGGTAAAGGAGATTGTGATGGTCACTCA  962
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||||..|.||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct  886  GACCGTCGGATAGAGGAGCTGACAGGGCTGTTGAACAAGTACCTAAGGGTAAAGGAGATTGTGATGGCAACTCA  959

Query  963  AGGGCCTTCGGAGAGAACTCTCTCAATCAATGAAGAAGAACCGGAGGGAGGTTTCAGCAAGTGGAACGCTACAA  1036
            .||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||...||||||.|.|||.|.||.|||||..|.||||
Sbjct  960  GGGGCCTTCAGAAAGAACCCTCTCCATCAATGAAGATGAAATAGAGGGAAGCTTCCGAAAATGGAATACCACAA  1033

Query 1037  ATAAGGACCCTGAAGAATTATTTAAACAAGAGATGCCTCCAAGATGTAGCTCTCCTACAGTGGGGCCACCTCCA  1110
            ||||...|||.||.|||.|....||.||||||||..|.|||.||||.||||||||.||....||.||||||||.
Sbjct 1034  ATAAAAGCCCAGAGGAAGTCCCGAAGCAAGAGATATCACCACGATGCAGCTCTCCCACCCCAGGACCACCTCCT  1107

Query 1111  TTGCCACAGAAATCACTGGAAACCAGGGCTCAGAAAAAGCTCTCTTGTAGTCTAGAAGACTTGAGAAGTGAATC  1184
            ||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1108  TTGCCACAGAAATCACTGGAGAGCAGGGCTCAGAAGAAACTCTCCTGCAGTCTAGAAGACTTGAGACGTGAATC  1181

Query 1185  TGTGGATAAGTGTATGGATGGGAACCAGCCCTTCCCGGTGTTAGAACCCAAGGACAGCCCTTTCTTGGCGGAGC  1258
            ||.||||||||||.|.|||||||||||||..|.|||.|||..|||.||||||||||||.|||||.|.|||||||
Sbjct 1182  TGGGGATAAGTGTGTCGATGGGAACCAGCTGTCCCCAGTGGGAGAGCCCAAGGACAGCTCTTTCCTAGCGGAGC  1255

Query 1259  ACAAATATCCCACTTTACCTGGGAAGCTTTCAGGAGCCACGCCCAATGGAGAGGCTGCCAAATCTCCTCCCACC  1332
            |.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||  
Sbjct 1256  AGAAATACCCCACATTACCTGGGAAGCTTTCAGGAGCCACACCCAATGGAGAAGCTGCCAAATCTCCTCCCA--  1327

Query 1333  ATCTG-------CCAGCCTGACGCCACGGGGAGCAGCCTGCTGAGGCTGA------------------------  1375
              |||       ||||||||||.|..|.||||||||||.||..|.|||||                        
Sbjct 1328  --CTGCCTCCCTCCAGCCTGACTCTTCAGGGAGCAGCCAGCCAAAGCTGAATCGCGGCTGGAGTGTCAGTGCTC  1399

Query 1376  ---------GAGACACAGAAAGTGGCTGGGATGACACTGCTGTGGTCAATGACCTCTCATCCACATCATCGGGC  1440
                     |||||||||||.|.||||||||.||.|..|               |||||||..|.||.||.||.
Sbjct 1400  CCGTATTAGGAGACACAGAAGGAGGCTGGGAAGATATAG---------------TCTCATCTGCTTCGTCTGGG  1458

Query 1441  ACTGAATCAGGTCCTCAGTCTCCTCTGACACCAGATGGTAAACGGAATCCCAAAGGCATTAAGAAGTTCTGGGG  1514
            |||||.|||.|.|||||||||||..|||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459  ACTGAGTCAAGCCCTCAGTCTCCCGTGACACCAGATGGCAAACGGAGCCCCAAAGGCATTAAGAAGTTCTGGGG  1532

Query 1515  AAAAATCCGAAGAACTCAGTCAGGAAATTTCTACACTGACACGCTGGGGATGGCAGAGTTTCGACGAGGTGGGC  1588
            |||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||..|.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533  AAAGATCCGAAGAACTCAGTCTGGAAACTTCAATACTGATGCACCGGGGATGGCAGAGTTTCGACGAGGTGGGC  1606

Query 1589  TCCGGGCAACCGCAGGGCCAAGACTCTCTAGGACCAGGGACTCCAAGGGACAGAAAAGTGACGCCAATGCCCCC  1662
            ||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 1607  TCCGAGCAACTGCGGGACCAAGGCTTTCTAGGACCAGGGACACCAAGGGACAGAAATGTGATGCCAATGCCCCC  1680

Query 1663  TTTGCCCAGTGGAGCACAGAGCGTGTGTGTGCATGGCTGGAGGACTTTGGCCTGGCTCAGTATGTGATCTTTGC  1736
            ||||||||||||||||||||.||.||.|||.|||||.|||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1681  TTTGCCCAGTGGAGCACAGAACGCGTATGTACATGGATGGAGGATTTCGGCCTGGGTCAGTATGTGATCTTTGC  1754

Query 1737  CAGGCAGTGGGTATCTTCTGGCCACACCTTATTGACAGCCACCCCTCAGGACATGGAAAAGGAGCTAGGAATTA  1810
            |||.||||||||..|.|||||.||.||..||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1755  CAGACAGTGGGTGACATCTGGACATACACTACTGACAGCTACCCCTCAGGACATGGAAAAGGAGCTAGGGATTA  1828

Query 1811  AGCACCCACTCCACAGGAAGAAGCTTGTTTTAGCAGTGAAAGCCATCAACACCAAACAGGAGGAGAAGTCTGCA  1884
            |.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||.||.||.|.||||||.
Sbjct 1829  AACACCCCCTCCACAGGAAGAAGCTGGTTTTAGCAGTGAAAGCTATCAACGCCAAGCAAGAAGAAACGTCTGCG  1902

Query 1885  CTGCTAGACCACATTTGGGTGACAAGGTGGCTTGATGATATTGGCTTACCCCAGTACAAAGACCAGTTTCATGA  1958
            |||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1903  CTGCTGGACCACATTTGGGTGACACGGTGGCTTGATGATATTGGCTTACCCCAATACAAAGACCAGTTTCATGA  1976

Query 1959  ATCTAGAGTTGACGGACGAATGCTGCAATACCTAACTGTGAACGATTTACTCTTCTTAAAAGTCACCAGCCAAC  2032
            |||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977  ATCAAGAGTTGATGGGCGAATGCTGCAATACCTAACTGTGAATGATCTACTCTTCTTAAAAGTCACCAGCCAAC  2050

Query 2033  TACATCATCTCAGCATCAAATGTGCCATTCACGTGCTGCATGTCAACAAGTTCAACCCCCACTGCCTGCACCGG  2106
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2051  TACATCATCTCAGCATCAAATGTGCTATTCACGTGCTACATGTCAACAAGTTCAACCCCAACTGCCTGCACAGG  2124

Query 2107  CGGCCAGCTGATGAGAGTAACCTTTCTCCTTCAGAAGTTGTACAGTGGTCCAACCACAGGGTGATGGAGTGGTT  2180
            .||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|
Sbjct 2125  AGGCCTGCTGATGAGAGTAACCTTTCCCCTTCCGAAGTTGTGCAGTGGTCCAACCACAGGGTAATGGAGTGGCT  2198

Query 2181  ACGATCTGTGGACCTGGCAGAGTATGCACCCAATCTTCGAGGGAGTGGAGTCCATGGAGGCCTCATTATCCTGG  2254
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2199  GCGATCCGTGGACCTGGCAGAGTATGCACCCAACCTTCGAGGGAGTGGCGTCCATGGCGGCCTCATTATCCTGG  2272

Query 2255  AGCCACGCTTCACTGGGGACACCCTGGCTATGCTTCTCAACATCCCCCCACAAAAGACGCTCCTCAGGCGCCAC  2328
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2273  AGCCTCGCTTTACTGGGGACACCCTGGCTATGCTTCTTAACATCCCCCCACAGAAGACGCTCCTCAGGCGCCAT  2346

Query 2329  CTGACCACCAAGTTCAATGCCTTGATTGGTCCGGAGGCTGAACAGGAAAAGCGAGAGAAAATGGCCTCACCAGC  2402
            |||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 2347  CTGACCACCAAGTTCAACGCCCTGATTGGTCCTGAGGCTGAACAGGAAAAGCGAGACAAAATGGCCTCACCCGC  2420

Query 2403  TTACACACCACTGACCACCACAGCCAAAGTCCGGCCAAGGAAACTAGGATTTTCACACTTCGGAAACATAAGAA  2476
            .||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 2421  CTACACACCTCTGACCACCACCGCCAAAGTTCGGCCTAGGAAACTTGGATTTTCACATTTTGGAAACATGAGAA  2494

Query 2477  AAAAGAAGTTCGATGAATCGACGGACTACATTTGCCCAATGGAGCCCAGTGACGGTGTCAGTGATAGTCACAGG  2550
            ||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||..|.||.|.|||||||||.||.||||||
Sbjct 2495  AAAAGAAGTTTGATGAATCTACAGATTACATTTGCCCCATGGAGCCTGGAGATGCTGTCAGTGACAGCCACAGG  2568

Query 2551  GTCTACAGTGGCTACCGGGGCCTCAGCCCCCTTGATGCCCCTGAACTGGATGGGCTGGACCAGGTGGGACAGAT  2624
            ||||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||...||.||||||.|||||..|||||||||||||||||||
Sbjct 2569  GTCTACGGAGTCTACCGGGGCCTCAGTCCCCTTGACAACCATGAACTAGATGGTTTGGACCAGGTGGGACAGAT  2642

Query 2625  CAGC  2628
            .|||
Sbjct 2643  AAGC  2646