Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465631
• Subject: XM_017019412.2
• Aligned Length: 2721
• Identities: 2184
• Gaps: 537

Alignment

Query    1  ATGCGTAAAGGGGTGCTGAAGGACCCAGAGATTGCCGATCTATTCTACAAAGATGATCCTGAGGAACTTTTTAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGGTTTGCATGAAATTGGACATGGAAGTTTTGGAGCAGTTTATTTTGCTACAAATGCTCACACCAGTGAGGTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGCAATTAAGAAGATGTCCTATAGTGGGAAGCAGACCCATGAGAAATGGCAAGATATTCTTAAGGAAGTTAAA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTTTTACGACAATTGAAGCATCCTAATACTATTGAGTACAAAGGCTGTTACTTGAAAGAACACACTGCTTGGTT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGTGATGGAATATTGCTTAGGCTCAGCCTCTGATTTATTAGAAGTTCATAAAAAACCACTTCAGGAAGTGGAGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCGCTGCCATTACTCATGGAGCCTTGCATGGACTAGCCTACCTACATTCTCATGCATTGATTCATAGGGATATT  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  AAAGCAGGAAATATTCTTCTAACAGAGCCAGGTCAGGTAAAACTAGCTGATTTTGGATCTGCTTCAATGGCTTC  518
                                                                              ||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------------ATGGCTTC  8

Query  519  TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    9  TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT  82

Query  593  ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   83  ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC  156

Query  667  AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  157  AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC  230

Query  741  AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  231  AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT  304

Query  815  TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACGTGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  305  TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACGTGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATGCA  378

Query  889  GTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  379  GTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCCTT  452

Query  963  GAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  453  GAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGGCA  526

Query 1037  GCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAGTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  527  GCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAGTC  600

Query 1111  ATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTCGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  ATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTCGT  674

Query 1185  GCATAAGAAA---------------------------GATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCG  1231
            ||||||||||                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  675  GCATAAGAAAGTAGGTTTCTTGGTACCCTCCACAGAGGATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCG  748

Query 1232  ATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTACCCAGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTT  1305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  749  ATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTACCCAGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTT  822

Query 1306  GCCACGATCAAATCAGCATCTTTGGTTACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACA  1379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  823  GCCACGATCAAATCAGCATCTTTGGTTACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACA  896

Query 1380  GATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGGCGCCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTG  1453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897  GATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGGCGCCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTG  970

Query 1454  AGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCTACAGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAG  1527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  971  AGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCTACAGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAG  1044

Query 1528  AAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTATCATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCA  1601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045  AAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTATCATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCA  1118

Query 1602  GCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAGAAAGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTT  1675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119  GCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAGAAAGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTT  1192

Query 1676  GTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAATGAATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCC  1749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193  GTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAATGAATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCC  1266

Query 1750  AAACATAAAGAGAACTTGCAGCACACACAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTA  1823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267  AAACATAAAGAGAACTTGCAGCACACACAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTA  1340

Query 1824  CGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAGCGGAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGG  1897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341  CGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAGCGGAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGG  1414

Query 1898  AGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCAGAAGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGA  1971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415  AGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCAGAAGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGA  1488

Query 1972  GAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACACGTTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGA  2045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489  GAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACACGTTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGA  1562

Query 2046  ACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAATAAGAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGC  2119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563  ACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAATAAGAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGC  1636

Query 2120  AACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCATGGAAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACC  2193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637  AACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCATGGAAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACC  1710

Query 2194  AAACAGTATAAAGCACTCAAGAATCACCAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGAC  2267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711  AAACAGTATAAAGCACTCAAGAATCACCAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGAC  1784

Query 2268  ACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAACTTGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGG  2341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785  ACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAACTTGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGG  1858

Query 2342  CCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGAGGCTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAA  2415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859  CCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGAGGCTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAA  1932

Query 2416  ATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGAGCAAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAA  2489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933  ATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGAGCAAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAA  2006

Query 2490  GCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGCAGAGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGA  2563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2007  GCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGCAGAGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGA  2080

Query 2564  AGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAACCTATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGC  2637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081  AGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAACCTATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGC  2154

Query 2638  CTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGGTTACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA  2694
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155  CTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGGTTACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA  2211