Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08821
- Subject:
- NM_001190481.2
- Aligned Length:
- 3825
- Identities:
- 3819
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGACAGGCGAGGTGGGTTCTGAGGTTCACCTAGAAATCAATGACCCAAACGTCATTTCACAAGAGGAAGCAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACAGGCGAGGTGGGTTCTGAGGTTCACCTAGAAATCAATGACCCAAACGTCATTTCACAAGAGGAAGCAGA 74
Query 75 TAGTCCTTCAGATAGTGGACAGGGCGGCTATGAAACAATTGGACCCTTGAGTGAAGGAGATTCAGATGAAGAGA 148
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAGTCCTTCAGATAGTGGACAGGGCAGCTATGAAACAATTGGACCCTTGAGTGAAGGAGATTCAGATGAAGAGA 148
Query 149 TATTTGTAAGTAAGAAGTTGAAAAACAGGAAGGTTCTACAAGACAGTGATTCCGAAACAGAGGACACAAATGCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TATTTGTAAGTAAGAAGTTGAAAAACAGGAAGGTTCTACAAGACAGTGATTCCGAAACAGAGGACACAAATGCC 222
Query 223 TCTCCAGAGAAAACTACCTATGACAGTGCCGAGGAGGAAAATAAAGAGAATTTATATGCTGGGAAAAATACAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCTCCAGAGAAAACTACCTATGACAGTGCCGAGGAGGAAAATAAAGAGAATTTATATGCTGGGAAAAATACAAA 296
Query 297 AATCAAAAGGATTTACAAAACTGTGGCAGACAGTGATGAAAGTTACATGGAAAAGTCTTTGTATCAGGAAAATC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AATCAAAAGGATTTACAAAACTGTGGCAGACAGTGATGAAAGTTACATGGAAAAGTCTTTGTATCAGGAAAATC 370
Query 371 TTGAAGCGCAAGTGAAACCTTGCTTAGAGCTGAGTCTTCAGTCTGGAAACTCTACAGACTTTACCACTGACAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTGAAGCGCAAGTGAAACCTTGCTTAGAGCTGAGTCTTCAGTCTGGAAACTCTACAGACTTTACCACTGACAGA 444
Query 445 AAGAGTTCCAAAAAGCACATACATGATAAAGAAGGAACTGCAGGAAAAGCAAAAGTAAAATCAAAAAGAAGACT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGAGTTCCAAAAAGCACATACATGATAAAGAAGGAACTGCAGGAAAAGCAAAAGTAAAATCAAAAAGAAGACT 518
Query 519 TGAGAAAGAGGAGAGAAAAATGGAAAAAATTAGACAGCTAAAAAAGAAGGAAACAAAAAACCAGGAAGATGATG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAGAAAGAGGAGAGAAAAATGGAAAAAATTAGACAGCTAAAAAAGAAGGAAACAAAAAACCAGGAAGATGATG 592
Query 593 TAGAACAGCCATTTAATGACAGTGGCTGTCTTCTTGTGGATAAAGACCTTTTTGAAACTGGGTTGGAGGATGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TAGAACAGCCATTTAATGACAGTGGCTGTCTTCTTGTGGATAAAGACCTTTTTGAAACTGGGTTGGAGGATGAA 666
Query 667 AATAACTCTCCATTGGAAGATGAAGAGTCATTAGAATCAATAAGAGCAGCTGTAAAAAACAAAGTAAAAAAGCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AATAACTCTCCATTGGAAGATGAAGAGTCATTAGAATCAATAAGAGCAGCTGTAAAAAACAAAGTAAAAAAGCA 740
Query 741 CAAGAAAAAAGAACCATCTTTGGAGAGTGGGGTCCATTCATTTGAGGAAGGAAGTGAGTTATCAAAAGGAACCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAAGAAAAAAGAACCATCTTTGGAGAGTGGGGTCCATTCATTTGAGGAAGGAAGTGAGTTATCAAAAGGAACCA 814
Query 815 CGAGGAAGGAAAGAAAGGCAGCCAGATTAAGTAAAGAAGCATTAAAACAACTGCATAGTGAGACTCAGCGCCTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGAGGAAGGAAAGAAAGGCAGCCAGATTAAGTAAAGAAGCATTAAAACAACTGCATAGTGAGACTCAGCGCCTT 888
Query 889 ATTCGAGAGTCTGCACTGAACCTTCCATATCATATGCCTGAGAATAAAACCATTCATGATTTCTTCAAACGTAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATTCGAGAGTCTGCACTGAACCTTCCATATCATATGCCTGAGAATAAAACCATTCATGATTTCTTCAAACGTAA 962
Query 963 ACCCCGGCCCACTTGCCACGGAAATGCCATGGCACTATTGAAGTCATCTAAATATCAGTCAAGCCATCACAAAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACCCCGGCCCACTTGCCACGGAAATGCCATGGCACTATTGAAGTCATCTAAATATCAGTCAAGCCATCACAAAG 1036
Query 1037 AAATCATAGACACTGCAAATACTACTGAAATGAACAGTGATCACCATAGTAAAGGTTCTGAGCAGACAACAGGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAATCATAGACACTGCAAATACTACTGAAATGAACAGTGATCACCATAGTAAAGGTTCTGAGCAGACAACAGGT 1110
Query 1111 GCAGAAAATGAAGTGGAAACTAATGCACTCCCTGTAGTTTCAAAGGAAACCCAGATCATTACTGGATCAGATGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCAGAAAATGAAGTGGAAACTAATGCACTCCCTGTAGTTTCAAAGGAAACCCAGATCATTACTGGATCAGATGA 1184
Query 1185 GTCTTGCAGGAAGGATTTGGTAAAAAATGAAGAGCTAGAAATTCAGGAGAAACAGAAGCAGAGTGACATTAGAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GTCTTGCAGGAAGGATTTGGTAAAAAATGAAGAGCTAGAAATTCAGGAGAAACAGAAGCAGAGTGACATTAGAC 1258
Query 1259 CTTCACCTGGGGACAGCTCAGTGTTGCAACAGGAATCCAACTTCCTCGGGAACAATCACAGTGAGGAATGTCAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTTCACCTGGGGACAGCTCAGTGTTGCAACAGGAATCCAACTTCCTCGGGAACAATCACAGTGAGGAATGTCAG 1332
Query 1333 GTTGAAGGGCTTGTAGCATTTGAACCTCATGCCCTGGAGGGTGAAGGCCCCCAAAATCCAGAAGAAACAGATGA 1406
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTTGGAGGGCTTGTAGCATTTGAACCTCATGCCCTGGAGGGTGAAGGCCCCCAAAATCCAGAAGAAACAGATGA 1406
Query 1407 GAAAGTGGAAGAGCCTGAGCAGCAAAATAAATCATCAGCAGTTGGGCCACCTGAAAAAGTGAGACGGTTTACTC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAAAGTGGAAGAGCCTGAGCAGCAAAATAAATCATCAGCAGTTGGGCCACCTGAAAAAGTGAGACGGTTTACTC 1480
Query 1481 TGGATAGACTTAAGCAACTGGGAGTAGATGTTTCCATTAAACCACGGCTAGGTGCTGATGAAGATTCCTTTGTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGGATAGACTTAAGCAACTGGGAGTAGATGTTTCCATTAAACCACGGCTAGGTGCTGATGAAGATTCCTTTGTG 1554
Query 1555 ATACTTGAACCTGAAACCAACAGAGGTGAAAAGCTTCAGGTGTTAAAAGCTAAACTGCAAGAAGCAATGAAACT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATACTTGAACCTGAAACCAACAGAGGTGAAAAGCTTCAGGTGTTAAAAGCTAAACTGCAAGAAGCAATGAAACT 1628
Query 1629 CCGAAGGTTTGAGGAGCGCCAGAAGCGCCAAGCACTGTTTAAATTAGATAATGAAGATGGGTTTGAGGAAGAGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCGAAGGTTTGAGGAGCGCCAGAAGCGCCAAGCACTGTTTAAATTAGATAATGAAGATGGGTTTGAGGAAGAGG 1702
Query 1703 AGGAGGAAGAGGAAGAAATGACAGATGAGTCTGAGGAAGATGGAGAAGAGAAGGTAGAGAAAGAAGAGAAAGAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGGAGGAAGAGGAAGAAATGACAGATGAGTCTGAGGAAGATGGAGAAGAGAAGGTAGAGAAAGAAGAGAAAGAG 1776
Query 1777 GAAGAACTAGAGGAAGAGGAGGAGAAAGAAGAGGAGGAGGAAGAAGAAGGAAATCAGGAGACTGCAGAATTCCT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAAGAACTAGAGGAAGAGGAGGAGAAAGAAGAGGAGGAGGAAGAAGAAGGAAATCAGGAGACTGCAGAATTCCT 1850
Query 1851 TCTTAGTAGTGAAGAAATAGAAACAAAAGATGAAAAAGAAATGGATAAAGAAAATAATGATGGCAGTAGTGAAA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TCTTAGTAGTGAAGAAATAGAAACAAAAGATGAAAAAGAAATGGATAAAGAAAATAATGATGGCAGTAGTGAAA 1924
Query 1925 TTGGCAAGGCAGTTGGCTTCCTCTCTGTTCCCAAGTCTCTCTCATCAGATTCTACTTTACTTCTGTTTAAGGAC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTGGCAAGGCAGTTGGCTTCCTCTCTGTTCCCAAGTCTCTCTCATCAGATTCTACTTTACTTCTGTTTAAGGAC 1998
Query 1999 AGCTCTTCCAAGATGGGTTACTTTCCTACTGAAGAAAAATCAGAAACAGATGAAAACTCAGGCAAGCAGCCTAG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AGCTCTTCCAAGATGGGTTACTTTCCTACTGAAGAAAAATCAGAAACAGATGAAAACTCAGGCAAGCAGCCTAG 2072
Query 2073 CAAACTGGATGAGGATGATTCATGTTCATTGCTAACAAAGGAGAGCAGCCACAATAGCAGCTTTGAGCTGATTG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CAAACTGGATGAGGATGATTCATGTTCATTGCTAACAAAGGAGAGCAGCCACAATAGCAGCTTTGAGCTGATTG 2146
Query 2147 GCTCCACGATTCCATCCTATCAGCCTTGCAACAGACAAACAGGCCGTGGGACCAGTTTTTTCCCTACAGCAGGA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GCTCCACGATTCCATCCTATCAGCCTTGCAACAGACAAACAGGCCGTGGGACCAGTTTTTTCCCTACAGCAGGA 2220
Query 2221 GGATTCAGATCTCCTTCCCCTGGGCTATTTCGAGCCAGTTTGGTCAGCTCAGCTTCTAAGAGTTCAGGGAAACT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GGATTCAGATCTCCTTCCCCTGGGCTATTTCGAGCCAGTTTGGTCAGCTCAGCTTCTAAGAGTTCAGGGAAACT 2294
Query 2295 GTCTGAGCCTTCACTTCCCATAGAGGATTCCCAGGATCTGTATAACGCCTCCCCAGAGCCTAAGACACTTTTCC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GTCTGAGCCTTCACTTCCCATAGAGGATTCCCAGGATCTGTATAACGCCTCCCCAGAGCCTAAGACACTTTTCC 2368
Query 2369 TAGGAGCAGGAGACTTCCAGTTCTGTTTAGAAGATGACACTCAGAGCCAACTGTTGGATGCAGATGGGTTCTTA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TAGGAGCAGGAGACTTCCAGTTCTGTTTAGAAGATGACACTCAGAGCCAACTGTTGGATGCAGATGGGTTCTTA 2442
Query 2443 AATGTTAGAAACCACAGGAATCAGTACCAAGCTTTGAAGCCTCGATTGCCATTGGCCAGTATGGATGAGAATGC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AATGTTAGAAACCACAGGAATCAGTACCAAGCTTTGAAGCCTCGATTGCCATTGGCCAGTATGGATGAGAATGC 2516
Query 2517 CATGGATGCCAACATGGATGAGCTGTTGGATTTGTGTACTGGAAAGTTCACATCTCAGGCTGAAAAACATCTAC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CATGGATGCCAACATGGATGAGCTGTTGGATTTGTGTACTGGAAAGTTCACATCTCAGGCTGAAAAACATCTAC 2590
Query 2591 CCAGGAAGGGTGACGAGAAAGAGAACATGGAGGAACTTCTGAACCTTTGTTCAGGAAAATTCACTTCTCAGGAT 2664
||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CCAGGAAGAGTGACAAGAAAGAGAACATGGAGGAACTTCTGAACCTTTGTTCAGGAAAATTCACTTCTCAGGAT 2664
Query 2665 GCCTCCACTCCAGCCTCATCAGAGTTAAATAAACAGGAGAAGGAGAGCAGCATGGGTGATCCAATGGAAGAAGC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GCCTCCACTCCAGCCTCATCAGAGTTAAATAAACAGGAGAAGGAGAGCAGCATGGGTGATCCAATGGAAGAAGC 2738
Query 2739 ACTTGCTCTTTGCTCAGGCTCTTTTCCCACAGACAAGGAAGAGGAAGACGAGGAGGAGGAATTTGGAGACTTTC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 ACTTGCTCTTTGCTCAGGCTCTTTTCCCACAGACAAGGAAGAGGAAGACGAGGAGGAGGAATTTGGAGACTTTC 2812
Query 2813 GGCTTGTTTCAAATGATAATGAGTTTGATAGTGATGAGGATGAACACAGTGACTCTGGTAATGATCTGGCACTG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GGCTTGTTTCAAATGATAATGAGTTTGATAGTGATGAGGATGAACACAGTGACTCTGGTAATGATCTGGCACTG 2886
Query 2887 GAAGACCATGAAGATGATGATGAAGAAGAACTCCTGAAGCGATCTGAGAAGTTGAAAAGGCAAATGAGGTTGAG 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GAAGACCATGAAGATGATGATGAAGAAGAACTCCTGAAGCGATCTGAGAAGTTGAAAAGGCAAATGAGGTTGAG 2960
Query 2961 GAAATACCTGGAGGATGAGGCAGAGGTGTCAGGAAGTGATGTGGGAAGCGAAGATGAGTATGATGGGGAAGAAA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GAAATACCTGGAGGATGAGGCAGAGGTGTCAGGAAGTGATGTGGGAAGCGAAGATGAGTATGATGGGGAAGAAA 3034
Query 3035 TTGATGAATATGAAGAGGACGTAATTGATGAAGTACTTCCTTCTGATGAGGAACTGCAGAGTCAAATCAAGAAA 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TTGATGAATATGAAGAGGACGTAATTGATGAAGTACTTCCTTCTGATGAGGAACTGCAGAGTCAAATCAAGAAA 3108
Query 3109 ATACACATGAAAACTATGTTGGATGATGATAAGCGACAGCTACGTTTATACCAAGAGAGGTACCTTGCTGATGG 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 ATACACATGAAAACTATGTTGGATGATGATAAGCGACAGCTACGTTTATACCAAGAGAGGTACCTTGCTGATGG 3182
Query 3183 GGATCTACACAGCGATGGTCCTGGGCGAATGAGGAAGTTTCGATGGAAAAACATAGATGATGCTTCCCAGATGG 3256
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 GGATCTGCACAGCGATGGTCCTGGGCGAATGAGGAAGTTTCGATGGAAAAACATAGATGATGCTTCCCAGATGG 3256
Query 3257 ACTTGTTCCACAGAGACTCTGATGATGATCAGACTGAAGAACAGCTTGATGAGTCAGAAGCCAGGTGGAGGAAG 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 ACTTGTTCCACAGAGACTCTGATGATGATCAGACTGAAGAACAGCTTGATGAGTCAGAAGCCAGGTGGAGGAAG 3330
Query 3331 GAGCGAATTGAACGAGAGCAGTGGCTTCGGGACATGGCACAGCAGGGGAAAATTACAGCTGAAGAAGAAGAAGA 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GAGCGAATTGAACGAGAGCAGTGGCTTCGGGACATGGCACAGCAGGGGAAAATTACAGCTGAAGAAGAAGAAGA 3404
Query 3405 AATTGGGGAGGACAGTCAGTTTATGATACTGGCCAAGAAAGTTACAGCCAAAGCACTGCAGAAGAATGCCAGTC 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 AATTGGGGAGGACAGTCAGTTTATGATACTGGCCAAGAAAGTTACAGCCAAAGCACTGCAGAAGAATGCCAGTC 3478
Query 3479 GCCCTATGGTTATTCAGGAATCAAAGTCTTTGCTCAGAAATCCTTTTGAAGCCATCAGACCAGGAAGTGCTCAA 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 GCCCTATGGTTATTCAGGAATCAAAGTCTTTGCTCAGAAATCCTTTTGAAGCCATCAGACCAGGAAGTGCTCAA 3552
Query 3553 CAGGTGAAGACAGGCTCACTGCTAAACCAGCCCAAAGCTGTGCTTCAGAAACTGGCTGCTCTCTCTGACCATAA 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 CAGGTGAAGACAGGCTCACTGCTAAACCAGCCCAAAGCTGTGCTTCAGAAACTGGCTGCTCTCTCTGACCATAA 3626
Query 3627 CCCCAGTGCTCCTCGAAATTCGAGAAACTTTGTCTTTCATACACTTTCTCCTGTCAAGGCTGAGGCGGCAAAGG 3700
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 CCCCAGTGCTCCTCGAAATTCAAGAAACTTTGTCTTTCATACACTTTCTCCTGTCAAGGCTGAGGCGGCAAAGG 3700
Query 3701 AATCGTCTAAGTCTCAGGTAAAGAAAAGGGGTCCATCTTTCATGACTTCTCCTTCACCTAAGCACCTCAAAACA 3774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 AATCGTCTAAGTCTCAGGTAAAGAAAAGGGGTCCATCTTTCATGACTTCTCCTTCACCTAAGCACCTCAAAACA 3774
Query 3775 GATGATAGCACTTCAGGATTGACGCGAAGCATCTTCAAATATTTGGAGAGC 3825
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 GATGATAGCACTTCAGGATTGACGCGAAGCATCTTCAAATATTTGGAGAGC 3825