Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15079
• Subject: NM_001329605.2
• Aligned Length: 1443
• Identities: 896
• Gaps: 540

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGACCATCCTAGTAGGGAAAAGGATGAAAGACAACGGACAACTAAACCCATGGCACAAAGGAGTGCACACTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTCTCGACCATCTGGCTCCTCATCGTCCTCTGGGGTTCTTATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TAGGATGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCAATCAAACTG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAGCTTCATTTAGAGTACAGATTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA  296

Query    1  -------------------------------------------------ATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA  25
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGTCTCCCACAGGTGTATTACTTTGGACCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA  370

Query   26  GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGCTG  99
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGCTG  444

Query  100  CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG  173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG  518

Query  174  TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG  247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG  592

Query  248  AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG  321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG  666

Query  322  CATCTTGGCAAAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAAGCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGG  395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATCTTGGCAAAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAAGCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGG  740

Query  396  CAGCCTCCCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA  469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCCTCCCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA  814

Query  470  ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG  543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG  888

Query  544  GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC  617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC  962

Query  618  CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCACGTAGATTCTGGTG  691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCACGTAGATTCTGGTG  1036

Query  692  CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACATAGGGATCGGCCATCACAACAGCAGCCTCTTCGAAAT------  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1037  CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACATAGGGATCGGCCATCACAACAGCAGCCTCTTCGAAATCAGAAT  1110

Query  760  --------------------------------------------------------------------------  759
                                                                                      
Sbjct 1111  GTATCATCAGAGCGCCGAGGAGAGTGGGAAATTCAGCCCAGCCGGCAGACCAATACCTCATACCTAACGTCTCA  1184

Query  760  -------------------------------CAGGTGGTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTTGATGATC  802
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTGGCTGCAGACCGCCATGGGGGATCAGTGCAGGTGGTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTTGATGATC  1258

Query  803  CCACGGGAGCCCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCATGCCGAGGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAAGTG-CTG  875
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|| .|.
Sbjct 1259  CCACGGGAGCCCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCATGCCGAGGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAAATGTATA  1332

Query  876  CTGTTTCTTTAAGAGGAAAA----GGAAGAAGACTGCTCAGCGCCACAAG------------------------  921
            .||||||.|        |||    ||     .||||.|||    || |||                        
Sbjct 1333  ATGTTTCAT--------AAACCCTGG-----CACTGGTCA----CA-AAGCTCAGCTGTGAAAATGAAATTTGT  1388

Query  922  -------------------------------------  921
                                                 
Sbjct 1389  AGTATTTTTAAACATGAATGTCAATTTCAAGTGTATT  1425