Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10447
• Subject: NM_009424.3
• Aligned Length: 1591
• Identities: 1370
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGAGTCTGCTAAACTGTGAAAACAGCTGTGGATTCAGCCAGTCTGAAAGTGACTGCTGTGTGGCCATGGCCAG  74
            ||||||||..||||||||||.||||||||.||.|.|||||||||....|||||||||||.|..|||||||||..
Sbjct    1  ATGAGTCTCTTAAACTGTGAGAACAGCTGCGGGTCCAGCCAGTCGTCCAGTGACTGCTGCGCTGCCATGGCCGC  74

Query   75  CTCCTGTAGCGCTGTAACAAAAGATGATAGTGTGGGTGGAACTGCCAGCACGGGGAACCTCTCCAGCTCATTTA  148
            ||||||.|||||||.|...||||||||.||.|||.||||..||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct   75  CTCCTGCAGCGCTGCAGTGAAAGATGACAGCGTGAGTGGCTCTGCCAGCACCGGGAACCTCTCCAGCTCCTTCA  148

Query  149  TGGAGGAGATCCAGGGATATGATGTAGAGTTTGACCCACCCCTGGAAAGCAAGTATGAATGCCCCATCTGCTTG  222
            ||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  149  TGGAGGAGATCCAGGGCTACGATGTGGAGTTTGACCCACCTCTGGAGAGCAAGTATGAGTGTCCCATCTGCTTG  222

Query  223  ATGGCATTACGAGAAGCAGTGCAAACGCCATGCGGCCATAGGTTCTGCAAAGCCTGCATCATAAAATCAATAAG  296
            |||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  223  ATGGCTTTACGGGAAGCAGTGCAAACACCATGTGGCCACAGGTTCTGCAAAGCCTGCATCATCAAATCCATAAG  296

Query  297  GGATGCAGGTCACAAATGTCCAGTTGACAATGAAATACTGCTGGAAAATCAACTATTTCCAGACAATTTTGCAA  370
            |||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  297  GGATGCAGGGCACAAGTGCCCAGTTGACAATGAAATACTGCTGGAAAATCAACTGTTTCCCGACAATTTTGCAA  370

Query  371  AACGTGAGATTCTTTCTCTGATGGTGAAATGTCCAAATGAAGGTTGTTTGCACAAGATGGAACTGAGACATCTT  444
            |.||.|||||||||||.||||.|||.||.||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  AGCGAGAGATTCTTTCCCTGACGGTAAAGTGCCCAAATAAAGGCTGTTTGCAAAAGATGGAACTGAGACATCTC  444

Query  445  GAGGATCATCAAGCACATTGTGAGTTTGCTCTTATGGATTGTCCCCAATGCCAGCGTCCCTTCCAAAAATTCCA  518
            |||||||||||||.|||||||||.||||||||..||.||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|.|||
Sbjct  445  GAGGATCATCAAGTACATTGTGAATTTGCTCTAGTGAATTGTCCCCAGTGCCAACGTCCTTTCCAGAAGTGCCA  518

Query  519  TATTAATATTCACATTCTGAAGGATTGTCCAAGGAGACAGGTTTCTTGTGACAACTGTGCTGCATCAATGGCAT  592
            ..||||||..||||||.|..||||||||||.|||||.|||||||||||||..||||||||||..||.|||||||
Sbjct  519  GGTTAATACACACATTATTGAGGATTGTCCCAGGAGGCAGGTTTCTTGTGTAAACTGTGCTGTGTCCATGGCAT  592

Query  593  TTGAAGATAAAGAGATCCATGACCAGAACTGTCCTTTGGCAAATGTCATCTGTGAATACTGCAATACTATACTC  666
            .||||||.||||||||||||||.||.|.|||||||.||||||||.||||||||||||||||...|||.||.|||
Sbjct  593  ATGAAGAGAAAGAGATCCATGATCAAAGCTGTCCTCTGGCAAATATCATCTGTGAATACTGTGGTACAATCCTC  666

Query  667  ATCAGAGAACAGATGCCTAATCATTATGATCTAGACTGCCCTACAGCCCCAATTCCATGCACATTCAGTACTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||..|||
Sbjct  667  ATCAGAGAACAGATGCCTAATCATTATGATCTGGACTGCCCAACAGCTCCAATCCCTTGCACATTCAGTGTTTT  740

Query  741  TGGTTGCCATGAAAAGATGCAGAGGAATCACTTGGCACGCCACCTACAAGAGAACACCCAGTCACACATGAGAA  814
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||.|||||||..|||||||||.
Sbjct  741  TGGCTGTCATGAAAAGATGCAGAGGAATCACTTGGCACGACACTTGCAAGAGAATACCCAGTTGCACATGAGAC  814

Query  815  TGTTGGCCCAGGCTGTTCATAGTTTGAGCGTT----------------ATACCCGACTCT-------GGGTATA  865
            |||||||||||||||||||||.|.|.|.|.||                || .|||.||||       |||.||.
Sbjct  815  TGTTGGCCCAGGCTGTTCATAATGTTAACCTTGCTTTGCGTCCGTGCGAT-GCCGCCTCTCCATCCCGGGGATG  887

Query  866  TC--TCAGAGGTCCGGAATTTCCAGGAAACTATTCACCAGTTAGAGGGTCGCCTTGTAAGACAAGACCATCAAA  937
            ||  .||||||.||..||||...||||||||||..|.|||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  888  TCGTCCAGAGGACCCAAATTATGAGGAAACTATCAAACAGTTGGAGAGTCGCCTAGTAAGACAGGACCATCAGA  961

Query  938  TCCGGGAGCTGACTGCTAAAATGGAAACTCAGAGTATGTATGTAAGTGAGCTCAAACGAACCATTCGAACCCTT  1011
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||..|.|||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  962  TCCGGGAGCTGACTGCCAAAATGGAAACTCAGAGTATGTACGTGGGCGAGCTCAAACGGACCATTCGGACCCTG  1035

Query 1012  GAGGACAAAGTTGCTGAAATCGAAGCACAGCAGTGCAATGGAATTTATATTTGGAAGATTGGCAACTTTGGAAT  1085
            ||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1036  GAGGACAAGGTTGCCGAAATGGAAGCACAGCAGTGTAACGGGATCTACATTTGGAAGATTGGCAACTTTGGGAT  1109

Query 1086  GCATTTGAAATGTCAAGAAGAGGAGAAACCTGTTGTGATTCATAGCCCTGGATTCTACACTGGCAAACCCGGGT  1159
            |||.|||||||..|||||||||||.|.|||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||.|||.||||
Sbjct 1110  GCACTTGAAATCCCAAGAAGAGGAAAGACCTGTTGTCATCCATAGCCCTGGATTCTACACAGGCAGACCTGGGT  1183

Query 1160  ACAAACTGTGCATGCGCTTGCACCTTCAGTTACCGACTGCTCAGCGCTGTGCAAACTATATATCCCTTTTTGTC  1233
            ||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  ACAAGCTGTGCATGCGCCTGCATCTTCAGTTACCGACAGCTCAGCGCTGTGCAAACTATATATCCCTTTTTGTC  1257

Query 1234  CACACAATGCAAGGAGAATATGACAGCCACCTCCCTTGGCCCTTCCAGGGTACAATACGCCTTACAATTCTTGA  1307
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1258  CACACAATGCAAGGAGAATATGACAGCCACCTCCCCTGGCCCTTCCAGGGTACAATACGCCTTACAATTCTCGA  1331

Query 1308  TCAGTCTGAAGCACCTGTAAGGCAAAACCACGAAGAGATAATGGATGCCAAACCAGAGCTGCTTGCTTTCCAGC  1381
            .|||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1332  CCAGTCTGAAGCACTTATAAGGCAAAACCACGAAGAGGTCATGGACGCCAAACCAGAACTGCTTGCCTTTCAGC  1405

Query 1382  GACCCACAATCCCACGGAACCCAAAAGGTTTTGGCTATGTAACTTTTATGCATCTGGAAGCCCTAAGACAAAGA  1455
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||..||
Sbjct 1406  GACCCACAATCCCACGGAACCCCAAAGGTTTTGGCTATGTAACATTTATGCACCTGGAAGCCTTAAGACAGGGA  1479

Query 1456  ACTTTCATTAAGGATGACACATTATTAGTGCGCTGTGAGGTCTCCACCCGCTTTGACATGGGTAGCCTTCGGAG  1529
            ||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 1480  ACCTTCATTAAGGATGATACATTACTAGTGCGCTGTGAAGTCTCTACCCGCTTTGACATGGGTGGCCTTCGGAA  1553

Query 1530  GGAGGGTTTTCAGCCACGAAGTACTGATGCAGGGTA-  1565
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||.. 
Sbjct 1554  GGAGGGTTTCCAGCCACGAAGTACTGATGCGGGGGTG  1590