Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07469
- Subject:
- XM_006539300.3
- Aligned Length:
- 3579
- Identities:
- 2990
- Gaps:
- 381
Alignment
Query 1 ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTCTTTCAGCCCCCACCTGAAACATCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACATGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGGACTCACTCCAGCCCTGTCCCAGGATCTATAGGAGTTGCAGGCCGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACTTCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGGAGGCGGCTATAATAATAGCAAACATCGATGGCCTACTGGGGATAACATTCATGCAGAACATCAGGTGCGTT 370
|| |||.||.|
Sbjct 1 --------------------------------------------------------------AT--GGTACGCT 10
Query 371 CCATGGATGAACTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAGGGAAGAGCGATGGGAGAGCAGCTCTTGCCA 444
|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 11 CTATGGATGAATTGAATCATGATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAAGGGAGAGCTATGGGCGAGCAGCTCTTGCCA 84
Query 445 GGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85 GGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGATGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCG 158
Query 519 AGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 159 AGACAGTGCCTGGGGAACATCAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAGAGAAGACCTGGTCAGAGTT 232
Query 593 TCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGATCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 233 TCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACTGTCCCCACGGTCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTG 306
Query 667 GAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGATTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGATGCAGACAG 740
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307 GAGTATGTGTTGAGCTCATCCCCGGGCGACTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGGCCCAAGGGATGCAGACAG 380
Query 741 TGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381 TGATGAAAACGACAAAGGTGAAAAGAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGG 454
Query 815 AGGGTGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTACCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAGATTTTAGC 888
||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455 AGGGAGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTGCCAGTGCAGAATGGGATTGATGCAGACGTCAAAGATTTTAGC 528
Query 889 CGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTTCTGAGGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529 CGTACCCCTGGTAATTGCCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTTCTGAGGG 602
Query 963 CTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTGTCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 CTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAGGATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTGTCC 676
Query 1037 CCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTTCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTACCTGTGGAC 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677 CCTTGGACCCCATGGAACATGTGGGCATGGAGCCTCTGCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTACCTGTGGAC 750
Query 1111 TCAGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTGTTCCAAAGACCTAATGCGCTTGC 1184
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 751 TCTGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAACAGCTATTCCAAAGACCCAATGCACTTGC 824
Query 1185 TGTCCAGCAGTTGACAGCTGCTCAGCAGCAGCAGTATGCACTGGCAGCTGCTCATCAGCCGCACATC------- 1251
|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 825 TGTTCAGCAGTTGACAGCTGCCCAGCAGCAGCAGTATGCACTTGCAGCAGCCCACCAGCCTCACATCGGTATGT 898
Query 1252 --------GGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAATCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACGGAC 1317
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 TTCCAGCAGGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAACCCATACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACGGAC 972
Query 1318 CCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTAGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAGTATTATGGAGTTAC 1391
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 973 CCCTACACAGCTGGATTGGCTGCAGCAGCGACACTCGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACCAATATTATGGAGTCAC 1046
Query 1392 TCCCTGGGGAGTCTACCCTGCCAGTCTTTTCCAGCAGCAAGCTGCCGCTGCCGCTGCAGCAACTAATTCAGCTA 1465
.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.||.||.||||
Sbjct 1047 GCCATGGGGTGTCTACCCTGCCAGTCTCTTCCAGCAGCAGGCAGCTGCAGCTGCAGCAGCTACAAACTCTGCTA 1120
Query 1466 ATCAACAGACCACCCCACAGGCTCAGCAAGGACAGCAGCAGGTTCTCCGTGGAGGAGCCAGCCAACGTCCTTTG 1539
.|||.||||.|.|.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1121 CTCAGCAGAGCGCTCCGCAGGCCCAGCAGGGACAGCAGCAGGTTCTTCGTGGAGGAGCTAGCCAACGTCCTTTG 1194
Query 1540 ACCCCAAACCAGAACCAGCAGGGACAGCAAACGGATCCCCTTGTGGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCCCTTGC 1613
||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1195 ACCCCAAATCAGAACCAGCAGGGACAACAAACAGATCCCCTTGTAGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCTCTTGC 1268
Query 1614 ATTTGGACAAGGTCTGGCAGCAGGCATGCCAGGTTATCCGGTGTTGGCTCCTGCTGCTTACTATGACCAAACTG 1687
.|||||||||||..||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1269 CTTTGGACAAGGATTGGCTGCAGGTATGCCAGGTTATCCAGTCTTGGCACCTGCTGCTTACTATGACCAAACTG 1342
Query 1688 GTGCCCTTGTAGTGAATGCAGGCGCGAGAAATGGTCTTGGAGCTCCTGTTCGACTTGTAGCTCCTGCCCCAGTC 1761
||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1343 GTGCCCTTGTGGTGAATGCAGGGGCAAGAAATGGCCTCGGAGCTCCAGTCCGGCTTGTTGCTCCAGCCCCAGTC 1416
Query 1762 ATCATTAGTTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCAGCCGCAGCTTCAGCAAATGGAGCAGCTGGTGGTCT 1835
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1417 ATCATTAGCTCCTCAGCTGCACAAGCAGCTGTTGCAGCGGCTGCAGCGTCAGCAAACGGAGCAGCTGGTGGTCT 1490
Query 1836 TGCTGGAACAACAAATGGACCATTTCGCCCTTTAGGAACACAGCAGCCTCAGCCCCAGCCCCAGCAGCAGCCCA 1909
|||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1491 TGCCGGAACTACAAATGGACCATTTCGACCTTTAGGCACCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCCTCAGCAGCAGCCCA 1564
Query 1910 ATAACAACCTGGCATCCAGTTCTTTCTACGGCAACAACTCTCTGAACAGCAATTCACAGAGCAGCTCCCTCTTC 1983
.||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1565 GTAACAATCTGGCTTCCAGCTCTTTCTATGGCAACAACTCTCTGAGCAGTAACTCCCAGAGCAGCTCCCTCTTC 1638
Query 1984 TCCCAGGGCTCTGCCCAGCCTGCCAACACATCCTTGGGATTCGGAAGTAGCAGTTCTCTCGGCGCCACCCTGGG 2057
||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1639 TCTCAGGGCTCTGCACAGCCTGCCAACACGTCCTTGGGATTCGGAAGCAGCAGTTCCCTTGGTGCCACCCTGGG 1712
Query 2058 ATCCGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGACTCCCTGA 2131
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1713 ATCGGCCCTTGGAGGGTTTGGAACAGCAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCGTGACTCCCTGA 1786
Query 2132 CTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGACCCCCATTGGACACAGTTTTTATAACGGCCTT 2205
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 1787 CTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCTTGGCCCCCATTGGACACAGTTTTTATAGCAGCCTT 1860
Query 2206 AGCTTTTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAGACACCACC 2279
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 AGCTATTCCTCCTCTCCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACAGACACCACC 1934
Query 2280 TCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACGAACGGCAGTGGAAGATACA 2353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1935 TCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACCTGGGAGGACTCACAAACGGCAGTGGAAGATACA 2008
Query 2354 TCTCTGCTGCTCCAGGCGCTGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGCGCCTCCAGCCTCTTCAGCCCGAGCAGC 2427
|||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 2009 TCTCTGCTGCTCCCGGTGCCGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGTGCCTCCAGCCTTTTCAGCCCCAGCAGC 2082
Query 2428 ACTCTTTTCTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTCATGCCTTCTGGCAGGAGCAGGCTTTTGGA 2501
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 2083 ACCCTTTTTTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAATGTCTGATGTTATGCCCTCTGGCAGGAGCAGACTTCTGGA 2156
Query 2502 AGATTTTCGAAACAACCGGTACCCCAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGACATATAATGGAATTTTCCCAAG 2575
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2157 AGATTTTCGAAACAACCGGTACCCTAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGGCATATAATGGAATTTTCTCAAG 2230
Query 2576 ACCAGCATGGGTCCAGATTCATTCAGCTGAAACTGGAGCGTGCCACACCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTCAAT 2649
||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2231 ACCAGCATGGCTCTAGATTCATTCAGCTGAAACTAGAGCGTGCCACAGCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTCAAT 2304
Query 2650 GAAATCCTCCAGGCTGCCTACCAACTCATGGTGGATGTGTTTGGTAATTACGTCATTCAGAAGTTCTTTGAATT 2723
|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2305 GAAATCCTCCAGGCTGCGTACCAACTTATGGTGGATGTGTTTGGAAATTACGTCATTCAGAAGTTTTTTGAATT 2378
Query 2724 TGGCAGTCTTGAACAGAAGCTGGCTTTGGCAGAACGGATTCGAGGCCACGTCCTGTCATTGGCACTACAGATGT 2797
||||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2379 TGGCAGTCATGAACAGAAGCTGGCTCTGGCTGAACGGATTCGAGGCCATGTCCTATCATTGGCACTGCAGATGT 2452
Query 2798 ATGGCTGCCGTGTTATCCAGAAAGCTCTTGAGTTTATTCCTTCAGACCAGCAG------AATGAGATGGTTCGG 2865
|.||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||| ||.||||||||.|||
Sbjct 2453 ACGGCTGCCGAGTCATCCAGAAAGCTTTGGAGTTTATTCCCTCAGACCAGCAGGTAATTAACGAGATGGTGCGG 2526
Query 2866 GAACTAGATGGCCATGTCTTGAAGTGTGTGAAAGATCAGAATGGCAATCACGTGGTTCAGAAATGCATTGAATG 2939
||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 2527 GAGCTAGATGGCCATGTCCTGAAGTGTGTGAAAGACCAGAACGGCAACCATGTGGTTCAGAAGTGCATTGAGTG 2600
Query 2940 TGTACAGCCCCAGTCTTTGCAATTTATCATCGATGCGTTTAAGGGACAGGTATTTGCCTTATCCACACATCCTT 3013
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.|
Sbjct 2601 TGTACAGCCCCAGTCTTTGCAGTTTATCATCGATGCATTCAAGGGGCAGGTGTTTGCTTTGTCTACGCACCCGT 2674
Query 3014 ATGGCTGCCGAGTGATTCAGAGAATCCTGGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACACTCCCTATTTTAGAGGAGCTT 3087
|.|||||..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|.|||||||||
Sbjct 2675 ACGGCTGTAGGGTGATCCAGAGGATCCTAGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACCCTCCCCATCCTGGAGGAGCTT 2748
Query 3088 CACCAGCACACAGAGCAGCTTGTACAGGATCAATATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCACGGTCG 3161
|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2749 CACCAGCACACAGAGCAGCTTGTGCAGGATCAGTATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCATGGTCG 2822
Query 3162 TCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAAATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAAATTTGCAA 3235
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2823 TCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAGATCCGAGGCAATGTACTTGTATTGAGTCAGCACAAGTTTGCAA 2896
Query 3236 GCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACGGAGCGCGCTGTGCTCATCGATGAGGTGTGCACC 3309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2897 GCAATGTTGTGGAGAAGTGTGTTACTCACGCCTCACGTACAGAGCGTGCTGTGCTCATTGATGAGGTGTGCACC 2970
Query 3310 ATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGACCAGTATGCCAACTACGTGGTCCAGAAGAT 3383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 2971 ATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGATCAGTATGCTAACTATGTGGTCCAGAAGAT 3044
Query 3384 GATTGACGTGGCGGAGCCAGGCCAGCGGAAGATCGTCATGCATAAGATCCGGCCCCACATCGCAACTCTTCGTA 3457
|||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 3045 GATCGATGTGGCTGAGCCGGGTCAGCGGAAGATTGTCATGCACAAGATCCGGCCACACATTGCGACGCTTCGAA 3118
Query 3458 AGTACACCTATGGCAAGCACATTCTGGCCAAGCTGGAGAAGTACTACATGAAGAACGGTGTTGACTTAGGGCCC 3531
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 3119 AGTACACCTATGGCAAGCACATCCTGGCCAAGCTCGAGAAGTACTACATGAAGAATGGCGTGGACTTGGGGCCC 3192
Query 3532 ATCTGTGGCCCCCCTAATGGTATCATC 3558
||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 3193 ATTTGTGGTCCCCCTAATGGTATCATC 3219