Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07245
- Subject:
- XM_006507451.1
- Aligned Length:
- 2679
- Identities:
- 1841
- Gaps:
- 555
Alignment
Query 1 ATGGCTTCTGATGCTAGTCATGCGCTGGAAGCTGCCCTGGAGCAAATGGACGGGATCATTGCAGGCACTAAAAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGGTGCAGATCTTAGTGATGGTACTTGTGAGCCTGGACTGGCTTCCCCGGCCTCCTACATGAACCCCTTCCCGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGCTCCATCTCATCGAGGACTTGAGGCTGGCCTTGGAGATGCTGGAGCTTCCTCAGGAGAGAGCAGCCCTCCTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AGCCAGATCCCTGGCCCAACAGCTGCCTACATAAAGGAATGGTTTGAAGAGAGCTTGTCCCAGGTAAACCACCA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CAGTGCTGCTAGTAATGAAACCTACCAGGAACGCTTGGCACGTCTAGAAGGGGATAAGGAGTCCCTCATATTGC 370
||..|.||.| |||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------ATGTGTAGGC--------TGC 13
Query 371 AGGTGAGTGTCAT-CACAGACCAAGTAGAAGCCCAGGGAGAAAAGATTCGAGA---CCTGGAAGTGTGTCTGGA 440
||.|| |.||| |||||.| ||||||.||| ||||..|.| || || |
Sbjct 14 AGCTG---GACATCCACAGGC----------------------AGATTCAAGAGCGCCTGTTACT-TG-CT--A 58
Query 441 AGGA-CACCAGGTGAAACTCAATGCTGCTGAAGAGATGCT------TCAACAGGAGCTGCTAAGCCGCACATCT 507
.||| |||| ||||.|||.||.| |.|.||.||| ||.|||||.||
Sbjct 59 GGGACCACC------------------CTGAGGAGCTGGTGGCCGGTGACCACGAG--GCCAAGCCCCA----- 107
Query 508 CTTGAGACCCAGAAGCTCGATCTGATGACTGAAGTGTCTGAGCTGAAGCTCAAGCTGGTTGGCATGGAGAAGGA 581
.|||.|.||| .|.||||| .||...|||
Sbjct 108 ------GCCCTGCAGC-------CAGGACTG---------------------TGCCCCTTG------------- 134
Query 582 GCAGAGAGAGCAGGAGGAGAAGCAGAGAAAAGCAGAGGAGTTACTGCAAGAGCTCAGGCACCTCAAAATCAAAG 655
|||||.| .||...|||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.|
Sbjct 135 ------------GGAGGGG------------TCACCTGAGTTACTGCAAGAGCTTAAGCACCTCAAAATCAAGG 184
Query 656 TGGAAGAGTTGGAAAATGAAAGGAATCAGTATGAATGGAAGCTAAAGGCCACTAAGGCTGAAGTCGCCCAGCTG 729
||||.|||.||||.||.||..||||.||||||||.|||.||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 185 TGGAGGAGCTGGAGAACGAGCGGAACCAGTATGAGTGGGAGCTGAAGGCCACCAAGGCTGAGGTAGCCCAGCTG 258
Query 730 CAAGAACAGGTGGCCCTGAAAGATGCAGAAATTGAGCGTCTGCACAGCCAGCTCTCCCGGACAGCAGCTCTCCA 803
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 259 CAAGAACAGGTGGCCCTAAAAGATGCAGAAATTGAGCGTCTCCACAGCCAGCTCTCCCGGAGTGCAGCTCTCCA 332
Query 804 CAGTGAGAGTCACACAGAGAGAGACCAAGAAATTCAACGTCTGAAAATGGGGATGGAAACTTTGCTGCTTGCCA 877
|||.|| .||..|||||.||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|||||.||||||
Sbjct 333 CAGCGA---CCATGCAGAGCGAGATCAAGAAATCCACCGTCTGAAAATGGGGATGGAAACACTGCTGGTTGCCA 403
Query 878 ATGAAGATAAGGACCGTCGGATAGAGGAGCTTACGGGGCTGTTAAACCAGTACCGGAAGGTAAAGGAGATTGTG 951
||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||||..|.||||||||||||||||
Sbjct 404 ATGAGGATAAGGACCGTCGGATAGAGGAGCTGACAGGGCTGTTGAACAAGTACCTAAGGGTAAAGGAGATTGTG 477
Query 952 ATGGTCACTCAAGGGCCTTCGGAGAGAACTCTCTCAATCAATGAAGAAGAACCGGAGGGAGGTTTCAGCAAGTG 1025
||||..|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||...||||||.|.|||.|.||.||
Sbjct 478 ATGGCAACTCAGGGGCCTTCAGAAAGAACCCTCTCCATCAATGAAGATGAAATAGAGGGAAGCTTCCGAAAATG 551
Query 1026 GAACGCTACAAATAAGGACCCTGAAGAATTATTTAAACAAGAGATGCCTCCAAGATGTAGCTCTCCTACAGTGG 1099
|||..|.||||||||...|||.||.|||.|....||.||||||||..|.|||.||||.||||||||.||....|
Sbjct 552 GAATACCACAAATAAAAGCCCAGAGGAAGTCCCGAAGCAAGAGATATCACCACGATGCAGCTCTCCCACCCCAG 625
Query 1100 GGCCACCTCCATTGCCACAGAAATCACTGGAAACCAGGGCTCAGAAAAAGCTCTCTTGTAGTCTAGAAGACTTG 1173
|.||||||||.||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 626 GACCACCTCCTTTGCCACAGAAATCACTGGAGAGCAGGGCTCAGAAGAAACTCTCCTGCAGTCTAGAAGACTTG 699
Query 1174 AGAAGTGAATCTGTGGATAAGTGTATGGATGGGAACCAGCCCTTCCCGGTGTTAGAACCCAAGGACAGCCCTTT 1247
|||.|||||||||.||||||||||.|.|||||||||||||..|.|||.|||..|||.||||||||||||.||||
Sbjct 700 AGACGTGAATCTGGGGATAAGTGTGTCGATGGGAACCAGCTGTCCCCAGTGGGAGAGCCCAAGGACAGCTCTTT 773
Query 1248 CTTGGCGGAGCACAAATATCCCACTTTACCTGGGAAGCTTTCAGGAGCCACGCCCAATGGAGAGGCTGCCAAAT 1321
|.|.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 774 CCTAGCGGAGCAGAAATACCCCACATTACCTGGGAAGCTTTCAGGAGCCACACCCAATGGAGAAGCTGCCAAAT 847
Query 1322 CTCCTCCCACCATCTG-------CCAGCCTGACGCCACGGGGAGCAGCCTGCTGAGGCTGA------------- 1375
||||||||| ||| ||||||||||.|..|.||||||||||.||..|.|||||
Sbjct 848 CTCCTCCCA----CTGCCTCCCTCCAGCCTGACTCTTCAGGGAGCAGCCAGCCAAAGCTGAATCGCGGCTGGAG 917
Query 1376 --------------------GAGACACAGAAAGTGGCTGGGATGACACTGCTGTGGTCAATGACCTCTCATCCA 1429
|||||||||||.|.||||||||.||.|..| |||||||..
Sbjct 918 TGTCAGTGCTCCCGTATTAGGAGACACAGAAGGAGGCTGGGAAGATATAG---------------TCTCATCTG 976
Query 1430 CATCATCGGGCACTGAATCAGGTCCTCAGTCTCCTCTGACACCAGATGGTAAACGGAATCCCAAAGGCATTAAG 1503
|.||.||.||.|||||.|||.|.|||||||||||..|||||||||||||.|||||||..|||||||||||||||
Sbjct 977 CTTCGTCTGGGACTGAGTCAAGCCCTCAGTCTCCCGTGACACCAGATGGCAAACGGAGCCCCAAAGGCATTAAG 1050
Query 1504 AAGTTCTGGGGAAAAATCCGAAGAACTCAGTCAGGAAATTTCTACACTGACACGCTGGGGATGGCAGAGTTTCG 1577
||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||..|.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1051 AAGTTCTGGGGAAAGATCCGAAGAACTCAGTCTGGAAACTTCAATACTGATGCACCGGGGATGGCAGAGTTTCG 1124
Query 1578 ACGAGGTGGGCTCCGGGCAACCGCAGGGCCAAGACTCTCTAGGACCAGGGACTCCAAGGGACAGAAAAGTGACG 1651
|||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||.|
Sbjct 1125 ACGAGGTGGGCTCCGAGCAACTGCGGGACCAAGGCTTTCTAGGACCAGGGACACCAAGGGACAGAAATGTGATG 1198
Query 1652 CCAATGCCCCCTTTGCCCAGTGGAGCACAGAGCGTGTGTGTGCATGGCTGGAGGACTTTGGCCTGGCTCAGTAT 1725
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||.|||||.|||||||.||.|||||||.|||||||
Sbjct 1199 CCAATGCCCCCTTTGCCCAGTGGAGCACAGAACGCGTATGTACATGGATGGAGGATTTCGGCCTGGGTCAGTAT 1272
Query 1726 GTGATCTTTGCCAGGCAGTGGGTATCTTCTGGCCACACCTTATTGACAGCCACCCCTCAGGACATGGAAAAGGA 1799
||||||||||||||.||||||||..|.|||||.||.||..||.|||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273 GTGATCTTTGCCAGACAGTGGGTGACATCTGGACATACACTACTGACAGCTACCCCTCAGGACATGGAAAAGGA 1346
Query 1800 GCTAGGAATTAAGCACCCACTCCACAGGAAGAAGCTTGTTTTAGCAGTGAAAGCCATCAACACCAAACAGGAGG 1873
||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||.||.|
Sbjct 1347 GCTAGGGATTAAACACCCCCTCCACAGGAAGAAGCTGGTTTTAGCAGTGAAAGCTATCAACGCCAAGCAAGAAG 1420
Query 1874 AGAAGTCTGCACTGCTAGACCACATTTGGGTGACAAGGTGGCTTGATGATATTGGCTTACCCCAGTACAAAGAC 1947
|.|.||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1421 AAACGTCTGCGCTGCTGGACCACATTTGGGTGACACGGTGGCTTGATGATATTGGCTTACCCCAATACAAAGAC 1494
Query 1948 CAGTTTCATGAATCTAGAGTTGACGGACGAATGCTGCAATACCTAACTGTGAACGATTTACTCTTCTTAAAAGT 2021
||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct 1495 CAGTTTCATGAATCAAGAGTTGATGGGCGAATGCTGCAATACCTAACTGTGAATGATCTACTCTTCTTAAAAGT 1568
Query 2022 CACCAGCCAACTACATCATCTCAGCATCAAATGTGCCATTCACGTGCTGCATGTCAACAAGTTCAACCCCCACT 2095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1569 CACCAGCCAACTACATCATCTCAGCATCAAATGTGCTATTCACGTGCTACATGTCAACAAGTTCAACCCCAACT 1642
Query 2096 GCCTGCACCGGCGGCCAGCTGATGAGAGTAACCTTTCTCCTTCAGAAGTTGTACAGTGGTCCAACCACAGGGTG 2169
||||||||.||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1643 GCCTGCACAGGAGGCCTGCTGATGAGAGTAACCTTTCCCCTTCCGAAGTTGTGCAGTGGTCCAACCACAGGGTA 1716
Query 2170 ATGGAGTGGTTACGATCTGTGGACCTGGCAGAGTATGCACCCAATCTTCGAGGGAGTGGAGTCCATGGAGGCCT 2243
|||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1717 ATGGAGTGGCTGCGATCCGTGGACCTGGCAGAGTATGCACCCAACCTTCGAGGGAGTGGCGTCCATGGCGGCCT 1790
Query 2244 CATTATCCTGGAGCCACGCTTCACTGGGGACACCCTGGCTATGCTTCTCAACATCCCCCCACAAAAGACGCTCC 2317
|||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1791 CATTATCCTGGAGCCTCGCTTTACTGGGGACACCCTGGCTATGCTTCTTAACATCCCCCCACAGAAGACGCTCC 1864
Query 2318 TCAGGCGCCACCTGACCACCAAGTTCAATGCCTTGATTGGTCCGGAGGCTGAACAGGAAAAGCGAGAGAAAATG 2391
||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1865 TCAGGCGCCATCTGACCACCAAGTTCAACGCCCTGATTGGTCCTGAGGCTGAACAGGAAAAGCGAGACAAAATG 1938
Query 2392 GCCTCACCAGCTTACACACCACTGACCACCACAGCCAAAGTCCGGCCAAGGAAACTAGGATTTTCACACTTCGG 2465
||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1939 GCCTCACCCGCCTACACACCTCTGACCACCACCGCCAAAGTTCGGCCTAGGAAACTTGGATTTTCACATTTTGG 2012
Query 2466 AAACATAAGAAAAAAGAAGTTCGATGAATCGACGGACTACATTTGCCCAATGGAGCCCAGTGACGGTGTCAGTG 2539
||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||..|.||.|.||||||||
Sbjct 2013 AAACATGAGAAAAAAGAAGTTTGATGAATCTACAGATTACATTTGCCCCATGGAGCCTGGAGATGCTGTCAGTG 2086
Query 2540 ATAGTCACAGGGTCTACAGTGGCTACCGGGGCCTCAGCCCCCTTGATGCCCCTGAACTGGATGGGCTGGACCAG 2613
|.||.||||||||||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||...||.||||||.|||||..||||||||
Sbjct 2087 ACAGCCACAGGGTCTACGGAGTCTACCGGGGCCTCAGTCCCCTTGACAACCATGAACTAGATGGTTTGGACCAG 2160
Query 2614 GTGGGACAGATCAGC 2628
|||||||||||.|||
Sbjct 2161 GTGGGACAGATAAGC 2175
