Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15496
• Subject: XM_005247463.5
• Aligned Length: 1294
• Identities: 938
• Gaps: 356

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCTGTTAGTGTCACACCAATTCGGGACACAAAATGGCTAACACTGGAAGTATGTAGAGAGTTCCAGAGGGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GACTTGCTCACGGCCAGACACGGAATGTAAATTTGCACATCCTTCGAAAAGCTGCCAAGTTGAAAATGGACGAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TAATCGCCTGCTTTGATTCATTGAAAGCCAGAGCCACGCATTTTATGGAAAATGTAACTAGAAGTAAGGTGCTG  222

Query    1  -------------------------------------------ATGGGCCGTTGCTCCAGGGAGAACTGCAAAT  31
                                                       || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACTGCTGCTACAGCACCTTACCTGAGGCACAAACTTTGTTGCAT-GGCCGTTGCTCCAGGGAGAACTGCAAAT  295

Query   32  ATCTTCATCCACCCCCACATTTAAAAACGCAGTTGGAGATAAATGGACGCAATAACTTGATTCAGCAGAAGAAC  105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  ATCTTCATCCACCCCCACATTTAAAAACGCAGTTGGAGATAAATGGACGCAATAACTTGATTCAGCAGAAGAAC  369

Query  106  ATGGCCATGTTGGCCCAGCAAATGCAACTAGCCAATGCCATGATGCCTGGTGCCCCATTACAACCCGTGCCAAT  179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  ATGGCCATGTTGGCCCAGCAAATGCAACTAGCCAATGCCATGATGCCTGGTGCCCCATTACAACCCGTGCCAAT  443

Query  180  GTTTTCAGTTGCACCAAGCTTAGCCACCAATGCATCAGCAGCCGCCTTTAATCCCTATCTGGGACCTGTTTCTC  253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GTTTTCAGTTGCACCAAGCTTAGCCACCAATGCATCAGCAGCCGCCTTTAATCCCTATCTGGGACCTGTTTCTC  517

Query  254  CAAGCCTGGTCCCGGCAGAGATCTTGCCGACTGCACCAATGTTGGTTACAGGGAATCCGGGTGTCCCTGTACCT  327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  CAAGCCTGGTCCCGGCAGAGATCTTGCCGACTGCACCAATGTTGGTTACAGGGAATCCGGGTGTCCCTGTACCT  591

Query  328  GCAGCTGCTGCAGCTGCTGCACAGAAATTAATGCGAACAGACAGACTTGAGGTATGTCGAGAGTACCAACGTGG  401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GCAGCTGCTGCAGCTGCTGCACAGAAATTAATGCGAACAGACAGACTTGAGGTATGTCGAGAGTACCAACGTGG  665

Query  402  CAATTGCAACCGAGGAGAAAATGATTGTCGGTTTGCTCATCCTGCTGACAGCACAATGATTGACACCAATGACA  475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  CAATTGCAACCGAGGAGAAAATGATTGTCGGTTTGCTCATCCTGCTGACAGCACAATGATTGACACCAATGACA  739

Query  476  ACACAGTCACTGTGTGTATGGATTACATCAAAGGGAGATGCTCTCGGGAAAAGTGCAAATACTTTCATCCCCCT  549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  ACACAGTCACTGTGTGTATGGATTACATCAAAGGGAGATGCTCTCGGGAAAAGTGCAAATACTTTCATCCCCCT  813

Query  550  GCACATTTGCAAGCCAAGATCAAGGCTGCCCAATACCAGGTCAACCAGGCTGCAGCTGCACAGGCTGCAGCCAC  623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GCACATTTGCAAGCCAAGATCAAGGCTGCCCAATACCAGGTCAACCAGGCTGCAGCTGCACAGGCTGCAGCCAC  887

Query  624  CGCAGCTGCCATGACTCAGTCGGCTGTCAAATCACTGAAGCGACCCCTCGAGGCAACCTTTGACCTGGGAATTC  697
            |||||||||||                                                      |||||||||
Sbjct  888  CGCAGCTGCCA------------------------------------------------------TGGGAATTC  907

Query  698  CTCAAGCTGTACTTCCCCCATTACCAAAGAGGCCTGCTCTTGAAAAAACCAACGGTGCCACCGCAGTCTTTAAC  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  908  CTCAAGCTGTACTTCCCCCATTACCAAAGAGGCCTGCTCTTGAAAAAACCAACGGTGCCACCGCAGTCTTTAAC  981

Query  772  ACTGGTATTTTCCAATACCAACAGGCTCTAGCCAACATGCAGTTACAACAGCATACAGCATTTCTCCCACCAGG  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  982  ACTGGTATTTTCCAATACCAACAGGCTCTAGCCAACATGCAGTTACAACAGCATACAGCATTTCTCCCACCA--  1053

Query  846  CTCAATATTGTGCATGACACCCGCTACAAGTGTTGTTCCCATGGTGCACGGTGCTACGCCAGCCACTGTGTCCG  919
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054  ----------------------------------GTTCCCATGGTGCACGGTGCTACGCCAGCCACTGTGTCCG  1093

Query  920  CAGCAACAACATCTGCCACAAGTGTTCCCTTCGCTGCAACAGCCACAGCCAACCAGATACCCATAATATCTGCC  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094  CAGCAACAACATCTGCCACAAGTGTTCCCTTCGCTGCAACAGCCACAGCCAACCAGATACCCATAATATCTGCC  1167

Query  994  GAACATCTGACTAGCCACAAGTATGTTACCCAGATG  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168  GAACATCTGACTAGCCACAAGTATGTTACCCAGATG  1203