Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466084
- Subject:
- NM_001139467.1
- Aligned Length:
- 1578
- Identities:
- 1427
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGAGCATAACCAGTGACGAGGTGAACTTTCTGGTTTATCGGTATCTCCAGGAGTCAGGTTTTTCTCACTCGGC 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGAGCATAACCAGTGACGAGGTGAACTTTCTGGTGTATCGGTATCTCCAGGAGTCAGGTTTTTCCCACTCGGC 74
Query 75 TTTCACGTTTGGGATCGAGAGCCACATCAGCCAGTCCAACATCAATGGGACACTAGTGCCACCGTCTGCCCTCA 148
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 75 TTTCACGTTTGGGATTGAGAGCCACATCAGCCAGTCCAACATCAATGGGACGCTAGTGCCACCGGCCGCCCTCA 148
Query 149 TCTCCATTCTCCAGAAGGGACTGCAGTATGTAGAGGCTGAGATAAGCATCAACAAGGATGGCACAGTGTTCGAC 222
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCTCCATTCTCCAGAAGGGCCTGCAGTATGTAGAGGCCGAGATCAGTATCAACGAGGATGGCACAGTGTTCGAC 222
Query 223 AGCCGCCCTATAGAGTCCCTGTCCCTGATAGTTGCTGTGATTCCTGATGTGGTGCAGATGCGGCAGCAGGCATT 296
.|||||||.||||||||||||||.|||||||..||.|||||.||.||.||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 223 GGCCGCCCCATAGAGTCCCTGTCACTGATAGACGCCGTGATGCCCGACGTGGTGCAGACGCGGCAGCAGGCATT 296
Query 297 TGGAGAGAAGCTCACTCAGCAGCAAGCCAGTGCAGCAGCCACAGAGGCATCAGCAATGGCA------AAGGCGG 364
..|||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||..|.|.|||..|.||.|.|||| |..||.|
Sbjct 297 CCGAGAGAAGCTCGCTCAGCAGCAAGCCAGTGCGGCGGCGGCGGCGGCTGCGGCCACGGCAGCAGCGACAGCAG 370
Query 365 CAACCATGACCCCAGCTGCTATTTCCCAGCAAAATCCTCCAAAGAACCGAGAGGCCACAGTGAACGGGGAAGAG 438
|.||||.||||.||||.|...|||||||.||||||||..|.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 371 CCACCACGACCTCAGCCGGCGTTTCCCACCAAAATCCATCGAAGAACAGAGAGGCCACGGTGAATGGGGAAGAG 444
Query 439 AATGGAGCACATGAAATCAATAATCACTCAAAGCCAATGGAAATAGATGGGGATGTTGAGATTCCACCCAACAA 512
||..||||||||..|.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||.|||
Sbjct 445 AACAGAGCACATTCAGTCAATAATCACGCGAAGCCAATGGAAATAGATGGAGAGGTTGAGATTCCATCCAGCAA 518
Query 513 AGCCACAGTCCTTCGGGGCCACGAGTCTGAGGTGTTCATTTGTGCCTGGAACCCTGTCAGTGATTTGCTAGCCT 586
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCCACAGTCCTTCGGGGCCATGAGTCTGAGGTGTTCATTTGTGCCTGGAATCCTGTCAGTGATTTGCTAGCCT 592
Query 587 CTGGATCTGGAGACTCAACTGCAAGGATATGGAACCTGAATGAGAATAGCAACGGGGGCTCCACCCAGCTCGTG 660
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCGGATCTGGAGACTCAACTGCAAGGATATGGAACCTGAATGAGAATAGCAACGGGGGCTCCACCCAGCTCGTG 666
Query 661 TTGAGACATTGTATACGAGAAGGGGGGCACGACGTCCCAAGTAATAAAGATGTCACCTCACTGGACTGGAACAG 734
|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 667 TTGAGGCACTGTATACGAGAGGGGGGCCATGACGTCCCGAGTAACAAAGACGTCACCTCACTGGACTGGAATAC 740
Query 735 TGATGGAACACTATTGGCTATGGGTTCATATGATGGTTTCGCAAGAATATGGACAGAAAATGGTAACCTGGCCA 808
..||||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 741 CAATGGAACACTCTTGGCTACGGGTTCATATGACGGTTTTGCAAGAATATGGACGGAAGATGGTAACCTGGCCA 814
Query 809 GCACCTTAGGCCAACATAAAGGCCCCATCTTCGCTCTGAAATGGAACAAAAAGGGGAATTATGTTTTGAGTGCT 882
|||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||..||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 815 GCACCTTAGGCCAACATAAAGGCCCCATCTTTGCCTTGAAATGGAACCGAAAGGGGAATTACATTTTGAGTGCT 888
Query 883 GGTGTAGACAAAACAACAATAATTTGGGATGCTCACACAGGAGAAGCCAAACAGCAGTTTCCTTTTCATTCAGC 956
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGTGTAGACAAAACAACAATAATTTGGGATGCCCACACAGGAGAAGCCAAACAGCAGTTTCCTTTTCATTCAGC 962
Query 957 CCCCGCCCTTGATGTGGACTGGCAGAACAACATGACCTTTGCCTCCTGTAGCACAGACATGTGTATCCATGTGT 1030
|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCCTGCCCTTGATGTGGACTGGCAGAACAACACGACCTTTGCCTCCTGTAGCACAGACATGTGTATCCATGTGT 1036
Query 1031 GCAGGCTCGGCTGTGACCACCCAGTCAAAACCTTCCAGGGACACACAAACGAGGTCAATGCCATCAAATGGGAT 1104
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 GCAGGCTCGGCTGTGACCGCCCAGTCAAAACCTTCCAGGGACACACAAACGAGGTCAACGCCATCAAATGGGAT 1110
Query 1105 CCTTCTGGAATGTTGCTGGCGTCCTGCTCGGATGACATGACATTGAAGATCTGGAGTATGAAGCAGGATGCATG 1178
||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|..||
Sbjct 1111 CCGTCTGGAATGTTGCTGGCATCCTGCTCGGATGACATGACATTGAAGATCTGGAGCATGAAACAGGAGGTGTG 1184
Query 1179 CGTCCACGATCTTCAGGCTCACAGCAAAGAGATCTACACCATCAAGTGGAGCCCCACCGGGCCTGCCACCAGCA 1252
|.||||.||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185 CATCCATGATCTTCAGGCTCACAATAAAGAGATCTACACCATCAAGTGGAGCCCCACTGGGCCCGCCACCAGCA 1258
Query 1253 ACCCAAACTCCAGCATCATGTTGGCAAGTGCTTCATTTGATTCTACAGTGCGACTGTGGGATGTGGAGCAAGGT 1326
||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|.||.|.|||.
Sbjct 1259 ACCCAAACTCCAACATCATGTTGGCAAGTGCTTCGTTTGATTCTACGGTGCGACTGTGGGACATAGAACGAGGC 1332
Query 1327 GTCTGCACCCACACACTCATGAAGCATCAAGAGCCTGTCTACAGTGTAGCTTTCAGCCCCGATGGAAAGTACTT 1400
||||||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1333 GTCTGCACCCACACGCTCACGAAGCATCAGGAGCCTGTCTATAGCGTAGCTTTCAGCCCTGATGGGAAGTACTT 1406
Query 1401 GGCTAGTGGATCCTTTGACAAGTATGTTCATATCTGGAATACTCAGAGTGGAAGTCTCGTCCACAGCTACCAAG 1474
|||.|||||||||||.|||||||..||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||
Sbjct 1407 GGCCAGTGGATCCTTCGACAAGTGCGTCCATATCTGGAATACTCAGAGTGGAAATCTTGTCCACAGCTACCGAG 1480
Query 1475 GCACTGGCGGTATCTTCGAGGTGTGCTGGAACGCCCGAGGAGATAAAGTGGGCGCCAGCGCGTCTGATGGCTCT 1548
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1481 GCACTGGCGGCATCTTCGAGGTGTGCTGGAACGCCCGAGGAGACAAAGTGGGTGCCAGCGCGTCCGACGGCTCT 1554
Query 1549 GTGTGTGTTCTGGATCTG------ 1566
|||||||||.||||||||
Sbjct 1555 GTGTGTGTTTTGGATCTGCGGAAG 1578