Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466084
- Subject:
- NM_001139466.1
- Aligned Length:
- 1731
- Identities:
- 1427
- Gaps:
- 165
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACCGAGCTCGCTGGCGCCTCTTCATCGTGCTGCCACCGCCCTGCAGGAAGAGGGGCCATGCAGTCAGTCTT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCACCACTTTCAACGTTTGCGAGGGAGAGAGGGTGGTTCCCACTTCATCAACACCTCATCGCCGCGAGGTGAGG 148
Query 1 -----ATGAGCATAACCAGTGACGAGGTGAACTTTCTGGTTTATCGGTATCTCCAGGAGTCAGGTTTTTCTCAC 69
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 149 CTAAGATGAGCATAACCAGTGACGAGGTGAACTTTCTGGTGTATCGGTATCTCCAGGAGTCAGGTTTTTCCCAC 222
Query 70 TCGGCTTTCACGTTTGGGATCGAGAGCCACATCAGCCAGTCCAACATCAATGGGACACTAGTGCCACCGTCTGC 143
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.||
Sbjct 223 TCGGCTTTCACGTTTGGGATTGAGAGCCACATCAGCCAGTCCAACATCAATGGGACGCTAGTGCCACCGGCCGC 296
Query 144 CCTCATCTCCATTCTCCAGAAGGGACTGCAGTATGTAGAGGCTGAGATAAGCATCAACAAGGATGGCACAGTGT 217
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct 297 CCTCATCTCCATTCTCCAGAAGGGCCTGCAGTATGTAGAGGCCGAGATCAGTATCAACGAGGATGGCACAGTGT 370
Query 218 TCGACAGCCGCCCTATAGAGTCCCTGTCCCTGATAGTTGCTGTGATTCCTGATGTGGTGCAGATGCGGCAGCAG 291
|||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||..||.|||||.||.||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 371 TCGACGGCCGCCCCATAGAGTCCCTGTCACTGATAGACGCCGTGATGCCCGACGTGGTGCAGACGCGGCAGCAG 444
Query 292 GCATTTGGAGAGAAGCTCACTCAGCAGCAAGCCAGTGCAGCAGCCACAGAGGCATCAGCAATGGCA------AA 359
|||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||..|.|.|||..|.||.|.|||| |.
Sbjct 445 GCATTCCGAGAGAAGCTCGCTCAGCAGCAAGCCAGTGCGGCGGCGGCGGCGGCTGCGGCCACGGCAGCAGCGAC 518
Query 360 GGCGGCAACCATGACCCCAGCTGCTATTTCCCAGCAAAATCCTCCAAAGAACCGAGAGGCCACAGTGAACGGGG 433
.||.||.||||.||||.||||.|...|||||||.||||||||..|.||||||.||||||||||.|||||.||||
Sbjct 519 AGCAGCCACCACGACCTCAGCCGGCGTTTCCCACCAAAATCCATCGAAGAACAGAGAGGCCACGGTGAATGGGG 592
Query 434 AAGAGAATGGAGCACATGAAATCAATAATCACTCAAAGCCAATGGAAATAGATGGGGATGTTGAGATTCCACCC 507
|||||||..||||||||..|.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.||
Sbjct 593 AAGAGAACAGAGCACATTCAGTCAATAATCACGCGAAGCCAATGGAAATAGATGGAGAGGTTGAGATTCCATCC 666
Query 508 AACAAAGCCACAGTCCTTCGGGGCCACGAGTCTGAGGTGTTCATTTGTGCCTGGAACCCTGTCAGTGATTTGCT 581
|.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 AGCAAAGCCACAGTCCTTCGGGGCCATGAGTCTGAGGTGTTCATTTGTGCCTGGAATCCTGTCAGTGATTTGCT 740
Query 582 AGCCTCTGGATCTGGAGACTCAACTGCAAGGATATGGAACCTGAATGAGAATAGCAACGGGGGCTCCACCCAGC 655
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGCCTCCGGATCTGGAGACTCAACTGCAAGGATATGGAACCTGAATGAGAATAGCAACGGGGGCTCCACCCAGC 814
Query 656 TCGTGTTGAGACATTGTATACGAGAAGGGGGGCACGACGTCCCAAGTAATAAAGATGTCACCTCACTGGACTGG 729
||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCGTGTTGAGGCACTGTATACGAGAGGGGGGCCATGACGTCCCGAGTAACAAAGACGTCACCTCACTGGACTGG 888
Query 730 AACAGTGATGGAACACTATTGGCTATGGGTTCATATGATGGTTTCGCAAGAATATGGACAGAAAATGGTAACCT 803
||.|...||||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 889 AATACCAATGGAACACTCTTGGCTACGGGTTCATATGACGGTTTTGCAAGAATATGGACGGAAGATGGTAACCT 962
Query 804 GGCCAGCACCTTAGGCCAACATAAAGGCCCCATCTTCGCTCTGAAATGGAACAAAAAGGGGAATTATGTTTTGA 877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||..||||||||||||..||||||
Sbjct 963 GGCCAGCACCTTAGGCCAACATAAAGGCCCCATCTTTGCCTTGAAATGGAACCGAAAGGGGAATTACATTTTGA 1036
Query 878 GTGCTGGTGTAGACAAAACAACAATAATTTGGGATGCTCACACAGGAGAAGCCAAACAGCAGTTTCCTTTTCAT 951
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTGCTGGTGTAGACAAAACAACAATAATTTGGGATGCCCACACAGGAGAAGCCAAACAGCAGTTTCCTTTTCAT 1110
Query 952 TCAGCCCCCGCCCTTGATGTGGACTGGCAGAACAACATGACCTTTGCCTCCTGTAGCACAGACATGTGTATCCA 1025
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCAGCCCCTGCCCTTGATGTGGACTGGCAGAACAACACGACCTTTGCCTCCTGTAGCACAGACATGTGTATCCA 1184
Query 1026 TGTGTGCAGGCTCGGCTGTGACCACCCAGTCAAAACCTTCCAGGGACACACAAACGAGGTCAATGCCATCAAAT 1099
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1185 TGTGTGCAGGCTCGGCTGTGACCGCCCAGTCAAAACCTTCCAGGGACACACAAACGAGGTCAACGCCATCAAAT 1258
Query 1100 GGGATCCTTCTGGAATGTTGCTGGCGTCCTGCTCGGATGACATGACATTGAAGATCTGGAGTATGAAGCAGGAT 1173
|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1259 GGGATCCGTCTGGAATGTTGCTGGCATCCTGCTCGGATGACATGACATTGAAGATCTGGAGCATGAAACAGGAG 1332
Query 1174 GCATGCGTCCACGATCTTCAGGCTCACAGCAAAGAGATCTACACCATCAAGTGGAGCCCCACCGGGCCTGCCAC 1247
|..|||.||||.||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1333 GTGTGCATCCATGATCTTCAGGCTCACAATAAAGAGATCTACACCATCAAGTGGAGCCCCACTGGGCCCGCCAC 1406
Query 1248 CAGCAACCCAAACTCCAGCATCATGTTGGCAAGTGCTTCATTTGATTCTACAGTGCGACTGTGGGATGTGGAGC 1321
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|.||.|
Sbjct 1407 CAGCAACCCAAACTCCAACATCATGTTGGCAAGTGCTTCGTTTGATTCTACGGTGCGACTGTGGGACATAGAAC 1480
Query 1322 AAGGTGTCTGCACCCACACACTCATGAAGCATCAAGAGCCTGTCTACAGTGTAGCTTTCAGCCCCGATGGAAAG 1395
.|||.||||||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1481 GAGGCGTCTGCACCCACACGCTCACGAAGCATCAGGAGCCTGTCTATAGCGTAGCTTTCAGCCCTGATGGGAAG 1554
Query 1396 TACTTGGCTAGTGGATCCTTTGACAAGTATGTTCATATCTGGAATACTCAGAGTGGAAGTCTCGTCCACAGCTA 1469
||||||||.|||||||||||.|||||||..||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||
Sbjct 1555 TACTTGGCCAGTGGATCCTTCGACAAGTGCGTCCATATCTGGAATACTCAGAGTGGAAATCTTGTCCACAGCTA 1628
Query 1470 CCAAGGCACTGGCGGTATCTTCGAGGTGTGCTGGAACGCCCGAGGAGATAAAGTGGGCGCCAGCGCGTCTGATG 1543
||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1629 CCGAGGCACTGGCGGCATCTTCGAGGTGTGCTGGAACGCCCGAGGAGACAAAGTGGGTGCCAGCGCGTCCGACG 1702
Query 1544 GCTCTGTGTGTGTTCTGGATCTG------ 1566
||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1703 GCTCTGTGTGTGTTTTGGATCTGCGGAAG 1731