Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12975
- Subject:
- NR_027392.2
- Aligned Length:
- 1965
- Identities:
- 1276
- Gaps:
- 632
Alignment
Query 1 ATGCCATCAACATCCTGCAGAATGAAACATCTGACAGATACGTCTCATGGTGTAAGA--AATAAGTGCCTGCAG 72
||| ||..||.||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------AGAAGAAGGAGGGC------ 14
Query 73 TTACTTGGCAATCTTGGCTCTTTGGAGAAAAGTGTCACAAAAGATGCAGAAGGCCTAGCTGCCAGAGATGTCCA 146
|| |||| ||.| || ||||||| .|||| ||||
Sbjct 15 ------GG------TGGC-----GGGG----GT---------GATGCAG-CGGCC--GCTG------------- 42
Query 147 GAAGATTATAGGGGATTACTT----CAGTGACCAAGACC--CACGTGTCAG-AACAG------CAGCTATAAAA 207
|||| | |||.|.||..|.|| |.||.|.|.| |.||| |||||..|.||
Sbjct 43 ---------AGGG-------TGGCGCAGGGGCCCCGGCCAGCCCGGGGCTGCAGCAGTGCGGACAGCTCCAGAA 100
Query 208 GC-CAT-GTTGCAGCTCCATGAAAGAGGACTGAAATTACACCAAACAATTTATAATCAGGCCTGTAAATTACTC 279
|| ||| | |||.|||||| ||..| ||||| |.|
Sbjct 101 GCTCATCG--GCATCTCCAT----------TGGCA------------------------GCCTG-------CGC 131
Query 280 --TCTGATGACTATGAACAAGTGCGCAGTGCTGCAGTCCAGCTTATCTGGGTCGTCAGTCAGC--------TCT 343
.|||...|| |||||||||.|| |||||.| |.|.|||...||| ...
Sbjct 132 GGGCTGGGCAC------CAAGTGCGCTGT------GTCCAAC--------GACCTCACCGAGCAGGAGATACGG 185
Query 344 ATCCTGAAAGCATTGTCCCAATTCCTTCTTCTAATGAAGAAATACGCTTAGTTGATGATGCGTTTGGCAAAATT 417
|.|||| .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 186 ACCCTG-GAGCATTGTCCCAATTCCTTCTTCTAATGAAGAAATACGCTTAGTTGATGATGCGTTTGGAAAAATT 258
Query 418 TGTCACATGGTCAGTGATGGCTCTTGGGTGGTTCGTGTTCAGGCAGCAAAACTGTTGGGCTCTATGGAGCAAGT 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259 TGTCACATGGTCAGTGATGGCTCTTGGGTGGTTCATGTTCAGGCAGCAAAACTGTTGGGCTCTATGGAGCAAGT 332
Query 492 CAGTTCTCATTTCTTGGAGCAGACCCTTGACAAGAAGCTGATGTCAGATCTGAGGAGGAAACGTACTGCACATG 565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333 CAGTTCTCATTTCTTGGAGCAGACCCTTGACAAGAAGCTGATGTCAGATCTGAGGAGGAAACGTACTGCACATG 406
Query 566 AGCGTGCCAAGGAACTTTACAGTTCGGGGGAGTTTTCCAGTGGCAGAAAGTGGGGAGATGATGCTCCCAAGGAA 639
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 407 AGCGTGCCAAGGAACTTTACAGTTCAGGGGAGTTTTCCAGTGGCAGAAAGTGGGAAGATGATGCTCCCAAGGAA 480
Query 640 GAAGTAGATACCGGGGCTGTGAACTTGATTGAGTCAGGAGCTTGTGGAGCTTTTGTTCATGGGTTGGAAGATGA 713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GAAGTAGATACCGGGGCTGTGAACTTGATTGAGTCAGGAGCTTGTGGAGCTTTTGTTCATGGGTTGGAAGATGA 554
Query 714 GATGTATGAGGTTCGTATTGCTGCTGTGGAGGCCCTCTGCATGTTGGCCCAGTCTTCACCCTCTTTTGCTGAGA 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 GATGTATGAGGTTCGTATTGCTGCTGTGGAGGCCCTCTGCATGTTGGCCCAGTCTTCACCCTCTTTTGCTGAGA 628
Query 788 AGTGCCTTGATTTCCTAGTTGACATGTTCAACGATGAAATTGAGGAAGTACGTCTGCAGTCTATACATACCATG 861
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 629 AGTGCCTTGATTTCCTAGTTGACATGTTCAACGATGAAATTGAGGAAGTACGTCTGCAGTCCATACATACCATG 702
Query 862 AGAAAAATCTCTAACAACATCACCCTCCGAGAAGATCAGCTTGACACTGTCCTGGCTGTGCTAGAGGATTCATC 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 703 AGAAAAATCTCTAACAACATCACCCTCCGAGAAGATCAGCTTGACACTGTCCTGGCTGTGCTAGAGGATTCAGC 776
Query 936 CAGAGATATTCGAGAGGCTCTTCATGAACTCTTATGCTGTACTAATGTTTCAACCAAAGAAGGGATTCATCTTG 1009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 CAGAGATATTCGAGAGGCTCTTCATGAACTCTTATGCTGTACTAATGTTTCAACCAAAGAAGGGATTCATCTTG 850
Query 1010 CATTGGTGGAGCTGCTGAAAAATTTAACCAAGTACCCTACTGATAGGGACTCCATATGGAAGTGCTTGAAGTTT 1083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 851 CATTGGTGGAGCTGCTGAAAAATTTAACCAAGTACCCTACTGATAGGGACTCCATATGGAAGTGCTTGAAGTTT 924
Query 1084 CTGGGAAGTCGGCATCCAACCCTGGTGCTTCCCTTGGTGCCAGAGCTTCTGAGCACCCACCCATTTTTTGACAC 1157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 925 CTGGGAAGTCGGCATCCAACCCTGGTGCTTCCCTTGGTGCCAGAGCTTCTGAGCACCCACCCATTTTTTGACAC 998
Query 1158 AGCTGAACCAGACATGGATGATCCAGCTTATATTGCAGTTTTGGTACTTATTTTCAATGCTGCTAAAACCTGTC 1231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 999 AGCTGAACCAGACATGGATGATCCAGCTTATATTGCAGTTTTGGTACTTATTTTCAATGCTGCTAAAACCTGTC 1072
Query 1232 CAACAATGCCAGCATTGTTCTCAGATCACACCTTCAGGCACTATGCCTACCTCCGAGACAGTCTTTCTCATCTT 1305
|||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 CAACAATGCGAGCATTGTTCTCAGATCACACCGTCAGGCACTATGCCTACCTCCGAGACAGTCTTTCTCATCTT 1146
Query 1306 GTTCCTGCCTTGAGGTTACCAGGTAGAAAACTGGTGTCATCAGCTGTTTCTCCCAGCATCATACCTCAAGAGGA 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147 GTTCCTGCCTTGAGGTTACCAGGTAGAAAACTGGTGTCATCAGCTGTTTCTCCCAGCATCATACCTCAAGAGGA 1220
Query 1380 TCCTTCCCAGCAGTTCCTGCAGCAGAGCCTTGAAAGAGTGTATAGTCTTCAGCACTTGGACCCTCAGGGAGCCC 1453
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1221 TCCTTCGCAGCAGTTCCTGCAGCAGAGCCTTGAAAGAGTGTATAGTCTTCAGCACTTGGACCCTCAGGGAGCCC 1294
Query 1454 AGGAGCTGCTGGAATTCACCATCAG-------------AGTCGAGGTTTCACCATG--GTGGCC---------- 1502
||||||||||||||||||||||||| |||||.|| .||| |..|||
Sbjct 1295 AGGAGCTGCTGGAATTCACCATCAGGCCTTGCAGGAAAAGTCGTGG------AATGTAGCTGCCCCTTCGTATT 1362
Query 1503 --AGGC---------TGGTCTCA--AACTCCTGAGCTCAAG--------------------------------- 1530
|.|| |||.|||| |.| |||..||.
Sbjct 1363 TGAAGCAGAGTGATTTGGCCTCAGCAGC-----AGCAAAACAGACTTTACCCCTTATTTGGGATGTGTGAAAAA 1431
Query 1531 -------------------------------------------------------------------------- 1530
Sbjct 1432 TTTTTACAGGAAGTAGACTTTTTTCAGAGGTATTTCATCGCTGATTTGCCCCACTTGCAGGACAGCTTTGTGGA 1505
Query 1531 -------------------------------------------------------------------------- 1530
Sbjct 1506 CAAACTCCTTGACCTTATGCCCCGACTCATGACATCCAAACCTGCAGAAGTGGTCAAAATTCTACAGACCATGC 1579
Query 1531 -------------------------------------------------------------------------- 1530
Sbjct 1580 TGCGACAGAGTGCCTTTCTGCATCTCCCACTTCCAGAGCAGATCCACAAAGCCTCAGCCACCATCATTGAGCCA 1653
Query 1531 -------------------------------------------------------------------------- 1530
Sbjct 1654 GCGGGCGAGTCAGACAACCCTTTGCAGTTTAACTCTGGGTTGGTGGTTGCCCTGGATGTTGATGCAACCCTGGA 1727
Query 1531 ----------------------------------------- 1530
Sbjct 1728 GCATGTGCAGGATCCTCAGAACACTGTTAAGGTCCAGGTCT 1768
