Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465390
• Subject: XM_017002082.2
• Aligned Length: 1752
• Identities: 1365
• Gaps: 387

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGATCTCCTGCCCCCCAAGCCCAAGTACAATCCACTCCGGAATGAGTCTCTGTCATCGCTGGAGGAAGGGGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTCTGGGTCCACCCCCCCGGAGGAGCTGCCTTCCCCATCAGCTTCATCCCTGGGGCCCATCCTGCCTCCTCTGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CTGGGGACGATAGTCCCACTACCCTGTGCTCCTTCTTCCCCCGGATGAGCAACCTGAGGCTGGCCAACCCGGCT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GGGGGGCGCCCAGGGTCTAAGGGGGAGCCAGGAAGGGCAGCTGATGATGGGGAGGGGATCGTAGGGGCAGCCAT  296

Query    1  ----------------------------------ATGAACAAGCTGAGTGGAGGCGGCGGGCGCAGGACTCGGG  40
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCAGACTCAGGCCCCCTACCCCTCCTCCAGGACATGAACAAGCTGAGTGGAGGCGGCGGGCGCAGGACTCGGG  370

Query   41  TGGAAGGGGGCCAGCTTGGGGGCGAGGAGTGGACCCGCCACGGGAGCTTTGTCAATAAGCCCACGCGGGGCTGG  114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAAGGGGGCCAGCTTGGGGGCGAGGAGTGGACCCGCCACGGGAGCTTTGTCAATAAGCCCACGCGGGGCTGG  444

Query  115  CTGCATCCCAACGACAAAGTCATGGGACCCGGGGTTTCCTACTTGGTTCGGTACATGGGTTGTGTGGAGGTCCT  188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCATCCCAACGACAAAGTCATGGGACCCGGGGTTTCCTACTTGGTTCGGTACATGGGTTGTGTGGAGGTCCT  518

Query  189  CCAGTCAATGCGTGCCCTGGACTTCAACACCCGGACTCAGGTCACCAGGGAGGCCATCAGTCTGGTGTGTGAGG  262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGTCAATGCGTGCCCTGGACTTCAACACCCGGACTCAGGTCACCAGGGAGGCCATCAGTCTGGTGTGTGAGG  592

Query  263  CTGTGCCGGGTGCTAAGGGGGCGACAAGGAGGAGAAAGCCCTGTAGCCGCCCGCTCAGCTCTATCCTGGGGAGG  336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGTGCCGGGTGCTAAGGGGGCGACAAGGAGGAGAAAGCCCTGTAGCCGCCCGCTCAGCTCTATCCTGGGGAGG  666

Query  337  AGTAACCTGAAATTTGCTGGAATGCCAATCACTCTCACCGTCTCCACCAGCAGCCTCAACCTCATGGCCGCAGA  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTAACCTGAAATTTGCTGGAATGCCAATCACTCTCACCGTCTCCACCAGCAGCCTCAACCTCATGGCCGCAGA  740

Query  411  CTGCAAACAGATCATCGCCAACCACCACATGCAATCTATCTCATTTGCATCCGGCGGGGATCCGGACACAGCCG  484
            |||||||||                                                      |||||||||||
Sbjct  741  CTGCAAACA------------------------------------------------------GGACACAGCCG  760

Query  485  AGTATGTCGCCTATGTTGCCAAAGACCCTGTGAATCAGAGAGCCTGCCACATTCTGGAGTGTCCCGAAGGGCTT  558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  761  AGTATGTCGCCTATGTTGCCAAAGACCCTGTGAATCAGAGAGCCTGCCACATTCTGGAGTGTCCCGAAGGGCTT  834

Query  559  GCCCAGGATGTCATCAGCACCATTGGCCAGGCCTTCGAGTTGCGCTTCAAACAATACCTCAGGAACCCACCCAA  632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  835  GCCCAGGATGTCATCAGCACCATTGGCCAGGCCTTCGAGTTGCGCTTCAAACAATACCTCAGGAACCCACCCAA  908

Query  633  ACTGGTCACCCCTCATGACAGGATGGCTGGCTTTGATGGCTCAGCATGGGATGAGGAGGAGGAAGAGCCACCTG  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  909  ACTGGTCACCCCTCATGACAGGATGGCTGGCTTTGATGGCTCAGCATGGGATGAGGAGGAGGAAGAGCCACCTG  982

Query  707  ACCATCAGTACTATAATGACTTCCCGGGGAAGGAACCCCCCTTGGGGGGGGTGGTAGACATGAGGCTTCGGGAA  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  983  ACCATCAGTACTATAATGACTTCCCGGGGAAGGAACCCCCCTTGGGGGGGGTGGTAGACATGAGGCTTCGGGAA  1056

Query  781  GGAGCCGCTCCAGGGGCTGCTCGACCCACTGCACCCAATGCCCAGACCCCCAGCCACTTGGGAGCTACATTGCC  854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057  GGAGCCGCTCCAGGGGCTGCTCGACCCACTGCACCCAATGCCCAGACCCCCAGCCACTTGGGAGCTACATTGCC  1130

Query  855  TGTAGGACAGCCTGTTGGGGGAGATCCAGAAGTCCGCAAACAGATGCCACCTCCACCACCCTGTCCAGCAGGCA  928
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||
Sbjct 1131  TGTAGGACAGCCTGTTGGGGGAGATCCAGAAGTCCGCAAACAGATGCCACCTCCACCACCCTGTC---CAGGCA  1201

Query  929  GAGAGCTTTTTGATGATCCCTCCTATGTCAACGTCCAGAACCTAGACAAGGCCCGGCAAGCAGTGGGTGGTGCT  1002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202  GAGAGCTTTTTGATGATCCCTCCTATGTCAACGTCCAGAACCTAGACAAGGCCCGGCAAGCAGTGGGTGGTGCT  1275

Query 1003  GGGCCCCCCAATCCTGCTATCAATGGCAGTGCACCCCGGGACCTGTTTGACATGAAGCCCTTCGAAGATGCTCT  1076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1276  GGGCCCCCCAATCCTGCTATCAATGGCAGTGCACCCCGGGACCTGTTTGACATGAAGCCCTTCGAAGATGCTCT  1349

Query 1077  TCGCGTGCCTCCACCTCCCCAGTCGGTGTCCATGGCTGAGCAGCTCCGAGGGGAGCCCTGGTTCCATGGGAAGC  1150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350  TCGCGTGCCTCCACCTCCCCAGTCGGTGTCCATGGCTGAGCAGCTCCGAGGGGAGCCCTGGTTCCATGGGAAGC  1423

Query 1151  TGAGCCGGCGGGAGGCTGAGGCACTGCTGCAGCTCAATGGGGACTTCCTGGTACGGGAGAGCACGACCACACCT  1224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1424  TGAGCCGGCGGGAGGCTGAGGCACTGCTGCAGCTCAATGGGGACTTCCTGGTACGGGAGAGCACGACCACACCT  1497

Query 1225  GGCCAGTATGTGCTCACTGGCTTGCAGAGTGGGCAGCCTAAGCATTTGCTACTGGTGGACCCTGAGGGTGTGGT  1298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498  GGCCAGTATGTGCTCACTGGCTTGCAGAGTGGGCAGCCTAAGCATTTGCTACTGGTGGACCCTGAGGGTGTGGT  1571

Query 1299  TCGGACTAAGGATCACCGCTTTGAAAGTGTCAGTCACCTTATCAGCTACCACATGGACAATCACTTGCCCATCA  1372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1572  TCGGACTAAGGATCACCGCTTTGAAAGTGTCAGTCACCTTATCAGCTACCACATGGACAATCACTTGCCCATCA  1645

Query 1373  TCTCTGCGGGCAGCGAACTGTGTCTACAGCAACCTGTGGAGCGGAAACTG  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1646  TCTCTGCGGGCAGCGAACTGTGTCTACAGCAACCTGTGGAGCGGAAACTG  1695