Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466084
- Subject:
- NM_020601.2
- Aligned Length:
- 1587
- Identities:
- 1359
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGAGCATAACCAGTGACGAGGTGAACTTTCTGGTTTATCGGTATCTCCAGGAGTCAGGTTTTTCTCACTCGGC 74
||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1 ATGAGCATTACCAGCGACGAGGTGAACTTTCTGGTATATCGCTACCTCCAGGAATCAGGTTTTTCCCACTCTGC 74
Query 75 TTTCACGTTTGGGATCGAGAGCCACATCAGCCAGTCCAACATCAATGGGACACTAGTGCCACCGTCTGCCCTCA 148
.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|
Sbjct 75 CTTCACGTTTGGGATCGAAAGTCACATTAGCCAGTCCAACATCAATGGTACACTAGTGCCACCGGCTGCCCTAA 148
Query 149 TCTCCATTCTCCAGAAGGGACTGCAGTATGTAGAGGCTGAGATAAGCATCAACAAGGATGGCACAGTGTTCGAC 222
||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||.||.||.
Sbjct 149 TCTCCATTCTTCAGAAAGGACTGCAGTATGTGGAGGCGGAGATCAGCATCAACGAGGATGGCACGGTATTTGAT 222
Query 223 AGCCGCCCTATAGAGTCCCTGTCCCTGATAGTTGCTGTGATTCCTGATGTGGTGCAGATGCGGCAGCAGGCATT 296
.|.||.||.||.||||||||.||..|.||.|.|||||||||.||.||||||||.||||...|.|||||.||.||
Sbjct 223 GGGCGTCCCATTGAGTCCCTATCGTTAATTGATGCTGTGATGCCCGATGTGGTACAGACAAGACAGCAAGCTTT 296
Query 297 TGGAGAGAAGCTCACTCAGCAGCAAGCCAGTGCAGCAGCCACAGAGGCATCAGCAATGGCA-----------AA 359
|.|.|||||.||..|.|||||||||||||.|||||||||..|| |||.|||||...||| ||
Sbjct 297 TCGGGAGAAACTTGCCCAGCAGCAAGCCAATGCAGCAGCTGCA---GCAGCAGCAGCTGCAGCCACAGCCACAA 367
Query 360 G----GCGGCAACCATGACCCCAGCTGCTATTTCCCAGCAAAATCCTCCAAAGAACCGAGAGGCCACAGTGAAC 429
| |||||.|| .||.|||||.|||..|.|.||||||||.||.||||||||..||||.|||||.|||||.
Sbjct 368 GCACAGCGGCTAC---AACACCAGCAGCTGCTGCTCAGCAAAACCCACCAAAGAATGGAGAAGCCACCGTGAAT 438
Query 430 GGGGAAGAGAATGGAGCACATGAAATCAATAATCACTCAAAGCCAATGGAAATAGATGGGGATGTTGAGATTCC 503
||||||||.||||||||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 439 GGGGAAGAAAATGGAGCCCATGCAATAAATAATCACTCAAAGCCAATGGAAATAGATGGAGACGTTGAAATTCC 512
Query 504 ACCCAACAAAGCCACAGTCCTTCGGGGCCACGAGTCTGAGGTGTTCATTTGTGCCTGGAACCCTGTCAGTGATT 577
|||.|..|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||..
Sbjct 513 ACCGAGTAAAGCCACAGTCCTTCGAGGCCATGAGTCTGAGGTCTTCATTTGTGCCTGGAATCCTGTTAGTGACC 586
Query 578 TGCTAGCCTCTGGATCTGGAGACTCAACTGCAAGGATATGGAACCTGAATGAGAATAGCAACGGGGGCTCCACC 651
|.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 587 TACTTGCTTCTGGATCTGGAGACTCCACTGCGAGGATATGGAACCTTAATGAGAACAGCAACGGGGGCTCCACA 660
Query 652 CAGCTCGTGTTGAGACATTGTATACGAGAAGGGGGGCACGACGTCCCAAGTAATAAAGATGTCACCTCACTGGA 725
|||||.|||.||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||||
Sbjct 661 CAGCTTGTGCTGAGGCACTGTATACGTGAAGGTGGACATGATGTTCCCAGTAATAAGGATGTCACTTCATTGGA 734
Query 726 CTGGAACAGTGATGGAACACTATTGGCTATGGGTTCATATGATGGTTTCGCAAGAATATGGACAGAAAATGGTA 799
||||||.||.|||||||||||.|||||.|..|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 735 CTGGAATAGCGATGGAACACTGTTGGCAACAGGTTCCTATGATGGTTTTGCAAGAATATGGACAGAAGATGGTA 808
Query 800 ACCTGGCCAGCACCTTAGGCCAACATAAAGGCCCCATCTTCGCTCTGAAATGGAACAAAAAGGGGAATTATGTT 873
||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||.||
Sbjct 809 ACCTAGCCAGCACCTTAGGTCAACATAAAGGTCCCATCTTTGCTTTGAAGTGGAACAAAAAGGGGAATTATATT 882
Query 874 TTGAGTGCTGGTGTAGACAAAACAACAATAATTTGGGATGCTCACACAGGAGAAGCCAAACAGCAGTTTCCTTT 947
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 883 TTGAGTGCTGGTGTAGACAAGACAACAATAATTTGGGACGCTCACACAGGAGAAGCCAAACAACAGTTTCCTTT 956
Query 948 TCATTCAGCCCCCGCCCTTGATGTGGACTGGCAGAACAACATGACCTTTGCCTCCTGTAGCACAGACATGTGTA 1021
|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 957 TCATTCAGCACCTGCCCTTGATGTGGACTGGCAGAACAACACTACCTTTGCCTCATGCAGCACAGACATGTGCA 1030
Query 1022 TCCATGTGTGCAGGCTCGGCTGTGACCACCCAGTCAAAACCTTCCAGGGACACACAAACGAGGTCAATGCCATC 1095
|.||||||||||||||.||||||||.|.||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 1031 TTCATGTGTGCAGGCTTGGCTGTGATCGCCCAGTCAAAACCTTCCAAGGACATACTAATGAGGTCAATGCTATC 1104
Query 1096 AAATGGGATCCTTCTGGAATGTTGCTGGCGTCCTGCTCGGATGACATGACATTGAAGATCTGGAGTATGAAGCA 1169
|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 AAATGGGATCCTTCTGGAATGTTACTAGCCTCCTGCTCTGATGACATGACATTAAAGATCTGGAGTATGAAGCA 1178
Query 1170 GGATGCATGCGTCCACGATCTTCAGGCTCACAGCAAAGAGATCTACACCATCAAGTGGAGCCCCACCGGGCCTG 1243
|||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|
Sbjct 1179 GGATGCATGTGTCCATGACCTCCAGGCTCACAGCAAAGAGATATATACCATCAAGTGGAGTCCCACAGGACCAG 1252
Query 1244 CCACCAGCAACCCAAACTCCAGCATCATGTTGGCAAGTGCTTCATTTGATTCTACAGTGCGACTGTGGGATGTG 1317
|||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1253 CCACCAGCAACCCGAACTCCAACATCATGTTAGCAAGTGCTTCATTTGACTCTACGGTTCGACTGTGGGATGTG 1326
Query 1318 GAGCAAGGTGTCTGCACCCACACACTCATGAAGCATCAAGAGCCTGTCTACAGTGTAGCTTTCAGCCCCGATGG 1391
||||.||||||.||||.||||||.||.|..||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1327 GAGCGAGGTGTTTGCATCCACACTCTGACCAAGCATCAGGAGCCTGTCTATAGTGTAGCGTTCAGCCCCGACGG 1400
Query 1392 AAAGTACTTGGCTAGTGGATCCTTTGACAAGTATGTTCATATCTGGAATACTCAGAGTGGAAGTCTCGTCCACA 1465
.|||||.|||||.||||||||.||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 GAAGTATTTGGCCAGTGGATCTTTTGACAAGTGTGTCCATATCTGGAATACTCAGAGTGGAAGTCTCGTCCACA 1474
Query 1466 GCTACCAAGGCACTGGCGGTATCTTCGAGGTGTGCTGGAACGCCCGAGGAGATAAAGTGGGCGCCAGCGCGTCT 1539
||||||.|||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1475 GCTACCGAGGAACAGGCGGCATATTTGAGGTGTGCTGGAATGCTCGAGGAGACAAAGTGGGTGCCAGCGCATCT 1548
Query 1540 GATGGCTCTGTGTGTGTTCTGGATCTG------ 1566
||||||||.||.||||||.|.|||||.
Sbjct 1549 GATGGCTCCGTCTGTGTTTTAGATCTCCGAAAG 1581