Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12974
• Subject: XM_011545353.3
• Aligned Length: 1533
• Identities: 1514
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGCACCTTAAGAAGCGGGTTTATGAGGAATTCACGAAAGTGGTTCAGCCACAGGAGGAAATTGCTAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGCACCTTAAGAAGCGGGTTTATGAGGAATTCACGAAAGTGGTTCAGCCACAGGAGGAAATTGCTAC  74

Query   75  TAAGAAACTCCGACTAACAAAACCAAGTAAATCTGCAGCACTCCACATAGATCTGTGTAAAGCTACCTCCCCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAAGAAACTCCGACTAACAAAACCAAGTAAATCTGCAGCACTCCACATAGATCTGTGTAAAGCTACCTCCCCAG  148

Query  149  CAGATGCTTTGCAATACTTGCTCCAGTTTGCCAGGAAGCCTGTCGAGGCGGAAAGCGTAGAGGGAGTAGTCAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGATGCTTTGCAATACTTGCTCCAGTTTGCCAGGAAGCCTGTCGAGGCGGAAAGCGTAGAGGGAGTAGTCAGG  222

Query  223  ATTCTCTTGGAACATTATTACAAGGAGAATGATCCATCTGTGAGACTGAAAATTGCATCATTGTTGGGTTTATT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTCTCTTGGAACATTATTACAAGGAGAATGATCCATCTGTGAGACTGAAAATTGCATCATTGTTGGGTTTATT  296

Query  297  ATCAAAGACAGCAGGATTTTCACCAGACTGCATTATGGATGATGCCATCAACATCCTGCAGAATGAAAAGTCTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCAAAGACAGCAGGATTTTCACCAGACTGCATTATGGATGATGCCATCAACATCCTGCAGAATGAAAAGTCTC  370

Query  371  ATCAAGTCCTAGCTCAACTGCTGGATACTTTGCTTGCAATTGGCACTAAGCTACCAGAGAATCAAGCTATCCAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCAAGTCCTAGCTCAACTGCTGGATACTTTGCTTGCAATTGGCACTAAGCTACCAGAGAATCAAGCTATCCAA  444

Query  445  ATGCGATTAGTTGATGTGGCCTGCAAGCATCTGACAGATACGTCTCATGGTGTAAGAAATAAGTGCCTGCAGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGCGATTAGTTGATGTGGCCTGCAAGCATCTGACAGATACGTCTCATGGTGTAAGAAATAAGTGCCTGCAGTT  518

Query  519  ACTTGGCAATCTTGGCTCTTTGGAGAAAAGTGTCACAAAAGATGCAGAAGGCCTAGCTGCCAGAGATGTCCAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTTGGCAATCTTGGCTCTTTGGAGAAAAGTGTCACAAAAGATGCAGAAGGCCTAGCTGCCAGAGATGTCCAGA  592

Query  593  AGATTATAGGGGATTACTTCAGTGACCAAGACCCACGTGTCAGAACAGCAGCTATAAAAGCCATGTTGCAGCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGATTATAGGGGATTACTTCAGTGACCAAGACCCACGTGTCAGAACAGCAGCTATAAAAGCCATGTTGCAGCTC  666

Query  667  CATGAAAGAGGACTGAAATTACACCAAACAATTTATAATCAGGCCTGTAAATTACTCTCTGATGACTATGAACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATGAAAGAGGACTGAAATTACACCAAACAATTTATAATCAGGCCTGTAAATTACTCTCTGATGACTATGAACA  740

Query  741  AGTGCGCAGTGCTGCAGTCCAGCTTATCTGGGTCGTCAGTCAGCTCTATCCTGAAAGCATTGTCCCAATTCCTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTGCGCAGTGCTGCAGTCCAGCTTATCTGGGTCGTCAGTCAGCTCTATCCTGAAAGCATTGTCCCAATTCCTT  814

Query  815  CTTCTAATGAAGAAATACGCTTAGTTGATGATGCGTTTGGCAAAATTTGTCACATGGTCAGTGATGGCTCTTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTCTAATGAAGAAATACGCTTAGTTGATGATGCGTTTGGCAAAATTTGTCACATGGTCAGTGATGGCTCTTGG  888

Query  889  GTGGTTCGTGTTCAGGCAGCAAAACTGTTGGGCTCTATGGAGCAAGTCAGTTCTCATTTCTTGGAGCAGACCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGGTTCGTGTTCAGGCAGCAAAACTGTTGGGCTCTATGGAGCAAGTCAGTTCTCATTTCTTGGAGCAGACCCT  962

Query  963  TGACAAGAAGCTGATGTCAGATCTGAGGAGGAAACGTACTGCACATGAGCGTGCCAAGGAACTTTACAGTTCGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACAAGAAGCTGATGTCAGATCTGAGGAGGAAACGTACTGCACATGAGCGTGCCAAGGAACTTTACAGTTCGG  1036

Query 1037  GGGAGTTTTCCAGTGGCAGAAAGTGGGGAGATGATGCTCCCAAGGAAGAAGTAGATACCGGGGCTGTGAACTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGAGTTTTCCAGTGGCAGAAAGTGGGGAGATGATGCTCCCAAGGAAGAAGTAGATACCGGGGCTGTGAACTTG  1110

Query 1111  ATTGAGTCAGGAGCTTGTGGAGCTTTTGTTCATGGGTTGGAAGATGAGATGTATGAGGTTCGTATTGCTGCTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATTGAGTCAGGAGCTTGTGGAGCTTTTGTTCATGGGTTGGAAGATGAGATGTATGAGGTTCGTATTGCTGCTGT  1184

Query 1185  GGAGGCCCTCTGCATGTTGGCCCAGTCTTCACCCTCTTTTGCTGAGAAGTGCCTTGATTTCCTAGTTGACATGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGGCCCTCTGCATGTTGGCCCAGTCTTCACCCTCTTTTGCTGAGAAGTGCCTTGATTTCCTAGTTGACATGT  1258

Query 1259  TCAACGATGAAATTGAGGAAGTACGTCTGCAGTCTATACATACCATGAGAAAAATCTCTAACAACATCACCCTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAACGATGAAATTGAGGAAGTACGTCTGCAGTCTATACATACCATGAGAAAAATCTCTAACAACATCACCCTC  1332

Query 1333  CGAGAAGATCAGCTTGACACTGTCCTGGCTGTGCTAGAGGATTCATCCAGAGATATTCGAGAGGCTCTTCATGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGAGAAGATCAGCTTGACACTGTCCTGGCTGTGCTAGAGGATTCATCCAGAGATATTCGAGAGGCTCTTCATGA  1406

Query 1407  ACTCTTATGCTGTACTAATGTTTCAACCAAAGAAGGGATTCATCTTGCATTGGTGGAGCTGCTGAAAAATTTAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACTCTTATGCTGTACTAATGTTTCAACCAAAGAAGGGATTCATCTTGCATTGGTGGAGCTGCTGAAAAATTTAA  1480

Query 1481  CCAAGTACCCTACTGATAGGGACTCCATATGGAAG------------------  1515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.                  
Sbjct 1481  CCAAGTACCCTACTGATAGGGACTCCATATGGAAATTGAGGATAGTACGGCCC  1533