Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465888
• Subject: NM_020844.3
• Aligned Length: 1362
• Identities: 1093
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGATCATGAAGCCGCCCAGCTGGAGAAGCAGCATGTGCACAATGTGTACGAGAGCACAGCCCCTTACTTCAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGACCTGCAGAGCAAAGCCTGGCCTCGTGTCCGCCAGTTCCTGCAAGAGCAGAAGCCAGGCAGCCTCATCGCTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACATAGGTTGTGGGACTGGAAAATATCTTAAAGTGAACAGCCAGGTACATACCGTGGGCTGTGACTACTGTGGG  222

Query    1  ---------------------------------------ATGGTATGTGACAACCTTAATCTCCCCTTTAGGGA  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCACTGGTAGAGATTGCCCGGAATAGAGGATGTGAAGCCATGGTATGTGACAACCTTAATCTCCCCTTTAGGGA  296

Query   36  TGAGGGCTTCGATGCCATCATCTCCATAGGAGTCATACATCATTTTTCTACAAAACAAAGAAGAATCAGAGCAA  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGGGCTTCGATGCCATCATCTCCATAGGAGTCATACATCATTTTTCTACAAAACAAAGAAGAATCAGAGCAA  370

Query  110  TAAAAGAAATGGCCAGGGTCTTAGTTCCCGGAGGCCAACTGATGATTTACGTTTGGGCAATGGAACAAAAGAAC  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAAAAGAAATGGCCAGGGTCTTAGTTCCCGGAGGCCAACTGATGATTTACGTTTGGGCAATGGAACAAAAGAAC  444

Query  184  CGTCGCTTTGAGAAGCAAGACGTGCTTGTTCCATGGAACAGGGCCCTGTGTTCCCAGCTCTTCTCAGAGTCCAG  257
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGTCACTTTGAGAAGCAAGACGTGCTTGTTCCATGGAACAGGGCTCTGTGTTCCCAGCTCTTCTCAGAGTCCAG  518

Query  258  CCAGTCTGGGAGGAAGAGGCAGTGTGGATACCCAGAAAGAGGCCATCCCTACCATCCTCCTTGCTCTGAGTGTA  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGTCTGGGAGGAAGAGGCAGTGTGGATACCCAGAAAGAGGCCATCCCTACCATCCTCCTTGCTCTGAGTGTA  592

Query  332  GCTGTTCTGTTTGTTTTAAAGAGCAGGGTGGTTCAAAACGGTCCCACAGTGTGGGCTATGAACCTGCTATGGCA  405
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTGTTCTGTTTGTTTTAAAGAGCAGTGTGGTTCAAAACGGTCCCACAGCGTGGGCTATGAACCTGCTATGGCA  666

Query  406  AGAACCTGTTTTGCAAATATTTCTAAGGAAGGCGAGGAAGAATATGGATTTTACAGCACATTAGGAAAATCGTT  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAACCTGTTTTGCAAATATTTCTAAGGAAGGCGAGGAAGAATATGGATTTTACAGCACATTAGGAAAATCGTT  740

Query  480  TCGTTCCTGGTTTTTCTCCAGATCTTTGGATGAATCGACTCTGAGGAAGCAAATTGAAAGAGTAAGACCCTTGA  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCGTTCCTGGTTTTTCTCCAGATCTTTGGATGAATCGACTCTGAGGAAGCAAATTGAAAGAGTAAGACCCTTGA  814

Query  554  AAAACACAGAAGTTTGGGCCAGTAGCACTGTAACAGTCCAGCCTTCCAGACACTCTAGTCTAGACTTTGATCAC  627
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  815  AAAACACAGAAGTTTGGGCCAGTAGCACTGTAACAGTCCAGCCTTCCAGACACTCTAGTTTAGACTTTGATCAC  888

Query  628  CAAGAGCCATTTTCAACAAAAGAGCAAAGTTTAGATGAGGAAGTGTTTGTGGAATCTTCTTCTGGAAAACACTT  701
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAAGAGCCATTTTCAACAAAAGGGCAAAGTTTAGATGAGGAAGTGTTTGTGGAATCTTCTTCTGGAAAACACTT  962

Query  702  GGAGTGGCTGAGAGCACCAGGCACTCTGAAACATTTAAATGGAGACCATCAAGGGGAAATGAGGAGAAATGGAG  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGTGGCTGAGAGCACCAGGCACTCTGAAACATTTAAATGGAGACCATCAAGGGGAAATGAGGAGAAATGGAG  1036

Query  776  GGGGAAATTTTCTGGATAGCACTAATACTGGTGTGAATTGTGTGGATGCAGGCAACATAGAAGATGATAATCCT  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGGAAATTTTCTGGATAGCACTAATACTGGTGTGAATTGTGTGGATGCAGGCAACATAGAAGATGATAATCCT  1110

Query  850  TCTGCTAGTAAAATATTGAGAAGGATTTCTGCAGTCGATTCCACAGATTTCAACCCAGATGATACAATGTCTGT  923
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTGCTAGTAAAATATTGAGAAGGATTTCTGCAGTTGATTCCACAGATTTCAACCCAGATGATACAATGTCTGT  1184

Query  924  CGAAGATCCACAGACTGATGTTTTGGACTCCACAGCCTTTATGCGCTACTACCATGTGTTTCGAGAAGGGGAGC  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGAAGATCCACAGACTGATGTTTTGGACTCCACAGCCTTTATGCGCTACTACCATGTGTTTCGAGAAGGGGAGC  1258

Query  998  TCTGCAGTCTGCTCAAGGAGAATGTGTCAGAGCTCCGTATCCTGAGTTCTGGGAATGATCATGGTAACTGGTGT  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTGCAGTCTGCTCAAGGAGAATGTGTCAGAGCTCCGTATCCTGAGTTCTGGGAATGATCATGGTAACTGGTGT  1332

Query 1072  ATCATTGCAGAGAAAAAGGGAGGTTGTGAT  1101
            ||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  ATCATTGCAGAGAAAAAGAGAGGTTGTGAT  1362