Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466084
• Subject: XM_017030087.1
• Aligned Length: 1620
• Identities: 1563
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ATGAGCATAACCAGTGACGAGGTGAACTTTCTGGTTTATCGGTATCTCCAGGAGTCAGGTTTTTCTCACTCGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCATAACCAGTGACGAGGTGAACTTTCTGGTTTATCGGTATCTCCAGGAGTCAGGTTTTTCTCACTCGGC  74

Query   75  TTTCACGTTTGGGATCGAGAGCCACATCAGCCAGTCCAACATCAATGGGACACTAGTGCCACCGTCTGCCCTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTTCACGTTTGGGATCGAGAGCCACATCAGCCAGTCCAACATCAATGGGACACTAGTGCCACCGTCTGCCCTCA  148

Query  149  TCTCCATTCTCCAGAAGGGACTGCAGTATGTAGAGGCTGAGATAAGCATCAACAAGGATGGCACAGTGTTCGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTCCATTCTCCAGAAGGGACTGCAGTATGTAGAGGCTGAGATAAGCATCAACAAGGATGGCACAGTGTTCGAC  222

Query  223  AGCCGCCCTATAGAGTCCCTGTCCCTGATAGTTGCTGTGATTCCTGATGTGGTGCAGATGCGGCAGCAGGCATT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCCGCCCTATAGAGTCCCTGTCCCTGATAGTTGCTGTGATTCCTGATGTGGTGCAGATGCGGCAGCAGGCATT  296

Query  297  TGGAGAGAAGCTCACTCAGCAGCAAGCCAGTGCAGCAGCCACAGAGGCATCAGCAATGGCAAAGGCGGCAACCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGAGAGAAGCTCACTCAGCAGCAAGCCAGTGCAGCAGCCACAGAGGCATCAGCAATGGCAAAGGCGGCAACCA  370

Query  371  TGACCCCAGCTGCTATTTCCCAGCAAAATCCTCCAAAGAACCGAGAGGCCACAGTGAACGGGGAAGAGAATGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGACCCCAGCTGCTATTTCCCAGCAAAATCCTCCAAAGAACCGAGAGGCCACAGTGAACGGGGAAGAGAATGGA  444

Query  445  GCACATGAAATCAATAATCACTCAAAGCCAATGGAAATAGATGGGGATGTTGAGATTCCACCCAACAAAGCCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCACATGAAATCAATAATCACTCAAAGCCAATGGAAATAGATGGGGATGTTGAGATTCCACCCAACAAAGCCAC  518

Query  519  AGTCCTTCGGGGCCACGAGTCTGAGGTGTTCATTTGTGCCTGGAACCCTGTCAGTGATTTGCTAGCCTCTGGAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTCCTTCGGGGCCACGAGTCTGAGGTGTTCATTTGTGCCTGGAACCCTGTCAGTGATTTGCTAGCCTCTGGAT  592

Query  593  CTGGAGACTCAACTGCAAGGATATGGAACCTGAATGAGAATAGCAACGGGGGCTCCACCCAGCTCGTGTTGAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGGAGACTCAACTGCAAGGATATGGAACCTGAATGAGAATAGCAACGGGGGCTCCACCCAGCTCGTGTTGAGA  666

Query  667  CATTGTATACGAGAAGGGGGGCACGACGTCCCAAGTAATAAAGATGTCACCTCACTGGACTGGAACAGTGATGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATTGTATACGAGAAGGGGGGCACGACGTCCCAAGTAATAAAGATGTCACCTCACTGGACTGGAACAGTGATGG  740

Query  741  AACACTATTGGCTATGGGTTCATATGATGGTTTCGCAAGAATATGGACAGAAAATGGTAACCTGGCCAGCACCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AACACTATTGGCTATGGGTTCATATGATGGTTTCGCAAGAATATGGACAGAAAATGGTAACCTGGCCAGCACCT  814

Query  815  TAGGCCAACATAAAGGCCCCATCTTCGCTCTGAAATGGAACAAAAAGGGGAATTATGTTTTGAGTGCTGGTGTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAGGCCAACATAAAGGCCCCATCTTCGCTCTGAAATGGAACAAAAAGGGGAATTATGTTTTGAGTGCTGGTGTA  888

Query  889  GACAAAACAACAATAATTTGGGATGCTCACACAGGAGAAGCCAAACAGCAGTTTCCTTTTCATTCAGCCCCCGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACAAAACAACAATAATTTGGGATGCTCACACAGGAGAAGCCAAACAGCAGTTTCCTTTTCATTCAGCCCCCGC  962

Query  963  CCTTGATGTGGACTGGCAGAACAACATGACCTTTGCCTCCTGTAGCACAGACATGTGTATCCATGTGTGCAGGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTTGATGTGGACTGGCAGAACAACATGACCTTTGCCTCCTGTAGCACAGACATGTGTATCCATGTGTGCAGGC  1036

Query 1037  TCGGCTGTGACCACCCAGTCAAAACCTTCCAGGGACACACAAACGAGGTCAATGCCATCAAATGGGATCCTTCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGGCTGTGACCACCCAGTCAAAACCTTCCAGGGACACACAAACGAGGTCAATGCCATCAAATGGGATCCTTCT  1110

Query 1111  GGAATGTTGCTGGCGTCCTGCTCGGATGACATGACATTGAAGATCTGGAGTATGAAGCAGGATGCATGCGTCCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGAATGTTGCTGGCGTCCTGCTCGGATGACATGACATTGAAGATCTGGAGTATGAAGCAGGATGCATGCGTCCA  1184

Query 1185  CGATCTTCAGGCTCACAGCAAAGAGATCTACACCATCAAGTGGAGCCCCACCGGGCCTGCCACCAGCAACCCAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGATCTTCAGGCTCACAGCAAAGAGATCTACACCATCAAGTGGAGCCCCACCGGGCCTGCCACCAGCAACCCAA  1258

Query 1259  ACTCCAGCATCATGTTGGCAAGTGCTTCATTTGATTCTACAGTGCGACTGTGGGATGTGGAGCAAGGTGTCTGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTCCAGCATCATGTTGGCAAGTGCTTCATTTGATTCTACAGTGCGACTGTGGGATGTGGAGCAAGGTGTCTGC  1332

Query 1333  ACCCACACACTCATGAAGCATCAAGAGCCTGTCTACAGTGTAGCTTTCAGCCCCGATGGAAAGTACTTGGCTAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCCACACACTCATGAAGCATCAAGAGCCTGTCTACAGTGTAGCTTTCAGCCCCGATGGAAAGTACTTGGCTAG  1406

Query 1407  TGGATCCTTTGACAAGTATGTTCATATCTGGAATACTCAGAGTGGAAGTCTCGTCCACAGCTACCAAGGCACTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGATCCTTTGACAAGTATGTTCATATCTGGAATACTCAGAGTGGAAGTCTCGTCCACAGCTACCAAGGCACTG  1480

Query 1481  GCGGTATCTTCGAGGTGTGCTGGAACGCCCGAGGAGATAAAGTGGGCGCCAGCGCGTCTGATGGCTCT------  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1481  GCGGTATCTTCGAGGTGTGCTGGAACGCCCGAGGAGATAAAGTGGGCGCCAGCGCGTCTGATGGCTCTGATTCA  1554

Query 1549  ------GTGTG---------TGTTCTGG-ATCTG--------------------------------  1566
                  ||.||         |||.|||| |||.|                                
Sbjct 1555  CTTGCAGTATGGATTTCAAATGTGCTGGCATCAGAACCTGAAGAGGAAAAAACAAAAATTGAACAC  1620