Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466325
- Subject:
- XM_006524195.2
- Aligned Length:
- 2652
- Identities:
- 2317
- Gaps:
- 33
Alignment
Query 1 ATGAACCCCGGCTTCGATTTGAGACGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG 74
||||||||.|||||||||.||...||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACCCGGGCTTCGATCTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATCCAGCGCATCGGCAGCGG 74
Query 75 CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTCAACACTGGAGAATTAGCAGCAATTAAAGTGATAAAATTGG 148
Query 149 AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT 222
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 149 AACCAGGAGAAGACTTTGCGGTTGTACAGCAAGAAATCATTATGATGAAAGACTGCAAACACCCAAACATTGTT 222
Query 223 GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 223 GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAACTTTGGATTTGCATGGAATTCTGTGGAGGTGGCTCTTTACA 296
Query 297 GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT 370
|||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 297 GGACATATATCATGTAACTGGACCCCTTTCAGAACTGCAGATTGCATATGTTAGCAGAGAAACTCTACAGGGAT 370
Query 371 TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT 444
|.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 371 TGTATTACCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACCGAGATATAAAGGGCGCTAACATTCTCCTAACGGATAATGGT 444
Query 445 CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG 518
||.||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CACGTGAAACTAGCTGATTTTGGAGTTTCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCCTTCATTGG 518
Query 519 CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT 592
.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 519 AACGCCATATTGGATGGCCCCAGAAGTCGCGGCTGTTGAGAGGAAAGGCGGGTACAATCAACTGTGTGACCTCT 592
Query 593 GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA 666
||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||
Sbjct 593 GGGCGGTGGGCATCACTGCCATCGAGCTGGCGGAGCTCCAGCCACCCATGTTTGACCTTCACCCGATGAGGGCA 666
Query 667 TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA 740
||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||.||||||||||||||.||
Sbjct 667 TTGTTTCTAATGACAAAAAGCAATTTCCAGCCTCCTAAACTAAAAGATAAGTTGAAGTGGTCAAATAGTTTCCA 740
Query 741 TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT 814
|||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.|||.|||||..|.|||||||||||.|
Sbjct 741 TCATTTTGTGAAGATGGCTCTTACCAAAAATCCAAAGAAAAGACCCAATGCAGAAAAGCTGTTACAGCATCCCT 814
Query 815 TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT 888
||||.|||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 815 TTGTCACACAGCCTCTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGTTGCTGGACAAAGTGAATAATCCAGACCATTCCACA 888
Query 889 TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA 962
|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct 889 TACCACGATTTTGATGATGATGACCCAGAGCCTCTTGTTGCCGTACCACATAGAATTCCTTCAACGAGTAGAAA 962
Query 963 CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA 1036
.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 963 TGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAAACTTTGGCCAGGTAAAATTTGATCCGCCCTTAAGGAAGGAGA 1036
Query 1037 CAGAACCACATCATGAACTTGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCA 1110
||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|...||.|||.|||||||..
Sbjct 1037 CAGAGCCACATCACGAACTTGATCTGCAACTAGAGTACGGACAAGGACACCAAAGCCATTGCTTCTTAGGTGGC 1110
Query 1111 AACAA---------------------------------GAGTCTTCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCA 1151
||||| |||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111 AACAAGAACTGTATTCTATATAACGAGTCATTGGCAAGGAGTCTTCTGAAGTCTGTTGAAGAGGAATTACATCA 1184
Query 1152 GCGAGGACACGTCGCACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATGATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAA 1225
|||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||..|||||||||
Sbjct 1185 GCGAGGACATGTGGCACACTTAGAAGATGACGAAGGCGACGATGACGACTCTAAGCATTCAACCATGAAAGCAA 1258
Query 1226 AAATTCCACCTCCTTTGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATACCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAA 1299
||.|.||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|..||||||.|||||||.|..
Sbjct 1259 AAGTCCCGCCTCCTCTGCCACCAAAGCCTAAATCCATCTTCATACCACAGGATACACATTCTGCTGAGGACGGT 1332
Query 1300 AATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGCAAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACC 1373
|||||||||||||||||||||||||||...|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333 AATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCTCATCAGGGAGCCCGGCAAAGCCATCCCACGTTCCACCTAGACCACC 1406
Query 1374 ACCTCCCAGATTACCCCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATGGAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAAC 1447
.||.|||||.|||||.|||||.||.||||.||..||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||.|
Sbjct 1407 TCCGCCCAGGTTACCGCCACAGAAGCCTGCTGTTTTAGGAAATGGAGTGAACTCCTTCCAGCTAAATGGTGAGC 1480
Query 1448 GAGATGGCTCATTATGTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTA 1521
||||.||.|||||||.|||.||.||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.
Sbjct 1481 GAGACGGATCATTATATCAGCAGCAGAGTGAGCAAAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAGGAGAAGAAGGACGTC 1554
Query 1522 CCAAAGCCTATTAGTAATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCATATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAA 1595
||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1555 CCGAAACCAATTAGTAATGGTCTTCCCCCAACACCTAAAGTGCATATGGGAGCGTGTTTTTCAAAGGTTTTTAA 1628
Query 1596 TGGGTGTCCCTTGAAAATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACCCAGATACTAGAGATCAGTACTTGATATTTG 1669
|||.||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGGATGTCCCTTGAAAATCCACTGTGCCACATCCTGGATAAACCCAGACACGAGAGACCAGTACTTGATATTTG 1702
Query 1670 GTGCCGAAGAAGGGATTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGA 1743
|.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1703 GCGCTGAAGAGGGCATTTATACCCTTAATCTCAATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTGTTCCCCCGC 1776
Query 1744 AGGTGTACATGGTTGTATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAATATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCA 1817
||||||||.|||.|||||||.||||||||||||.||||.|||.|.||.||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1777 AGGTGTACGTGGCTGTATGTGATGAACAATTGCCTGCTGTCAGTCTCGGGCAAAGCCTCTCAGCTTTACTCCCA 1850
Query 1818 TAATTTACCAGGGCTTTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGTTACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCC 1891
.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|.||.||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1851 CAACTTACCGGGGCTTTTCGATTATGCAAGACAGATGCAGAAGCTTCCAGTAGCCATCCCAGCACACAAGCTCC 1924
Query 1892 CTGACAGAATACTGCCAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATCCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGT 1965
|.|||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1925 CCGACCGAATACTGCCCAGGAAATTTGCTGTATCAGCAAAGATTCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGCTGC 1998
Query 1966 GTTGTAAGAAATCCTTACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGCACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATG 2039
||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GTGGTGAGAAATCCTTACACGGGCCATAAGTACCTGTGCGGGGCGCTTCAGACCAGCATTGTTCTATTAGAATG 2072
Query 2040 GGTTGAACCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATTTTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTG 2113
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||..|.|||||||
Sbjct 2073 GGTTGAGCCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGAGTTTCCTATGCCGTGTCCACTCCGGATGTTTG 2146
Query 2114 AAATGCTGGTAGTTCCTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTTGGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAC 2187
|.||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||.
Sbjct 2147 AGATGCTGGTGGTCCCTGAGCAGGAGTACCCTCTGGTCTGTGTTGGCGTCAGCAGAGGGCGAGACTTCAACCAA 2220
Query 2188 CGGCTTCGATTTGAGACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATGGTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAA 2261
..|.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||.|||||||.
Sbjct 2221 GTGGTTCGGTTTGAGACGGTCAATCCCAATTCTACCTCGTCGTGGTTTACAGAGTCAGATGCCCCGCAGACAAG 2294
Query 2262 TGTTACTCATGTAACCCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTATGCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATC 2335
.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2295 CGTCACTCATGTGACCCAGCTGGAGAGAGACACCATCCTTGTGTGCTTGGATTGTTGTATAAAAATAGTCAATC 2368
Query 2336 TCCAAGGAAGATTAAAATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTCACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTG 2409
||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 2369 TCCAAGGAAGGTTGAAATCCAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTCACCTTCGATTTCCAGATAGAGTCCATAGTT 2442
Query 2410 TGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCAAGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAAC 2483
||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TGTCTACAAGACAGTGTGCTAGCGTTCTGGAAACACGGGATGCAAGGTAGAAGCTTTAGATCTAATGAGGTAAC 2516
Query 2484 ACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGATCTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGC 2557
|||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||
Sbjct 2517 ACAAGAAATTTCAGATAACACAAGAATCTTCAGACTCCTTGGATCTGACAGGGTTGTGGTTTTGGAAAGTCGGC 2590
Query 2558 CAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCGGGTCATGAAAACAGTTAC 2619
|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2591 CAACTGATAACCCAACAGCAAATAGCAATTTATACATCTTGGCGGGTCACGAAAACAGCTAC 2652