Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466150
• Subject: NM_009471.3
• Aligned Length: 1445
• Identities: 1207
• Gaps: 7

Alignment

Query    1  ATGGCGGTCGCTCGTGCAGCTTTGGGGCCATTGGTGACGGGTCTGTACGACGTGCAGGCTTTCAAGTTTGGGGA  74
            ||||.||||||..|...|||..||||.||.|||||.||.|..|||||.||||||||||||||||||||.|||..
Sbjct    1  ATGGAGGTCGCCAGCCAAGCCCTGGGCCCCTTGGTCACCGAGCTGTATGACGTGCAGGCTTTCAAGTTCGGGAG  74

Query   75  CTTCGTGCTGAAGAGCGGGCTTTCCTCCCCCATCTACATCGATCTGCGGGGCATCGTGTCTCGACCGCGTCTTC  148
            ||||||.||||||||||||||.||||||||..||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  CTTCGTCCTGAAGAGCGGGCTCTCCTCCCCAGTCTACATCGACCTGCGGGGCATCGTGTCACGCCCGCGTCTTC  148

Query  149  TGAGTCAGGTTGCAGATATTTTATTCCAAACTGCCCAAAATGCAGGCATCAGTTTTGACACCGTGTGTGGAGTG  222
            |.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..|||||||.||.|||||||||||||..|||||||||||.
Sbjct  149  TCAGTCAGGTCGCAGACATTTTATTCCAGACTGCAAAAAATGCGGGGATCAGTTTTGACAGTGTGTGTGGAGTT  222

Query  223  CCTTATACAGCTTTGCCATTGGCTACAGTTATCTGTTCAACCAATCAAATTCCAATGCTTATTAGAAGGAAAGA  296
            |||||||||||.||.|||.||||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct  223  CCTTATACAGCGTTACCACTGGCGACAGTTATCTGCTCAGCCAATCACATTCCCATGCTCATTAGGAGGAAGGA  296

Query  297  AACAAAGGATTATGGAACTAAGCGTCTTGTAGAAGGAACTATTAATCCAGGAGAAACCTGTTTAATCATTGAAG  370
            |||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||...||||||||.||..|.||||||.|..|||||||.|
Sbjct  297  AACAAAGGATTATGGTACCAAGCGCCTTGTAGAAGGAGAGATTAATCCGGGCCAGACCTGTCTGGTCATTGAGG  370

Query  371  ATGTTGTCACCAGTGGATCTAGTGTTTTGGAAACTGTTGAGGTTCTTCAGAAGGAGGGCTTGAAGGTCACTGAT  444
            |.||.||||||||.|||.|.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||.||||||
Sbjct  371  ACGTCGTCACCAGCGGAGCCAGTGTTTTGGAGACTGTGGAAGTTCTTCAGAAGGAGGGTCTAAAGGTAACTGAT  444

Query  445  GCCATAGTGCTGTTGGACAGAGAGCAGGGAGGCAAGGACAAGTTGCAGGCGCACGGGATCCGCCTCCACTCAGT  518
            ||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||.|.||
Sbjct  445  GCCATAGTGCTGTTGGACCGGGAGCAGGGAGGCAAGGACAAGCTGCAGGCCCAGGGGATCCGCCTCCACGCCGT  518

Query  519  GTGTACATTGTCCAAAATGCTGGAGATTCTCGAGCAGCAGAAAAAAGTTGATGCTGAGACAGTTGGGAGAGTGA  592
            |||.||..|.|||.|||||||||||||||||.||||||||.||||..|.||.|||||.|..||.||||||||||
Sbjct  519  GTGCACGCTCTCCCAAATGCTGGAGATTCTCCAGCAGCAGGAAAAGATCGACGCTGACATGGTCGGGAGAGTGA  592

Query  593  AGAGGTTTATTCAGGAGAATGTCTTTGT-GGCAGCGAATCATAATGGTTCT-CCCCTTTCTATAAAGGAAGCAC  664
            |||||||.|||||||||||.|| |||.| .|||||.||||||||.|| ||| ||||.|.||...|||.||||..
Sbjct  593  AGAGGTTCATTCAGGAGAACGT-TTTCTCAGCAGCTAATCATAACGG-TCTCCCCCCTCCTGAGAAGAAAGCGT  664

Query  665  CCAAAGAACTCAGCTTCGGTGCACGTGCAGAGCTGCCCAGGATCCACCCAGTTGCATCGAAGCTTCTCAGGCTT  738
            .|||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||..|.|.||||||..||||.||.|||||.|||.||||.
Sbjct  665  GCAAAGAACTCAGCTTTGGTGCTCGAGCTGAGCTGCCTGGAACCCACCCGCTTGCCTCAAAGCTGCTCCGGCTC  738

Query  739  ATGCAAAAGAAGGAGACCAATCTGTGTCTATCTGCTGATGTTTCACTGGCCAGAGAGCTGTTGCAGCTAGCAGA  812
            |||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||...||||||.||||||.|||||||.|||||
Sbjct  739  ATGCAGAAGAAGGAGACCAATCTGTGTCTGTCTGCCGATGTGTCGGAGGCCAGGGAGCTGCTGCAGCTCGCAGA  812

Query  813  TGCTTTAGGACCTAGTATCTGCATGCTGAAGACTCATGTAGATATTTTGAATGATTTTACTCTGGATGTGATGA  886
            .||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  813  CGCCTTGGGACCCAGCATCTGCATGCTCAAAACTCATGTCGACATTCTGAATGATTTTACTCTGGATGTGATGG  886

Query  887  AGGAGTTGATAACTCTGGCAAAATGCCATGAGTTCTTGATATTTGAAGACCGGAAGTTTGCAGATATAGGAAAC  960
            |||||||||.|.|.|||||||||.||||.||||||||.||||||||||||.||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct  887  AGGAGTTGACAGCCCTGGCAAAACGCCACGAGTTCTTAATATTTGAAGACAGGAAATTCGCTGATATTGGAAAC  960

Query  961  ACAGTGAAAAAGCAGTATGAAGGAGGTATCTTTAAAATAGCTTCCTGGGCAGATCTAGTAAATGCTCACGTGGT  1034
            |||||.|||||||||||||||.|.||.|.|||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||.||
Sbjct  961  ACAGTTAAAAAGCAGTATGAAAGTGGCACCTTTAAAATAGCTTCATGGGCAGATATAGTGAATGCTCACGTCGT  1034

Query 1035  GCCAGGCTCAGGAGTTGTGAAAGGCCTGCAAGAAGTGGGCCTGCCTTTGCATCGGGGGTGCCTCCTTATTGCGG  1108
            |||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||||||||.|||||.|..|||||.||.|||||.|
Sbjct 1035  GCCAGGCTCAGGAGTTGTGAAAGGCTTACAGGAAGTGGGTCTGCCTTTACATCGAGCCTGCCTGCTCATTGCAG  1108

Query 1109  AAATGAGCTCCACCGGCTCCCTGGCCACTGGGGACTACACTAGAGCAGCGGTTAGAATGGCTGAGGAGCACTCT  1182
            ||||||||||..|.||||||.||||||||||..|||||||.|..|||||.||..|.||||||||||||||||.|
Sbjct 1109  AAATGAGCTCTGCTGGCTCCTTGGCCACTGGAAACTACACCAAGGCAGCAGTCGGGATGGCTGAGGAGCACTGT  1182

Query 1183  GAATTTGTTGTTGGTTTTATTTCTGGCTCCCGAGTAAGCATGAAACCAGAATTTCTTCACTTGACTCCAGGAGT  1256
            ||||||||..||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1183  GAATTTGTCATTGGCTTCATTTCTGGCTCCCGAGTAAGCATGAAACCAGAGTTTCTTCACTTGACCCCAGGAGT  1256

Query 1257  TCAGTTGGAAGCAGGAGGAGATAATCTTGGCCAACAGTACAATAGCCCACAAGAAGTTATTGGCAAACGAGGTT  1330
            ||||||.|||.|||||||.|||.|.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 1257  TCAGTTAGAAACAGGAGGGGATCACCTTGGCCAGCAGTACAATAGTCCCCAAGAAGTGATCGGGAAACGCGGTT  1330

Query 1331  CCGATATCATCATTGTAGGTCGTGGCATAATCTCAGCAGCTGATCGTCTGGAAGCAGCAGAGATGTACAGAAAA  1404
            |.|||.|||||||||||||.||.||.|||.|..||||.|||.|.||.||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1331  CTGATGTCATCATTGTAGGCCGGGGAATACTTGCAGCGGCTAACCGCCTAGAAGCAGCTGAGATGTACAGGAAG  1404

Query 1405  GCTGCTTGGGAAGCGTATTTGAGTAGACTTGGTGTT---  1440
            |||||.|||||.||.|||.|||||||.||||.||||   
Sbjct 1405  GCTGCCTGGGAGGCATATCTGAGTAGGCTTGCTGTTCAG  1443