Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15496
• Subject: XM_017006431.2
• Aligned Length: 1200
• Identities: 937
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCTGTTAGTGTCACACCAATTCGGGACACAAAATGGCTAACACTGGAAGTATGTAGAGAGTTCCAGAGGGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GACTTGCTCACGGCCAGACACGGAATGTAAATTTGCACATCCTTCGAAAAGCTGCCAAGTTGAAAATGGACGAG  148

Query    1  -----------------------ATGGGCCGTTGCTCCAGGGAGAACTGCAAATATCTTCATCCACCCCCACAT  51
                                   |..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAATCGCCTGCTTTGATTCATTGAAAGGCCGTTGCTCCAGGGAGAACTGCAAATATCTTCATCCACCCCCACAT  222

Query   52  TTAAAAACGCAGTTGGAGATAAATGGACGCAATAACTTGATTCAGCAGAAGAACATGGCCATGTTGGCCCAGCA  125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTAAAAACGCAGTTGGAGATAAATGGACGCAATAACTTGATTCAGCAGAAGAACATGGCCATGTTGGCCCAGCA  296

Query  126  AATGCAACTAGCCAATGCCATGATGCCTGGTGCCCCATTACAACCCGTGCCAATGTTTTCAGTTGCACCAAGCT  199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATGCAACTAGCCAATGCCATGATGCCTGGTGCCCCATTACAACCCGTGCCAATGTTTTCAGTTGCACCAAGCT  370

Query  200  TAGCCACCAATGCATCAGCAGCCGCCTTTAATCCCTATCTGGGACCTGTTTCTCCAAGCCTGGTCCCGGCAGAG  273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGCCACCAATGCATCAGCAGCCGCCTTTAATCCCTATCTGGGACCTGTTTCTCCAAGCCTGGTCCCGGCAGAG  444

Query  274  ATCTTGCCGACTGCACCAATGTTGGTTACAGGGAATCCGGGTGTCCCTGTACCTGCAGCTGCTGCAGCTGCTGC  347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCTTGCCGACTGCACCAATGTTGGTTACAGGGAATCCGGGTGTCCCTGTACCTGCAGCTGCTGCAGCTGCTGC  518

Query  348  ACAGAAATTAATGCGAACAGACAGACTTGAGGTATGTCGAGAGTACCAACGTGGCAATTGCAACCGAGGAGAAA  421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAGAAATTAATGCGAACAGACAGACTTGAGGTATGTCGAGAGTACCAACGTGGCAATTGCAACCGAGGAGAAA  592

Query  422  ATGATTGTCGGTTTGCTCATCCTGCTGACAGCACAATGATTGACACCAATGACAACACAGTCACTGTGTGTATG  495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGATTGTCGGTTTGCTCATCCTGCTGACAGCACAATGATTGACACCAATGACAACACAGTCACTGTGTGTATG  666

Query  496  GATTACATCAAAGGGAGATGCTCTCGGGAAAAGTGCAAATACTTTCATCCCCCTGCACATTTGCAAGCCAAGAT  569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATTACATCAAAGGGAGATGCTCTCGGGAAAAGTGCAAATACTTTCATCCCCCTGCACATTTGCAAGCCAAGAT  740

Query  570  CAAGGCTGCCCAATACCAGGTCAACCAGGCTGCAGCTGCACAGGCTGCAGCCACCGCAGCTGCCATGACTCAGT  643
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  741  CAAGGCTGCCCAATACCAGGTCAACCAGGCTGCAGCTGCACAGGCTGCAGCCACCGCAGCTGCCA---------  805

Query  644  CGGCTGTCAAATCACTGAAGCGACCCCTCGAGGCAACCTTTGACCTGGGAATTCCTCAAGCTGTACTTCCCCCA  717
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  ---------------------------------------------TGGGAATTCCTCAAGCTGTACTTCCCCCA  834

Query  718  TTACCAAAGAGGCCTGCTCTTGAAAAAACCAACGGTGCCACCGCAGTCTTTAACACTGGTATTTTCCAATACCA  791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  835  TTACCAAAGAGGCCTGCTCTTGAAAAAACCAACGGTGCCACCGCAGTCTTTAACACTGGTATTTTCCAATACCA  908

Query  792  ACAGGCTCTAGCCAACATGCAGTTACAACAGCATACAGCATTTCTCCCACCAGGCTCAATATTGTGCATGACAC  865
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct  909  ACAGGCTCTAGCCAACATGCAGTTACAACAGCATACAGCATTTCTCCCACCA----------------------  960

Query  866  CCGCTACAAGTGTTGTTCCCATGGTGCACGGTGCTACGCCAGCCACTGTGTCCGCAGCAACAACATCTGCCACA  939
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  --------------GTTCCCATGGTGCACGGTGCTACGCCAGCCACTGTGTCCGCAGCAACAACATCTGCCACA  1020

Query  940  AGTGTTCCCTTCGCTGCAACAGCCACAGCCAACCAGATACCCATAATATCTGCCGAACATCTGACTAGCCACAA  1013
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  AGTGTTCCCTTCGCTGCAACAGCCACAGCCAACCAGATACCCATAATATCTGCCGAACATCTGACTAGCCACAA  1094

Query 1014  GTATGTTACCCAGATG  1029
            ||||||||||||||||
Sbjct 1095  GTATGTTACCCAGATG  1110