Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465274
• Subject: NM_080386.4
• Aligned Length: 1358
• Identities: 1131
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTG  74
            |||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGCGCGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCGGGTGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74

Query   75  CCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATGGCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGATTCCTTCA  148
            |||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct   75  CCTTGAACATGGAATTCAGCCCGATGGCCAAATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGCGGGGACGACTCCTTCA  148

Query  149  ACACCTTCTTCAGTGAAACGGGTGCTGGCAAGCATGTGCCCCGGGCAGTGTTTGTAGACTTGGAACCCACAGTC  222
            ||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.
Sbjct  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222

Query  223  ATTGATGAAGTTCGCACTGGCACTTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAACTCATCACAGGCAAGGAAGATGC  296
            .|.||||||||.|||||.||.||.|||.|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGGACCTACAGGCAGCTCTTCCACCCGGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC  296

Query  297  TGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCTCGTGTTGGACCGAATTCGCA  370
            .||||||||.||.|||.|.||.||.||||||||.|||||||||||..|||||||.||..|||||||.||.||||
Sbjct  297  AGCCAATAATTACGCCAGGGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATTGTTGACCTAGTCCTGGACCGGATCCGCA  370

Query  371  AGCTGGCTGACCAGTGCACCGGTCTTCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGAACTGGTTCTGGG  444
            |.|||||.||.|.||||||.||.||.|||||||||.|..|.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct  371  AACTGGCGGATCTGTGCACAGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGCTTTGGGGGCGGCACTGGCTCTGGG  444

Query  445  TTCACCTCGCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTATGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAGTTCTCCATTTACCC  518
            |||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct  445  TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAGTTTGCCATTTACCC  518

Query  519  GGCGCCCCAGGTTTCCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACCCTGGAGCACT  592
            .||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  519  AGCCCCCCAGGTCTCCACAGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATT  592

Query  593  CTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGACATCTGTCGTAGAAACCTCGATATCGAGCGCCCA  666
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||.||.||.||.
Sbjct  593  CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATTGAACGTCCC  666

Query  667  ACCTACACTAACCTTAACCGCCTTATTAGCCAGATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTTGATGGAGC  740
            ||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.||
Sbjct  667  ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACAGCCTCCCTGCGATTTGATGGGGC  740

Query  741  CCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCCCTACCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACAT  814
            |||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT  814

Query  815  ATGCCCCTGTCATCTCTGCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTACTGTAGCAGAGATCACCAATGCTTGCTTT  888
            |||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||..||||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  815  ATGCCCCAGTCATCTCAGCTGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCTGTGGCCGAGATCACCAATGCCTGCTTC  888

Query  889  GAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAAATACATGGCTTGCTGCCTGTTATACCGTGG  962
            |||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||.||||.|||.|.||
Sbjct  889  GAGCCAGCCAATCAAATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG  962

Query  963  TGACGTGGTTCCCAAAGATGTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAAACCAAGCGTACCATCCAGTTTGTGGATT  1036
            .||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACGTGGTCCCCAAAGACGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTGGATT  1036

Query 1037  GGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATTAATTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGCGGAGACCTGGCCAAG  1110
            |||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTGCCCGACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACAGTGGTCCCCGGGGGAGACCTGGCCAAG  1110

Query 1111  GTACAGAGAGCTGTGTGCATGCTGAGCAATACCACAGCTGTTGCCGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAGTT  1184
            ||.|||.|.||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1111  GTGCAGCGGGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATTGCGGAGGCCTGGGCCCGCCTGGACCATAAGTT  1184

Query 1185  TGACCTGATGTATGCCAAGCGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTGGGTGAGGGGATGGAGGAAGGCGAGTTTTCAG  1258
            .||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 1185  CGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGCGAAGGCATGGAAGAGGGAGAGTTCTCTG  1258

Query 1259  AGGCCCGTGAGGACATGGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGAGCAGAT--AGTGCTGACGGAGAGG  1330
            |||||||.||||||.||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.|..|||  .|||        ||.|
Sbjct 1259  AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTAGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTG--------GAAG  1324

Query 1331  ATGAGGGTGAAG-------AGTAT--  1347
            .|||||.|||||       ||.||  
Sbjct 1325  CTGAGGCTGAAGAAGGCGAAGAATAC  1350