Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14905
• Subject: XM_006711007.1
• Aligned Length: 1402
• Identities: 1102
• Gaps: 295

Alignment

Query    1  ATGGTATCTTCTCAAAAGTTGGAAAAACCTATAGAGATGGGCAGTAGCGAACCCCTTCCCATCGCAGATGGTGA  74
                                                                               |||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------------ATGGTGA  7

Query   75  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAGATATGTACAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct    8  CAGGAGGAGGAAGAAGAAGCGGAGGGGCCGGGCCACTGACTCCTTGCCAGGAAAGTTTGAAG------------  69

Query  149  TGACCTCTGAATTGCTTGGAGAGGGAGCCTATGCCAAAGTTCAAGGTGCCGTGAGCCTACAGAATGGCAAAGAG  222
                                                                                      
Sbjct   70  --------------------------------------------------------------------------  69

Query  223  TATGCCGTCAAAATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  296
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  ------------ATCATCGAGAAACAAGCAGGGCACAGTCGGAGTAGGGTGTTTCGAGAGGTGGAGACGCTGTA  131

Query  297  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  132  TCAGTGTCAGGGAAACAAGAACATTTTGGAGCTGATTGAGTTCTTTGAAGATGACACAAGGTTTTACTTGGTCT  205

Query  371  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  206  TTGAGAAATTGCAAGGAGGTTCCATCTTAGCCCACATCCAGAAGCAAAAGCACTTCAATGAGCGAGAAGCCAGC  279

Query  445  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGACAAAGTCTCTCTCTGTCACCTAGG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||                      
Sbjct  280  CGAGTGGTGCGGGACGTTGCTGCTGCCCTTGACTTCCTGCATACCAAAGGCA----------------------  331

Query  519  CTGGAGTGCTATGGCGCCATCAGGGCTCACTGCAGCCCCAACCTCCCTGGGCTCCAGTGATCCTCCCACCTCAG  592
                                                                                      
Sbjct  332  --------------------------------------------------------------------------  331

Query  593  CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACANGCATTTGCTCATNGTGATNTGAAACCAAGNAAAATATATTGTGTGAATCT  666
                                        ||||||||.|||||.||||||||  .||||||||||||||||||||
Sbjct  332  ----------------------------TTGCTCATCGTGATCTGAAACCA--GAAAATATATTGTGTGAATCT  375

Query  667  CCAGGAAAAGGTGTCTCCAGTGAAAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGATGAAACTGAACAACTCCTTG  740
            ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  376  CCA-GAAAAGGTGTCTCCAGTG-AAAATCTGTGACTTTGACTTGGGCAGTGGGATGAAACTGAACAACTCC-TG  446

Query  741  TACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATGGCCCCTGAAGGTAGTNGAG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||.|||
Sbjct  447  TACCCCCATAACCACACCAGAGCTGACCACCCCATGTGGCTCTGCAGAATACATGGCCCCTG-AGGTAGTGGAG  519

Query  815  GTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGGCGTGGTCCTCTACATCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  520  GTCTTCACGGACCAGGCCACATTCTACGACAAGCGCTGTGACCTGTGGAGCCTGGGCGTGGTCCTCTACATCAT  593

Query  889  GCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACCGGGGCGAGGTCTGCAGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594  GCTGAGTGGCTACCCACCCTTCGTGGGTCACTGCGGGGCCGACTGTGGCTGGGACCGGGGCGAGGTCTGCAGGG  667

Query  963  TGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGACAAGGACTGGGCACACATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  TGTGCCAGAACAAGCTGTTTGAAAGCATCCAGGAAGGCAAGTATGAGTTTCCTGACAAGGACTGGGCACACATC  741

Query 1037  TCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAGACTTAGCGCCGCCCAAGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  742  TCCAGTGAAGCCAAAGACCTCATCTCCAAGCTCCTGGTGCGAGATGCAAAGCAGAGACTTAGCGCCGCCCAAGT  815

Query 1111  TCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGGGCAAGCTCCAGAAAAGGGACTCCCCACGCCGCAAGTCCTCCAGAGGAACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  816  TCTGCAGCACCCATGGGTGCAGGGGCAAGCTCCAGAAAAGGGACTCCCCACGCCGCAAGTCCTCCAGAGGAACA  889

Query 1185  GCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAGCTATCTCAGCACGAAGAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  890  GCAGCACAATGGACCTGACGCTCTTCGCAGCTGAGGCCATCGCCCTTAACCGCCAGCTATCTCAGCACGAAGAG  963

Query 1259  AACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCTTTCCCCTCCCTGCAAGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  964  AACGAACTAGCAGAGGAGCCAGAGGCACTAGCTGATGGCCTCTGCTCCATGAAGCTTTCCCCTCCCTGCAAGTC  1037

Query 1333  ACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGGTGAAGACAGGAGCCCGCCCACAGCACTC  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1038  ACGCCTGGCCCGGAGACGGGCCCTGGCCCAGGCAGGCCGTGGTGAAGACAGGAGCCCGCCCACAGCACTC  1107