Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465631
- Subject:
- NM_001199685.1
- Aligned Length:
- 2696
- Identities:
- 2387
- Gaps:
- 4
Alignment
Query 1 ATGCGTAAAGGGGTGCTGAAGGACCCAGAGATTGCCGATCTATTCTACAAAGATGATCCTGAGGAACTTTTTAT 74
|||||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||||.|||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGCGTAAAGGGGCACTGAAGGACCCAGAGATTGCTGATCTGTTCTTCAAGGATGACCCCGAAGAGCTTTTTAT 74
Query 75 TGGTTTGCATGAAATTGGACATGGAAGTTTTGGAGCAGTTTATTTTGCTACAAATGCTCACACCAGTGAGGTGG 148
.|.|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||..|||||||
Sbjct 75 CGATTTGCATGAAATTGGACATGGGAGCTTTGGAGCCGTGTACTTTGCGACAAATGCGCACACCAACGAGGTGG 148
Query 149 TGGCAATTAAGAAGATGTCCTATAGTGGGAAGCAGACCCATGAGAAATGGCAAGATATTCTTAAGGAAGTTAAA 222
|.||..|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 149 TCGCTGTTAAGAAAATGTCCTACAGTGGGAAGCAGACCCATGAGAAATGGCAAGATATCCTTAAGGAAGTTAAG 222
Query 223 TTTTTACGACAATTGAAGCATCCTAATACTATTGAGTACAAAGGCTGTTACTTGAAAGAACACACTGCTTGGTT 296
|||.|.|..||..|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 223 TTTCTGCAGCAGCTGAAGCATCCTAACACCATCGAGTACAAAGGCTGTTATTTAAAGGAGCACACTGCATGGTT 296
Query 297 GGTGATGGAATATTGCTTAGGCTCAGCCTCTGATTTATTAGAAGTTCATAAAAAACCACTTCAGGAAGTGGAGA 370
|||||||||.||.|||.||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTGATGGAGTACTGCCTAGGTTCAGCCTCTGACTTGTTAGAAGTTCATAAGAAACCACTTCAGGAAGTGGAGA 370
Query 371 TCGCTGCCATTACTCATGGAGCCTTGCATGGACTAGCCTACCTACATTCTCATGCATTGATTCATAGGGATATT 444
|||||||.||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|.|||..|..|||||||.|||||.|||
Sbjct 371 TCGCTGCTATCACCCATGGTGCCTTGCAGGGGCTGGCCTACCTCCACTTTCACTCCCTGATTCACAGGGACATT 444
Query 445 AAAGCAGGAAATATTCTTCTAACAGAGCCAGGTCAGGTAAAACTAGCTGATTTTGGATCTGCTTCAATGGCTTC 518
||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 445 AAAGCAGGGAACATCCTCCTCACAGAGCCAGGTCAGGTGAAGCTGGCTGACTTCGGATCTGCCTCCATGGCTTC 518
Query 519 TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT 592
|||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 519 TCCCGCCAACTCCTTTGTGGGGACTCCTTACTGGATGGCCCCAGAGGTAATCTTAGCTATGGACGAAGGGCAGT 592
Query 593 ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC 666
|.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 593 ACGACGGGAAAGTTGACATCTGGTCGCTTGGCATCACCTGCATAGAGTTGGCGGAGCGGAAGCCCCCCCTCTTC 666
Query 667 AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC 740
||||||||.||.|||||.|||.|.||.|||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||.|..||||||||
Sbjct 667 AACATGAACGCCATGAGCGCCCTCTACCACATCGCTCAGAATGACTCCCCCACGCTACAGTCCAGGGAATGGAC 740
Query 741 AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT 814
|||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|..|.|..||.||.|
Sbjct 741 AGACTCCTTCAGGAGATTCGTTGATTACTGCTTGCACAAAATACCTCAGGAAAGACCAGCCGCGGTGGAGCTGT 814
Query 815 TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACG--TGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATG 886
|..||||||||||..||||..|.||.||||||| || .|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCGGCATGACTTCATTCGGAGGGAGCGGCCAC--CGAAGGTCCTCATTGATCTCATACAGAGGACAAAAGATG 886
Query 887 CAGTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCC 960
|.||.||.|||||.||.|||||.||||||.|.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 887 CTGTCCGAGAGCTGGACAACCTGCAGTACAGGAAAATGAAGAAGATCCTCTTCCAGGAGACTCGGAACGGACCC 960
Query 961 TTGAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGG 1034
|||||||||||.||.||.||.||.|||||..||||.||.||||.||.|||||||.|.||..|||||||.|||||
Sbjct 961 TTGAATGAGTCGCAAGAAGAAGAAGAAGATGGTGAGCAAGGAAGCAACCTGAACCGAGAGGTGGACAGTCTGGG 1034
Query 1035 CAGCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAG 1108
|||||.|||.||||||||.||||..||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1035 CAGCATCCACTCCATTCCCAGCACATCAGTGAGCACAGGCAGCCGGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAGG 1108
Query 1109 TCATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTC 1182
|||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.|||.|||||..|||.||||||.|||||...
Sbjct 1109 TCATGGATGAGAGCAGCTCTGAGCTCGTCATGATGCAGGAGGATGAAGGCACAGCCAACTCCAGCGCCTCCACG 1182
Query 1183 GTGCATAAGAAAGATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCGATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTAC 1256
||.||.|||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 GTACACAAGAAGGATCATGTATTCGTAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCGATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTAC 1256
Query 1257 CCAGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTTGCCACGATCAAATCAGCATCTTTGG 1330
|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1257 CCAGTCAGTTCAGAGCCGGGCCCTCCACTATCGGAACCGAGAGCGCTTTGCCACGATCAAATCCGCGTCTTTGG 1330
Query 1331 TTACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACAGATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGG 1404
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331 TTACACGGCAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGCTGCGGGAACAGATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGG 1404
Query 1405 CGCCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTGAGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCT 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1405 CGCCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTGAGATGGATGAGCACCGCCTCAAGCT 1478
Query 1479 ACAGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTA 1552
.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479 CCAGAAGGAGGTGGAGACGCACGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTA 1552
Query 1553 TCATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCAGCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAG 1626
.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct 1553 CCATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCCGCAGCGGATGAGAAGAAGTTCCAGCAGCAGATCCTGGCCCAGCAGAAG 1626
Query 1627 AAAGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTTGTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAAT 1700
||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1627 AAGGACTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTACAAGATTTGTAAGGAGAAAATAAAAGAGGAAAT 1700
Query 1701 GAATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCCAAACATAAAGAGAACTTGCAGCACA 1774
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1701 GAACGAGGACCATAGCACACCCAAGAAGGAGAAGCAGGAGCGGATATCGAAGCATAAAGAAAACCTGCAGCACA 1774
Query 1775 CACAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTACGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAG 1848
|.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.|||.||.||.||||||||.
Sbjct 1775 CGCAGGCCGAGGAGGAAGCCCACCTGCTCACTCAACAGAGGCTGTACTACGACAGAAACTGCCGCTTCTTCAAA 1848
Query 1849 CGGAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGGAGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCA 1922
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 1849 CGGAAAATAATGATCAAGCGCCACGAGGTGGAACAGCAGAACATTCGGGAGGAATTAAATAAGAAGAGGACCCA 1922
Query 1923 GAAGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGAGAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACA 1996
||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1923 GAAGGAAATGGAGCACGCCATGCTGATCCGGCATGATGAATCCACCCGAGAGCTGGAGTACAGGCAGCTGCACA 1996
Query 1997 CGTTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGAACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAAT 2070
|..|.||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1997 CCCTGCAGAAGCTCCGCATGGATCTGATCCGGCTGCAGCACCAGACGGAACTGGAGAACCAGCTGGAGTACAAT 2070
Query 2071 AAGAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGCAACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCAT 2144
||||||||.||..|.||.||||||.|.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2071 AAGAGGCGGGAGCGGGAGCTGCACCGGAAGCACGTCATGGAGCTTCGGCAACAGCCGAAAAACTTAAAGGCCAT 2144
Query 2145 GGAAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACCAAACAGTATAAAGCACTCAAGAATC 2218
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 2145 GGAAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACCAAACAGTACAAAGCCCTCAAAAATC 2218
Query 2219 ACCAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGACACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAA 2292
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||.||.||||||||.||.||.
Sbjct 2219 ACCAGTTGGAAGTCACTCCAAAGAATGAGCACAAAGCAATCCTAAAGACACTGAAGGACGAGCAGACGAGGAAG 2292
Query 2293 CTTGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGGCCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGA 2366
||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2293 CTGGCCATTTTGGCCGAGCAGTATGAACAGAGTATAAACGAGATGATGGCCTCTCAAGCGTTACGGCTAGACGA 2366
Query 2367 GGCTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAAATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGA 2440
|||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2367 GGCACAAGAGGCAGAGTGCCAGGCCTTGAGACTACAGCTCCAGCAGGAGATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGA 2440
Query 2441 GCAAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAAGCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGC 2514
|||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2441 GCAAAATCAAGATGCAAACGGAGGCCCAGCACGAGCGCGAGCTACAGAAGCTAGAGCAGAGGGTGTCCCTGCGC 2514
Query 2515 AGAGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGAAGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAA 2588
|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||.
Sbjct 2515 AGAGCGCATCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTGCAGAAGGAACGCAGTGAGAGGATCAAGAC 2588
Query 2589 CCTATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGCCTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGG 2662
.||..||||.||.|||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2589 TCTCCTGGAGAGACAAGAGCGAGAGACCGAGACTTTTGACATGGAGAGCCTCAGAATGGGCTTTGGGAATTTGG 2662
Query 2663 TTACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA 2694
|.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2663 TGACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTATAGA 2694